19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1361 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1361  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  544  1e-154  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3331  hypothetical protein  47.81 
 
 		 301 aa  207  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6893  putative integral membrane protein  33.33 
 
 		 290 aa  79  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00257561  normal  0.329972 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1224  Type II secretion system F domain protein  34.09 
 
 		 297 aa  68.9  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0116684 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3133  type II secretion system protein  32.36 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0180053 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4969  type II secretion system protein  32.43 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4728  integral membrane protein  29.33 
 
 		 297 aa  61.6  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4456  type II secretion system protein  31.82 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.138115 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4645  type II secretion system protein  28.7 
 
 		 348 aa  58.9  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2761  type II secretion system protein  28.09 
 
 		 302 aa  53.5  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.09002  hitchhiker  0.00191545 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1735  putative integral membrane protein  29.44 
 
 		 302 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00287883  normal  0.137678 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8598  type II secretion system protein  30.52 
 
 		 291 aa  50.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12577  normal  0.345078 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3420  type II secretion system protein  30.05 
 
 		 291 aa  48.9  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1307  hypothetical protein  28.57 
 
 		 295 aa  48.9  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1542  integral membrane protein  29.28 
 
 		 299 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4032  type II secretion system protein  27.06 
 
 		 296 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.304186  hitchhiker  0.00325019 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2593  integral membrane protein  30.67 
 
 		 302 aa  46.2  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2223  type II secretion system protein  27.98 
 
 		 310 aa  43.9  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4141  type II secretion system protein  27.56 
 
 		 331 aa  43.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>