72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0780 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0780  type II secretion system protein  100 
 
 		 296 aa  566  1e-160  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5825  type II secretion system protein  81.4 
 
 		 286 aa  401  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.906484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1650  type II secretion system protein  60.47 
 
 		 284 aa  282  5.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0624732  hitchhiker  0.00100829 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1210  Type II secretion system F domain protein  57.2 
 
 		 285 aa  279  5e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2672  type II secretion system protein  52.76 
 
 		 284 aa  263  3e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2790  type II secretion system protein  52.28 
 
 		 285 aa  262  6e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.720201  hitchhiker  0.0010112 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10330  Flp pilus assembly protein TadB  57.31 
 
 		 286 aa  262  6e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00309565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20410  Flp pilus assembly protein TadB  56.05 
 
 		 290 aa  254  9e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1236  Type II secretion system F domain protein  53.77 
 
 		 286 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.952189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2407  type II secretion system protein  52.07 
 
 		 285 aa  253  4.0000000000000004e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485741 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1032  type II secretion system protein  60.3 
 
 		 285 aa  246  3e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1253  type II secretion system protein  52.43 
 
 		 284 aa  241  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1738  type II secretion system protein  59.68 
 
 		 286 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07510  Flp pilus assembly protein TadB  52.65 
 
 		 285 aa  211  9e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0857  type II secretion system protein  56.42 
 
 		 284 aa  195  7e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.574937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3788  type II secretion system protein  61.93 
 
 		 286 aa  179  4.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.028828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0841  type II secretion system protein  29.45 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0187037  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  26.78 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  25 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  24.28 
 
 		 337 aa  59.3  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  27.98 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  24.89 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  25.93 
 
 		 324 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  30.18 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  24.66 
 
 		 282 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  30.86 
 
 		 323 aa  53.9  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3524  type II secretion system protein  25.83 
 
 		 324 aa  53.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3351  type II secretion system protein  23.56 
 
 		 335 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1711  type II secretion system protein  21.3 
 
 		 318 aa  52.4  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.806697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  24.2 
 
 		 282 aa  49.7  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3932  type II secretion system protein  23.12 
 
 		 325 aa  49.7  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0420764  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3425  type II secretion system protein  23.12 
 
 		 325 aa  49.7  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263373  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  28.99 
 
 		 325 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  32.52 
 
 		 325 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0423  type II secretion system protein  26.32 
 
 		 327 aa  47.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  27.55 
 
 		 325 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  24.51 
 
 		 325 aa  47  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2053  type II secretion system protein  23.12 
 
 		 325 aa  47  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000824726  normal  0.0936478 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  31.3 
 
 		 323 aa  46.6  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  26.9 
 
 		 325 aa  46.2  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4969  type II secretion system protein  30.93 
 
 		 300 aa  46.2  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2761  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 302 aa  46.2  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.09002  hitchhiker  0.00191545 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1903  type II secretion system protein  24.84 
 
 		 349 aa  45.8  0.0009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.697256 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  24.55 
 
 		 324 aa  45.8  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0881  type II secretion system protein  21.94 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7035  putative pilus assembly protein  24.47 
 
 		 324 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4456  type II secretion system protein  29.9 
 
 		 300 aa  45.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.138115 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4645  type II secretion system protein  27.62 
 
 		 348 aa  45.8  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  22.31 
 
 		 321 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2968  type II secretion system protein  30.99 
 
 		 319 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  30 
 
 		 326 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  22.69 
 
 		 309 aa  44.3  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  26.74 
 
 		 311 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2276  putative integral membrane protein  29.76 
 
 		 273 aa  44.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.846433  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1318  type II secretion system protein  30.99 
 
 		 319 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  22.36 
 
 		 324 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3093  type II secretion system protein  30.99 
 
 		 319 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3211  type II secretion system protein  23.64 
 
 		 332 aa  43.9  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.515921 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0732  transporter  24.07 
 
 		 660 aa  43.9  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  24.06 
 
 		 310 aa  43.5  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  24.88 
 
 		 290 aa  43.9  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0747  type II secretion system protein  20.59 
 
 		 283 aa  43.5  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.725692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3717  type II secretion system protein  24.05 
 
 		 324 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.20351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  20.64 
 
 		 321 aa  43.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  27.22 
 
 		 325 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1205  type II secretion system protein  20.14 
 
 		 535 aa  42.7  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.499257  hitchhiker  0.000000000038758 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  26.23 
 
 		 325 aa  42.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2276  hypothetical protein  30.28 
 
 		 296 aa  42.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  26.23 
 
 		 325 aa  42.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4141  type II secretion system protein  31.11 
 
 		 331 aa  42.4  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4032  type II secretion system protein  23.45 
 
 		 296 aa  42.4  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.304186  hitchhiker  0.00325019 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  27.01 
 
 		 293 aa  42.4  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>