29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3420 on replicon NC_013531
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013531  Xcel_3420  type II secretion system protein  100 
 
 		 291 aa  552  1e-156  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0841  type II secretion system protein  59.51 
 
 		 289 aa  278  1e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0187037  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2223  type II secretion system protein  50 
 
 		 310 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3133  type II secretion system protein  39.38 
 
 		 291 aa  139  6e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0180053 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4969  type II secretion system protein  39.83 
 
 		 300 aa  135  7.000000000000001e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4456  type II secretion system protein  38.56 
 
 		 300 aa  132  6e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.138115 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0672  Type II secretion system F domain protein  46.76 
 
 		 300 aa  125  8.000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1224  Type II secretion system F domain protein  34.52 
 
 		 297 aa  122  7e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0116684 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2761  type II secretion system protein  32.51 
 
 		 302 aa  118  9e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.09002  hitchhiker  0.00191545 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4141  type II secretion system protein  38.74 
 
 		 331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1307  hypothetical protein  34.8 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6893  putative integral membrane protein  34.02 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00257561  normal  0.329972 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4032  type II secretion system protein  34.43 
 
 		 296 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.304186  hitchhiker  0.00325019 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4728  integral membrane protein  32.37 
 
 		 297 aa  102  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8598  type II secretion system protein  33.57 
 
 		 291 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12577  normal  0.345078 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1735  putative integral membrane protein  33.86 
 
 		 302 aa  102  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00287883  normal  0.137678 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1542  integral membrane protein  36 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2593  integral membrane protein  34.63 
 
 		 302 aa  92.4  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4645  type II secretion system protein  34.3 
 
 		 348 aa  86.3  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8204  type II secretion system protein  38.38 
 
 		 303 aa  82.4  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1210  Type II secretion system F domain protein  29.63 
 
 		 285 aa  53.1  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5825  type II secretion system protein  29.33 
 
 		 286 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.906484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1361  hypothetical protein  30.05 
 
 		 287 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  32.82 
 
 		 660 aa  47.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0365  type II secretion system protein  35 
 
 		 258 aa  46.6  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000784709  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  27.14 
 
 		 324 aa  44.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1331  general secretion pathway protein F  31.64 
 
 		 410 aa  44.3  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.466659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  23.24 
 
 		 310 aa  42.7  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1275  type II secretion system protein  24.29 
 
 		 327 aa  42.7  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>