25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1542 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1542  integral membrane protein  100 
 
 		 299 aa  574  1.0000000000000001e-163  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4728  integral membrane protein  51.01 
 
 		 297 aa  251  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3133  type II secretion system protein  47.44 
 
 		 291 aa  205  6e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0180053 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4141  type II secretion system protein  47.97 
 
 		 331 aa  198  7e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2761  type II secretion system protein  44.4 
 
 		 302 aa  179  4e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.09002  hitchhiker  0.00191545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1307  hypothetical protein  44.81 
 
 		 295 aa  175  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4645  type II secretion system protein  42.8 
 
 		 348 aa  171  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8204  type II secretion system protein  48.26 
 
 		 303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480653  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1224  Type II secretion system F domain protein  38.72 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0116684 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3420  type II secretion system protein  36 
 
 		 291 aa  127  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0841  type II secretion system protein  41.36 
 
 		 289 aa  120  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0187037  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1735  putative integral membrane protein  36.56 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00287883  normal  0.137678 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4969  type II secretion system protein  37.14 
 
 		 300 aa  112  9e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4032  type II secretion system protein  38.75 
 
 		 296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.304186  hitchhiker  0.00325019 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8598  type II secretion system protein  33.47 
 
 		 291 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12577  normal  0.345078 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4456  type II secretion system protein  36.76 
 
 		 300 aa  109  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.138115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6893  putative integral membrane protein  32.47 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00257561  normal  0.329972 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2593  integral membrane protein  37.45 
 
 		 302 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0672  Type II secretion system F domain protein  42.86 
 
 		 300 aa  97.8  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2223  type II secretion system protein  32.35 
 
 		 310 aa  93.6  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3331  hypothetical protein  33.14 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1361  hypothetical protein  30.56 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1210  Type II secretion system F domain protein  28.3 
 
 		 285 aa  52.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1253  type II secretion system protein  30.3 
 
 		 284 aa  50.8  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5825  type II secretion system protein  29 
 
 		 286 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.906484  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>