98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1650 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1650  type II secretion system protein  100 
 
 		 284 aa  553  1e-156  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0624732  hitchhiker  0.00100829 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1210  Type II secretion system F domain protein  60.07 
 
 		 285 aa  309  4e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2672  type II secretion system protein  51.06 
 
 		 284 aa  280  2e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2407  type II secretion system protein  50.7 
 
 		 285 aa  278  6e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485741 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5825  type II secretion system protein  60.08 
 
 		 286 aa  273  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.906484  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1236  Type II secretion system F domain protein  54.55 
 
 		 286 aa  266  2e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.952189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1032  type II secretion system protein  56.41 
 
 		 285 aa  262  4e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1253  type II secretion system protein  60.39 
 
 		 284 aa  257  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2790  type II secretion system protein  49.12 
 
 		 285 aa  256  4e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.720201  hitchhiker  0.0010112 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0780  type II secretion system protein  60.32 
 
 		 296 aa  253  3e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07510  Flp pilus assembly protein TadB  51.87 
 
 		 285 aa  252  4.0000000000000004e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20410  Flp pilus assembly protein TadB  50.79 
 
 		 290 aa  250  2e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10330  Flp pilus assembly protein TadB  49.4 
 
 		 286 aa  230  2e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00309565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1738  type II secretion system protein  62.92 
 
 		 286 aa  218  1e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0857  type II secretion system protein  53.04 
 
 		 284 aa  211  9e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.574937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3788  type II secretion system protein  49.25 
 
 		 286 aa  172  6.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.028828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  30.41 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  28.8 
 
 		 325 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3932  type II secretion system protein  25.99 
 
 		 325 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0420764  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  25.65 
 
 		 316 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3425  type II secretion system protein  25.99 
 
 		 325 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263373  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  29.51 
 
 		 324 aa  54.7  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  24.86 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0747  type II secretion system protein  22.92 
 
 		 283 aa  54.3  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.725692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  29.8 
 
 		 311 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0423  type II secretion system protein  24.27 
 
 		 327 aa  53.9  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  32.74 
 
 		 325 aa  52.8  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  24.84 
 
 		 310 aa  52.8  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3795  type II secretion system protein  24.34 
 
 		 325 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187172  normal  0.96616 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  28.65 
 
 		 325 aa  52.4  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0642  type II secretion system protein  29.68 
 
 		 287 aa  52.4  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  28.22 
 
 		 325 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  22.84 
 
 		 332 aa  52  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  21.57 
 
 		 282 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0728  type II secretion system protein  29.82 
 
 		 333 aa  51.2  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.552842  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  27.03 
 
 		 325 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  31.14 
 
 		 325 aa  50.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  27.92 
 
 		 325 aa  50.4  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1680  type II secretion system protein  27.27 
 
 		 311 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3794  type II secretion system protein  26.07 
 
 		 327 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927579  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3351  type II secretion system protein  23.98 
 
 		 335 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  23.11 
 
 		 337 aa  49.7  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  29.41 
 
 		 330 aa  50.1  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  31.4 
 
 		 323 aa  49.7  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  29.85 
 
 		 326 aa  48.9  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0709  putative type II secretion system protein F  23.53 
 
 		 283 aa  48.9  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4645  type II secretion system protein  27.92 
 
 		 348 aa  48.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  25.6 
 
 		 325 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4192  type II secretion system protein  22.27 
 
 		 335 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  21.46 
 
 		 322 aa  48.5  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2487  type II secretion system protein  26.01 
 
 		 306 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.744941  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1711  type II secretion system protein  23.95 
 
 		 318 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.806697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0710  putative type II secretion system protein F  26.04 
 
 		 287 aa  48.1  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4480  type II secretion system protein  23.71 
 
 		 335 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  27.2 
 
 		 325 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  27.2 
 
 		 325 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0746  type II secretion system protein  28.11 
 
 		 287 aa  47.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  22.27 
 
 		 328 aa  47.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2824  type II secretion system protein  25.93 
 
 		 320 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2699  type II secretion system protein  25 
 
 		 321 aa  47  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  27.49 
 
 		 325 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  23.77 
 
 		 334 aa  47  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3717  type II secretion system protein  25 
 
 		 324 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.20351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2053  type II secretion system protein  23.73 
 
 		 325 aa  46.2  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000824726  normal  0.0936478 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2455  pilus assembly protein, putative  23.96 
 
 		 330 aa  46.2  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112538  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  24.48 
 
 		 324 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0297  type II secretion system protein  24.6 
 
 		 324 aa  46.2  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3524  type II secretion system protein  24.6 
 
 		 324 aa  45.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0643  type II secretion system protein  22.39 
 
 		 283 aa  46.2  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2276  putative integral membrane protein  28.65 
 
 		 273 aa  45.8  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.846433  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  25.81 
 
 		 322 aa  45.8  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7035  putative pilus assembly protein  23.3 
 
 		 324 aa  45.8  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  25.14 
 
 		 324 aa  45.4  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  25.82 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  22.29 
 
 		 324 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4395  type II secretion system protein  31.25 
 
 		 317 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.925008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5121  type II secretion system protein  25.68 
 
 		 332 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0725578 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  24.44 
 
 		 323 aa  44.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1523  type II secretion system protein  23.66 
 
 		 328 aa  44.3  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6893  putative integral membrane protein  27.15 
 
 		 290 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00257561  normal  0.329972 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  25.26 
 
 		 290 aa  44.3  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2045  hypothetical protein  25 
 
 		 331 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0674023  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4032  type II secretion system protein  22.76 
 
 		 296 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.304186  hitchhiker  0.00325019 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  22.07 
 
 		 321 aa  43.9  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1676  Flp pilus assembly protein TadB  25 
 
 		 331 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0332  hypothetical protein  25 
 
 		 331 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.100771  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1877  type II secretion system protein  25 
 
 		 331 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.395121  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1889  type II secretion system protein  24.86 
 
 		 331 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0829  type II secretion system protein  25 
 
 		 331 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226795  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2695  type II secretion system protein  26.76 
 
 		 289 aa  43.9  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0973564  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  25.27 
 
 		 322 aa  43.5  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  27.59 
 
 		 293 aa  43.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2649  type II secretion system protein  27.46 
 
 		 310 aa  43.1  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  23.65 
 
 		 309 aa  42.7  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2412  type II secretion system protein  25.82 
 
 		 323 aa  42.7  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3795  type II secretion system protein  27.33 
 
 		 321 aa  42.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  21.46 
 
 		 282 aa  42.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4347  type II secretion system protein  21.99 
 
 		 275 aa  42.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277812  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>