43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4645 on replicon NC_009806
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009806  Krad_4645  type II secretion system protein  100 
 
 		 348 aa  676    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3133  type II secretion system protein  45.22 
 
 		 291 aa  213  4.9999999999999996e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0180053 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2761  type II secretion system protein  42.81 
 
 		 302 aa  194  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.09002  hitchhiker  0.00191545 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4141  type II secretion system protein  42.8 
 
 		 331 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8204  type II secretion system protein  47.26 
 
 		 303 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1307  hypothetical protein  43.53 
 
 		 295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1542  integral membrane protein  42.8 
 
 		 299 aa  157  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1735  putative integral membrane protein  39.71 
 
 		 302 aa  145  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00287883  normal  0.137678 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1224  Type II secretion system F domain protein  35.66 
 
 		 297 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0116684 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4728  integral membrane protein  36.32 
 
 		 297 aa  135  9e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2593  integral membrane protein  39.62 
 
 		 302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3420  type II secretion system protein  36.44 
 
 		 291 aa  122  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4456  type II secretion system protein  36.55 
 
 		 300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.138115 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4969  type II secretion system protein  37.25 
 
 		 300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0841  type II secretion system protein  36.23 
 
 		 289 aa  116  6e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0187037  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6893  putative integral membrane protein  31.77 
 
 		 290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00257561  normal  0.329972 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8598  type II secretion system protein  33.94 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12577  normal  0.345078 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2223  type II secretion system protein  32.82 
 
 		 310 aa  105  8e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4032  type II secretion system protein  32.19 
 
 		 296 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.304186  hitchhiker  0.00325019 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0672  Type II secretion system F domain protein  37.04 
 
 		 300 aa  72.4  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1361  hypothetical protein  29.09 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3331  hypothetical protein  28.24 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10330  Flp pilus assembly protein TadB  28.71 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00309565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  26.37 
 
 		 336 aa  53.9  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2672  type II secretion system protein  30.82 
 
 		 284 aa  53.9  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0857  type II secretion system protein  29.45 
 
 		 284 aa  53.1  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.574937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2407  type II secretion system protein  27.94 
 
 		 285 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485741 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3421  Type II secretion system F domain protein  23.76 
 
 		 310 aa  50.1  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1650  type II secretion system protein  26.23 
 
 		 284 aa  49.7  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0624732  hitchhiker  0.00100829 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2323  type II secretion system protein  24.63 
 
 		 313 aa  48.5  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2701  tight adherence protein TadB, putative  24.63 
 
 		 313 aa  48.5  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.938711  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5825  type II secretion system protein  27.4 
 
 		 286 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.906484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  25.53 
 
 		 282 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07510  Flp pilus assembly protein TadB  31.91 
 
 		 285 aa  47.8  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3657  type II secretion system protein, pilus assembly, transmembrane part  27.59 
 
 		 309 aa  47.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1032  type II secretion system protein  33.01 
 
 		 285 aa  47.4  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1210  Type II secretion system F domain protein  28.99 
 
 		 285 aa  47.4  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0780  type II secretion system protein  29.37 
 
 		 296 aa  46.6  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2069  type II secretion system protein  27.84 
 
 		 320 aa  45.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.807622  normal  0.805179 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2053  type II secretion system protein  27.72 
 
 		 325 aa  43.9  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000824726  normal  0.0936478 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1446  type II secretion system protein  26.84 
 
 		 330 aa  43.5  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  26.09 
 
 		 323 aa  42.7  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2158  type II secretion system protein  27.46 
 
 		 312 aa  42.7  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  0.0329173 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>