70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3788 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3788  type II secretion system protein  100 
 
 		 286 aa  535  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.028828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2672  type II secretion system protein  48.93 
 
 		 284 aa  241  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1210  Type II secretion system F domain protein  52.24 
 
 		 285 aa  232  5e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2407  type II secretion system protein  47.64 
 
 		 285 aa  228  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485741 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20410  Flp pilus assembly protein TadB  48.71 
 
 		 290 aa  226  2e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5825  type II secretion system protein  52.78 
 
 		 286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.906484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10330  Flp pilus assembly protein TadB  49.44 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00309565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2790  type II secretion system protein  51.58 
 
 		 285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.720201  hitchhiker  0.0010112 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1650  type II secretion system protein  50.56 
 
 		 284 aa  211  7.999999999999999e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0624732  hitchhiker  0.00100829 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1032  type II secretion system protein  53.48 
 
 		 285 aa  209  4e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1236  Type II secretion system F domain protein  53.17 
 
 		 286 aa  202  4e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.952189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0780  type II secretion system protein  50.18 
 
 		 296 aa  195  9e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1253  type II secretion system protein  50.49 
 
 		 284 aa  189  4e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1738  type II secretion system protein  58.52 
 
 		 286 aa  187  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07510  Flp pilus assembly protein TadB  41.64 
 
 		 285 aa  171  1e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0857  type II secretion system protein  51.28 
 
 		 284 aa  168  1e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.574937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  27.78 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0747  type II secretion system protein  23.31 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.725692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3425  type II secretion system protein  26.63 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263373  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3932  type II secretion system protein  26.63 
 
 		 325 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0420764  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  21.94 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1224  Type II secretion system F domain protein  33.7 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0116684 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  26 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2275  putative integral membrane protein  28.57 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.421118  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0643  type II secretion system protein  25.77 
 
 		 283 aa  57  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  25 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  25.71 
 
 		 324 aa  55.5  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  22.34 
 
 		 337 aa  52.4  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1205  type II secretion system protein  22.44 
 
 		 535 aa  52  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.499257  hitchhiker  0.000000000038758 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2640  type II secretion system protein  25.46 
 
 		 316 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3356  type II secretion system protein  28.02 
 
 		 336 aa  51.2  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5620  type II secretion system protein  25.64 
 
 		 287 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2045  hypothetical protein  28.8 
 
 		 331 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0674023  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1711  type II secretion system protein  25.88 
 
 		 318 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.806697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1676  Flp pilus assembly protein TadB  28.8 
 
 		 331 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0332  hypothetical protein  28.8 
 
 		 331 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.100771  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1877  type II secretion system protein  28.8 
 
 		 331 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.395121  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1889  type II secretion system protein  28.8 
 
 		 331 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0829  type II secretion system protein  28.8 
 
 		 331 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226795  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  27.27 
 
 		 310 aa  50.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2455  pilus assembly protein, putative  28.8 
 
 		 330 aa  50.1  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112538  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2566  Type II secretion system F domain protein  30.48 
 
 		 306 aa  49.3  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2322  type II secretion system protein  29.65 
 
 		 312 aa  49.3  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2700  tight adherence protein TadC  29.65 
 
 		 312 aa  49.3  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2053  type II secretion system protein  25.13 
 
 		 325 aa  48.9  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000824726  normal  0.0936478 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7219  type II secretion system protein  25.64 
 
 		 287 aa  48.9  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.981655  normal  0.304711 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3421  Type II secretion system F domain protein  29.17 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  26.55 
 
 		 660 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0300  type II secretion system protein  28.22 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  24.34 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2763  type II secretion system protein  32.12 
 
 		 326 aa  47.4  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0709  putative type II secretion system protein F  25.6 
 
 		 283 aa  47  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  23.17 
 
 		 334 aa  47  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  26.8 
 
 		 282 aa  47  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  24.53 
 
 		 316 aa  46.2  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3211  type II secretion system protein  27.33 
 
 		 332 aa  46.2  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.515921 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  23.12 
 
 		 332 aa  46.2  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1524  type II secretion system protein  28.84 
 
 		 322 aa  45.8  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2117  type II secretion system protein  22.63 
 
 		 323 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215511  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1832  type II secretion system protein  26.79 
 
 		 316 aa  45.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  27.6 
 
 		 326 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  25 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  25.17 
 
 		 282 aa  43.9  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2016  type II secretion system protein  29.06 
 
 		 307 aa  43.1  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4480  type II secretion system protein  21.14 
 
 		 335 aa  42.7  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  26.35 
 
 		 325 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2069  type II secretion system protein  28.49 
 
 		 320 aa  42.7  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.807622  normal  0.805179 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2017  type II secretion system protein  27.78 
 
 		 319 aa  42.7  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0841  type II secretion system protein  27.17 
 
 		 289 aa  42.7  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0187037  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2694  type II secretion system protein  29.79 
 
 		 320 aa  42.4  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>