97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2790 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2790  type II secretion system protein  100 
 
 		 285 aa  548  1e-155  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.720201  hitchhiker  0.0010112 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2672  type II secretion system protein  54.01 
 
 		 284 aa  283  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1236  Type II secretion system F domain protein  58.39 
 
 		 286 aa  276  2e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.952189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20410  Flp pilus assembly protein TadB  53.2 
 
 		 290 aa  262  4e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2407  type II secretion system protein  52.63 
 
 		 285 aa  261  8e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485741 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1210  Type II secretion system F domain protein  52.27 
 
 		 285 aa  258  7e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1253  type II secretion system protein  54.74 
 
 		 284 aa  254  9e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1650  type II secretion system protein  50 
 
 		 284 aa  252  5.000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0624732  hitchhiker  0.00100829 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10330  Flp pilus assembly protein TadB  53.33 
 
 		 286 aa  251  1e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00309565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1032  type II secretion system protein  59.11 
 
 		 285 aa  248  7e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5825  type II secretion system protein  51.52 
 
 		 286 aa  243  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.906484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0780  type II secretion system protein  54.24 
 
 		 296 aa  224  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07510  Flp pilus assembly protein TadB  49.08 
 
 		 285 aa  223  2e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1738  type II secretion system protein  58.33 
 
 		 286 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0857  type II secretion system protein  48.33 
 
 		 284 aa  206  3e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.574937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3788  type II secretion system protein  51.48 
 
 		 286 aa  171  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.028828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  29.18 
 
 		 324 aa  58.9  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  24.12 
 
 		 323 aa  55.8  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  24.65 
 
 		 310 aa  55.5  0.0000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0249  type II secretion system protein  27.23 
 
 		 313 aa  55.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3794  type II secretion system protein  29.57 
 
 		 327 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927579  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1831  type II secretion system protein  28.64 
 
 		 304 aa  53.1  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5121  type II secretion system protein  26.32 
 
 		 332 aa  53.1  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0725578 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3208  type II secretion system protein  29.8 
 
 		 302 aa  52.4  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.544767 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  22.47 
 
 		 328 aa  51.6  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  22.94 
 
 		 321 aa  51.2  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4969  type II secretion system protein  26.52 
 
 		 300 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0747  type II secretion system protein  21.99 
 
 		 283 aa  51.6  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.725692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  27.68 
 
 		 325 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3351  type II secretion system protein  23.7 
 
 		 335 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1711  type II secretion system protein  23.35 
 
 		 318 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.806697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4456  type II secretion system protein  25.6 
 
 		 300 aa  50.8  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.138115 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1681  type II secretion system protein  21.47 
 
 		 327 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3524  type II secretion system protein  27.39 
 
 		 324 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0643  type II secretion system protein  25.4 
 
 		 283 aa  50.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2696  type II secretion system protein  34.17 
 
 		 301 aa  49.7  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0581937  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1275  type II secretion system protein  21.47 
 
 		 327 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  27.71 
 
 		 324 aa  49.7  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  24.44 
 
 		 337 aa  49.3  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2571  type II secretion system protein  27.84 
 
 		 303 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  25.33 
 
 		 660 aa  48.9  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3932  type II secretion system protein  24.47 
 
 		 325 aa  49.3  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0420764  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  29.07 
 
 		 323 aa  48.9  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3425  type II secretion system protein  24.47 
 
 		 325 aa  48.9  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263373  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  29.11 
 
 		 326 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3795  type II secretion system protein  28.19 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  24.18 
 
 		 332 aa  48.1  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  24.24 
 
 		 282 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1205  type II secretion system protein  18.78 
 
 		 535 aa  48.1  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.499257  hitchhiker  0.000000000038758 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7035  putative pilus assembly protein  27.75 
 
 		 324 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  25.29 
 
 		 324 aa  48.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0603  type II secretion system protein  24.55 
 
 		 338 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  26.28 
 
 		 325 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3211  type II secretion system protein  23.04 
 
 		 332 aa  47.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.515921 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1053  type II secretion system protein  28.79 
 
 		 302 aa  47.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  25.7 
 
 		 324 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  26.47 
 
 		 324 aa  47  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1832  type II secretion system protein  27.08 
 
 		 316 aa  46.6  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0297  type II secretion system protein  26.26 
 
 		 324 aa  46.6  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0709  putative type II secretion system protein F  24.77 
 
 		 283 aa  46.2  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1813  type II secretion system protein  29.23 
 
 		 426 aa  46.2  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00328504  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2053  type II secretion system protein  26.96 
 
 		 325 aa  45.8  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000824726  normal  0.0936478 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  26.34 
 
 		 330 aa  45.8  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  26.29 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  27.04 
 
 		 325 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2870  guanine deaminase  29.41 
 
 		 435 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.153116 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  27.27 
 
 		 282 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0841  type II secretion system protein  24.58 
 
 		 289 aa  44.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0187037  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  30.37 
 
 		 323 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2275  putative integral membrane protein  25.84 
 
 		 310 aa  44.3  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.421118  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0728  type II secretion system protein  30.43 
 
 		 333 aa  44.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.552842  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3717  type II secretion system protein  27.16 
 
 		 324 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.20351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  26.04 
 
 		 320 aa  43.9  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2763  type II secretion system protein  28.97 
 
 		 326 aa  43.9  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2379  type II secretion system protein  24.8 
 
 		 321 aa  44.3  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306938  normal  0.924554 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  25.23 
 
 		 311 aa  43.9  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  25.11 
 
 		 337 aa  43.5  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3420  type II secretion system protein  26.91 
 
 		 291 aa  43.5  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  21.33 
 
 		 309 aa  43.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2911  type II secretion system protein  27.89 
 
 		 306 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.604096  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2380  type II secretion system protein  24.46 
 
 		 322 aa  43.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.316858  normal  0.875213 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  24.58 
 
 		 310 aa  43.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1159  Type II secretion system F domain protein  26.72 
 
 		 320 aa  43.1  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  26.98 
 
 		 311 aa  43.1  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  30.71 
 
 		 314 aa  43.1  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0653  TadC protein  23.9 
 
 		 313 aa  42.7  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1530  type II secretion system protein  27.17 
 
 		 301 aa  42.7  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7218  type II secretion system protein  23.74 
 
 		 300 aa  42.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.329226 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1676  Flp pilus assembly protein TadB  26.11 
 
 		 331 aa  42.4  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0332  hypothetical protein  26.11 
 
 		 331 aa  42.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.100771  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  30.16 
 
 		 323 aa  42.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1877  type II secretion system protein  26.11 
 
 		 331 aa  42.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.395121  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2045  hypothetical protein  26.11 
 
 		 331 aa  42.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0674023  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0829  type II secretion system protein  26.11 
 
 		 331 aa  42.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226795  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4347  type II secretion system protein  23.63 
 
 		 275 aa  42.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0805  type II secretion system protein  25.58 
 
 		 295 aa  42.4  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1889  type II secretion system protein  26.11 
 
 		 331 aa  42  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>