66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1210 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1210  Type II secretion system F domain protein  100 
 
 		 285 aa  540  9.999999999999999e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1650  type II secretion system protein  59.85 
 
 		 284 aa  304  9.000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0624732  hitchhiker  0.00100829 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2407  type II secretion system protein  53.33 
 
 		 285 aa  280  3e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485741 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5825  type II secretion system protein  57.46 
 
 		 286 aa  278  5e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.906484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2672  type II secretion system protein  52.67 
 
 		 284 aa  273  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20410  Flp pilus assembly protein TadB  54.12 
 
 		 290 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2790  type II secretion system protein  51.76 
 
 		 285 aa  253  2.0000000000000002e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.720201  hitchhiker  0.0010112 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1236  Type II secretion system F domain protein  54.04 
 
 		 286 aa  246  2e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.952189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1253  type II secretion system protein  55.08 
 
 		 284 aa  244  9e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0780  type II secretion system protein  57.41 
 
 		 296 aa  237  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10330  Flp pilus assembly protein TadB  50.18 
 
 		 286 aa  236  4e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00309565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1032  type II secretion system protein  55.68 
 
 		 285 aa  235  6e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1738  type II secretion system protein  64.61 
 
 		 286 aa  219  3e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07510  Flp pilus assembly protein TadB  55.66 
 
 		 285 aa  218  7.999999999999999e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0857  type II secretion system protein  44.03 
 
 		 284 aa  191  1e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.574937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3788  type II secretion system protein  63.28 
 
 		 286 aa  177  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.028828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  34.31 
 
 		 325 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  27.36 
 
 		 322 aa  55.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3420  type II secretion system protein  29.63 
 
 		 291 aa  53.5  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  23.68 
 
 		 332 aa  52.8  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0841  type II secretion system protein  29.64 
 
 		 289 aa  51.2  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0187037  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3932  type II secretion system protein  28.72 
 
 		 325 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0420764  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1224  Type II secretion system F domain protein  27.96 
 
 		 297 aa  50.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0116684 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  27.11 
 
 		 311 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3425  type II secretion system protein  28.72 
 
 		 325 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263373  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  25.11 
 
 		 324 aa  50.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  27.85 
 
 		 282 aa  49.7  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0747  type II secretion system protein  22.01 
 
 		 283 aa  49.7  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.725692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 325 aa  49.7  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  23.12 
 
 		 323 aa  49.3  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  25.9 
 
 		 309 aa  48.9  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  32.52 
 
 		 325 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1523  type II secretion system protein  28.72 
 
 		 328 aa  47.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3421  Type II secretion system F domain protein  26.29 
 
 		 310 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3351  type II secretion system protein  24.11 
 
 		 335 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  23.64 
 
 		 328 aa  47.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  24.62 
 
 		 337 aa  47.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2053  type II secretion system protein  26.63 
 
 		 325 aa  47  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000824726  normal  0.0936478 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2824  type II secretion system protein  27.83 
 
 		 320 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0423  type II secretion system protein  25.15 
 
 		 327 aa  47  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  34.4 
 
 		 325 aa  46.2  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0643  type II secretion system protein  23.66 
 
 		 283 aa  45.8  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  26.54 
 
 		 282 aa  45.8  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  24.3 
 
 		 322 aa  45.8  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0746  type II secretion system protein  25.68 
 
 		 287 aa  45.4  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  23.91 
 
 		 310 aa  45.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2912  type II secretion system protein  27.14 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2115  type II secretion system protein  28.29 
 
 		 279 aa  45.4  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3356  type II secretion system protein  24.51 
 
 		 336 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  25.79 
 
 		 320 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0642  type II secretion system protein  27.03 
 
 		 287 aa  44.3  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  22.67 
 
 		 324 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4032  type II secretion system protein  26.21 
 
 		 296 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.304186  hitchhiker  0.00325019 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 326 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  24.78 
 
 		 322 aa  43.9  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0805  type II secretion system protein  29.67 
 
 		 295 aa  43.5  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1205  type II secretion system protein  17.29 
 
 		 535 aa  43.1  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.499257  hitchhiker  0.000000000038758 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1680  type II secretion system protein  27.11 
 
 		 311 aa  43.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  31.3 
 
 		 323 aa  43.1  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  30.07 
 
 		 325 aa  43.1  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2649  type II secretion system protein  28.63 
 
 		 310 aa  42.7  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2308  Type II secretion system F domain protein  26.67 
 
 		 284 aa  42.4  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  26.71 
 
 		 320 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3524  type II secretion system protein  22.35 
 
 		 324 aa  42.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1042  Type II secretion system F domain protein  24.8 
 
 		 313 aa  42.4  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.205171  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  26.6 
 
 		 310 aa  42.4  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>