96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0857 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0857  type II secretion system protein  100 
 
 		 284 aa  548  1e-155  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.574937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2672  type II secretion system protein  47.89 
 
 		 284 aa  264  1e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2407  type II secretion system protein  47.18 
 
 		 285 aa  256  2e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485741 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1236  Type II secretion system F domain protein  51.05 
 
 		 286 aa  246  3e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.952189  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2790  type II secretion system protein  48.42 
 
 		 285 aa  245  6.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.720201  hitchhiker  0.0010112 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20410  Flp pilus assembly protein TadB  46.76 
 
 		 290 aa  242  6e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1650  type II secretion system protein  51.48 
 
 		 284 aa  239  4e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0624732  hitchhiker  0.00100829 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1032  type II secretion system protein  64.25 
 
 		 285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10330  Flp pilus assembly protein TadB  46.49 
 
 		 286 aa  231  1e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00309565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5825  type II secretion system protein  50 
 
 		 286 aa  224  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.906484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1210  Type II secretion system F domain protein  44.03 
 
 		 285 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1253  type II secretion system protein  47.52 
 
 		 284 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07510  Flp pilus assembly protein TadB  45.19 
 
 		 285 aa  210  3e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1738  type II secretion system protein  51.01 
 
 		 286 aa  207  1e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0780  type II secretion system protein  46.77 
 
 		 296 aa  199  3e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3788  type II secretion system protein  52.84 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.028828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  29.3 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  22.81 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  24.5 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  26.11 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1205  type II secretion system protein  21.37 
 
 		 535 aa  58.9  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.499257  hitchhiker  0.000000000038758 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  25.25 
 
 		 322 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3932  type II secretion system protein  27.03 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0420764  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2053  type II secretion system protein  25.41 
 
 		 325 aa  57  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000824726  normal  0.0936478 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3425  type II secretion system protein  26.58 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263373  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  25 
 
 		 336 aa  55.8  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1711  type II secretion system protein  24.35 
 
 		 318 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.806697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0603  type II secretion system protein  24.41 
 
 		 338 aa  52.8  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0747  type II secretion system protein  24.79 
 
 		 283 aa  52  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.725692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  25.15 
 
 		 322 aa  51.2  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  23.17 
 
 		 326 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0643  type II secretion system protein  24.79 
 
 		 283 aa  50.8  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0829  type II secretion system protein  27.95 
 
 		 331 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226795  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4347  type II secretion system protein  26.47 
 
 		 275 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  24.49 
 
 		 325 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1889  type II secretion system protein  27.95 
 
 		 331 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1877  type II secretion system protein  27.95 
 
 		 331 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.395121  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0332  hypothetical protein  27.95 
 
 		 331 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.100771  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1676  Flp pilus assembly protein TadB  27.95 
 
 		 331 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2045  hypothetical protein  27.95 
 
 		 331 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0674023  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  24.58 
 
 		 325 aa  50.4  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2117  type II secretion system protein  21.62 
 
 		 323 aa  50.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215511  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1832  type II secretion system protein  26.01 
 
 		 316 aa  50.4  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  27.78 
 
 		 324 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  25.15 
 
 		 324 aa  49.7  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  26.32 
 
 		 309 aa  49.3  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4969  type II secretion system protein  27.39 
 
 		 300 aa  49.7  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3795  type II secretion system protein  26.02 
 
 		 325 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187172  normal  0.96616 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4456  type II secretion system protein  26.75 
 
 		 300 aa  49.3  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.138115 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1523  type II secretion system protein  23.16 
 
 		 328 aa  48.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2484  type II secretion system protein  25.31 
 
 		 323 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2455  pilus assembly protein, putative  27.92 
 
 		 330 aa  48.9  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112538  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6893  putative integral membrane protein  29.3 
 
 		 290 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00257561  normal  0.329972 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2707  type II secretion system protein  25.31 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  24.39 
 
 		 324 aa  48.5  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  24.04 
 
 		 320 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2412  type II secretion system protein  25.34 
 
 		 323 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4395  type II secretion system protein  25.41 
 
 		 317 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.925008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3717  type II secretion system protein  25.58 
 
 		 324 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.20351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4645  type II secretion system protein  29.69 
 
 		 348 aa  47.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  24.87 
 
 		 320 aa  47.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5121  type II secretion system protein  23.5 
 
 		 332 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0725578 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7035  putative pilus assembly protein  27.1 
 
 		 324 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0709  putative type II secretion system protein F  22.94 
 
 		 283 aa  47.4  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2308  Type II secretion system F domain protein  25.14 
 
 		 284 aa  47  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  25.81 
 
 		 324 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  24.32 
 
 		 282 aa  47  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2115  type II secretion system protein  24.04 
 
 		 279 aa  46.6  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3794  type II secretion system protein  24.1 
 
 		 327 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927579  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4189  type II secretion system protein  23.89 
 
 		 325 aa  46.2  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.54214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  23.18 
 
 		 325 aa  46.2  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0297  type II secretion system protein  25.3 
 
 		 324 aa  46.2  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  27.34 
 
 		 322 aa  45.8  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3421  Type II secretion system F domain protein  28.05 
 
 		 310 aa  45.8  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  24.14 
 
 		 325 aa  45.8  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1224  Type II secretion system F domain protein  26.52 
 
 		 297 aa  45.8  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0116684 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  22.5 
 
 		 325 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  25.66 
 
 		 282 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3524  type II secretion system protein  22.9 
 
 		 324 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3356  type II secretion system protein  23.5 
 
 		 336 aa  45.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2695  type II secretion system protein  29.25 
 
 		 289 aa  44.3  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0973564  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2364  hypothetical protein  23.65 
 
 		 321 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.288668  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  25.5 
 
 		 325 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  25.19 
 
 		 320 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  24.69 
 
 		 325 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  23 
 
 		 321 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0301  type II secretion system protein  25.37 
 
 		 322 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2571  type II secretion system protein  29.26 
 
 		 303 aa  43.1  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  26.05 
 
 		 325 aa  42.7  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2761  type II secretion system protein  28.48 
 
 		 302 aa  42.7  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.09002  hitchhiker  0.00191545 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  26.06 
 
 		 325 aa  42.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1275  type II secretion system protein  23.93 
 
 		 327 aa  42.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2824  type II secretion system protein  24.42 
 
 		 320 aa  42.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  22.52 
 
 		 325 aa  42.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1681  type II secretion system protein  23.93 
 
 		 327 aa  42.4  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0423  type II secretion system protein  25.56 
 
 		 327 aa  42.4  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>