54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4032 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4032  type II secretion system protein  100 
 
 		 296 aa  574  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.304186  hitchhiker  0.00325019 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2761  type II secretion system protein  38.63 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.09002  hitchhiker  0.00191545 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1735  putative integral membrane protein  44.9 
 
 		 302 aa  165  8e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00287883  normal  0.137678 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6893  putative integral membrane protein  40.87 
 
 		 290 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00257561  normal  0.329972 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1224  Type II secretion system F domain protein  39.26 
 
 		 297 aa  159  5e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0116684 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2593  integral membrane protein  42.12 
 
 		 302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8598  type II secretion system protein  39.93 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12577  normal  0.345078 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1307  hypothetical protein  40.23 
 
 		 295 aa  142  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3133  type II secretion system protein  38.55 
 
 		 291 aa  139  7.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0180053 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4141  type II secretion system protein  38.78 
 
 		 331 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8204  type II secretion system protein  42.27 
 
 		 303 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3420  type II secretion system protein  33.63 
 
 		 291 aa  124  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0841  type II secretion system protein  34.17 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0187037  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4969  type II secretion system protein  33.86 
 
 		 300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4456  type II secretion system protein  35.05 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.138115 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2223  type II secretion system protein  31.85 
 
 		 310 aa  106  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1542  integral membrane protein  36.4 
 
 		 299 aa  103  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4728  integral membrane protein  35.5 
 
 		 297 aa  101  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0672  Type II secretion system F domain protein  38.32 
 
 		 300 aa  99  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4645  type II secretion system protein  34.08 
 
 		 348 aa  92.8  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1253  type II secretion system protein  28.5 
 
 		 284 aa  66.6  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3331  hypothetical protein  29.35 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2672  type II secretion system protein  23.86 
 
 		 284 aa  57  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5825  type II secretion system protein  25.53 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.906484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1361  hypothetical protein  26.9 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2407  type II secretion system protein  26.45 
 
 		 285 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485741 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2117  type II secretion system protein  27.44 
 
 		 323 aa  52.4  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215511  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3351  type II secretion system protein  26.62 
 
 		 335 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0603  type II secretion system protein  25.78 
 
 		 338 aa  50.8  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  26.29 
 
 		 660 aa  50.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2053  type II secretion system protein  27.47 
 
 		 325 aa  50.4  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000824726  normal  0.0936478 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  25.58 
 
 		 323 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3425  type II secretion system protein  25.27 
 
 		 325 aa  49.3  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263373  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3932  type II secretion system protein  25.27 
 
 		 325 aa  49.3  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0420764  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1210  Type II secretion system F domain protein  25.14 
 
 		 285 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1650  type II secretion system protein  22.35 
 
 		 284 aa  47.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0624732  hitchhiker  0.00100829 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  25 
 
 		 309 aa  47  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1032  type II secretion system protein  29.33 
 
 		 285 aa  47  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3421  Type II secretion system F domain protein  26.7 
 
 		 310 aa  47  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2115  type II secretion system protein  27.59 
 
 		 279 aa  46.6  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  25.1 
 
 		 310 aa  46.2  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0881  type II secretion system protein  27.61 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  26.07 
 
 		 282 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10330  Flp pilus assembly protein TadB  26.06 
 
 		 286 aa  44.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00309565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  25.9 
 
 		 325 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  25 
 
 		 325 aa  43.9  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1042  Type II secretion system F domain protein  30.67 
 
 		 313 aa  43.5  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.205171  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  25 
 
 		 324 aa  43.5  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2824  type II secretion system protein  24.46 
 
 		 320 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2114  type II secretion system protein  25.75 
 
 		 288 aa  43.1  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1711  type II secretion system protein  24.8 
 
 		 318 aa  42.7  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.806697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  23.39 
 
 		 332 aa  42.4  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0845  type II secretion system protein  22.89 
 
 		 293 aa  42.4  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  25.14 
 
 		 310 aa  42.4  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>