25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6893 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6893  putative integral membrane protein  100 
 
 		 290 aa  572  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00257561  normal  0.329972 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1224  Type II secretion system F domain protein  42.42 
 
 		 297 aa  163  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0116684 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1735  putative integral membrane protein  41.02 
 
 		 302 aa  159  4e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00287883  normal  0.137678 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8598  type II secretion system protein  44.26 
 
 		 291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12577  normal  0.345078 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4032  type II secretion system protein  42.33 
 
 		 296 aa  139  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.304186  hitchhiker  0.00325019 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2593  integral membrane protein  40.95 
 
 		 302 aa  136  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2761  type II secretion system protein  33.81 
 
 		 302 aa  124  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.09002  hitchhiker  0.00191545 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4141  type II secretion system protein  36.49 
 
 		 331 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4728  integral membrane protein  34.48 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3420  type II secretion system protein  34.02 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1307  hypothetical protein  35.95 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3133  type II secretion system protein  30.83 
 
 		 291 aa  113  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0180053 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8204  type II secretion system protein  38.69 
 
 		 303 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4645  type II secretion system protein  33.64 
 
 		 348 aa  103  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4969  type II secretion system protein  30.3 
 
 		 300 aa  97.8  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4456  type II secretion system protein  30.36 
 
 		 300 aa  95.1  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.138115 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0672  Type II secretion system F domain protein  34.74 
 
 		 300 aa  90.9  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2223  type II secretion system protein  28.24 
 
 		 310 aa  87.4  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0841  type II secretion system protein  34.24 
 
 		 289 aa  84.7  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0187037  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1542  integral membrane protein  31.33 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1361  hypothetical protein  35.12 
 
 		 287 aa  79  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3331  hypothetical protein  28.65 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07510  Flp pilus assembly protein TadB  23.95 
 
 		 285 aa  44.7  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1650  type II secretion system protein  27.15 
 
 		 284 aa  43.9  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0624732  hitchhiker  0.00100829 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2672  type II secretion system protein  22.83 
 
 		 284 aa  43.5  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>