83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_20410 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_20410  Flp pilus assembly protein TadB  100 
 
 		 290 aa  558  1e-158  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2672  type II secretion system protein  54.74 
 
 		 284 aa  289  5.0000000000000004e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2407  type II secretion system protein  55.59 
 
 		 285 aa  288  7e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485741 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2790  type II secretion system protein  50 
 
 		 285 aa  255  5e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.720201  hitchhiker  0.0010112 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1210  Type II secretion system F domain protein  54.12 
 
 		 285 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1650  type II secretion system protein  50.79 
 
 		 284 aa  249  3e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0624732  hitchhiker  0.00100829 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10330  Flp pilus assembly protein TadB  51.82 
 
 		 286 aa  249  3e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00309565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1032  type II secretion system protein  52.9 
 
 		 285 aa  247  1e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1236  Type II secretion system F domain protein  55.6 
 
 		 286 aa  241  1e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.952189  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07510  Flp pilus assembly protein TadB  50.92 
 
 		 285 aa  240  2e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5825  type II secretion system protein  52.61 
 
 		 286 aa  238  6.999999999999999e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.906484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1253  type II secretion system protein  55.83 
 
 		 284 aa  236  3e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1738  type II secretion system protein  61.8 
 
 		 286 aa  222  6e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0780  type II secretion system protein  54.47 
 
 		 296 aa  221  9e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0857  type II secretion system protein  56.63 
 
 		 284 aa  214  1.9999999999999998e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.574937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3788  type II secretion system protein  48.18 
 
 		 286 aa  175  8e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.028828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1205  type II secretion system protein  23.47 
 
 		 535 aa  60.8  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.499257  hitchhiker  0.000000000038758 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  26.29 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  26.6 
 
 		 322 aa  54.3  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3425  type II secretion system protein  24.88 
 
 		 325 aa  53.5  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263373  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  29.81 
 
 		 323 aa  53.5  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3932  type II secretion system protein  24.88 
 
 		 325 aa  52.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0420764  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  29.73 
 
 		 290 aa  52.8  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1711  type II secretion system protein  22.49 
 
 		 318 aa  52.8  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.806697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  24.63 
 
 		 332 aa  52  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  25.89 
 
 		 337 aa  52  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3351  type II secretion system protein  27.53 
 
 		 335 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1275  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 327 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1681  type II secretion system protein  27.82 
 
 		 327 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  28.07 
 
 		 326 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  27.03 
 
 		 310 aa  50.1  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  24 
 
 		 328 aa  49.7  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  23.24 
 
 		 336 aa  49.7  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  33.83 
 
 		 325 aa  49.3  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0423  type II secretion system protein  27.49 
 
 		 327 aa  49.3  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  28.78 
 
 		 324 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0747  type II secretion system protein  21.58 
 
 		 283 aa  48.1  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.725692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  23 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  30.22 
 
 		 325 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  31.5 
 
 		 325 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0297  type II secretion system protein  31.25 
 
 		 324 aa  47  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  27.39 
 
 		 322 aa  46.2  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  35.34 
 
 		 325 aa  46.2  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  29.84 
 
 		 320 aa  45.8  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2486  type II secretion system protein  26.46 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.766494  hitchhiker  0.000200331 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1042  Type II secretion system F domain protein  26.71 
 
 		 313 aa  45.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.205171  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2824  type II secretion system protein  27.1 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  26.74 
 
 		 660 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  26.22 
 
 		 324 aa  45.4  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7035  putative pilus assembly protein  28.25 
 
 		 324 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20340  Flp pilus assembly protein TadB  28.47 
 
 		 332 aa  45.4  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.396755  normal  0.127493 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0643  type II secretion system protein  21.71 
 
 		 283 aa  45.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2412  type II secretion system protein  27.21 
 
 		 323 aa  44.3  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  29.1 
 
 		 323 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  28.48 
 
 		 324 aa  44.3  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2455  pilus assembly protein, putative  24.28 
 
 		 330 aa  44.3  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112538  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3795  type II secretion system protein  25.57 
 
 		 325 aa  43.9  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187172  normal  0.96616 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4395  type II secretion system protein  28.66 
 
 		 317 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.925008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  32.52 
 
 		 325 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4619  type II secretion system protein  28.78 
 
 		 318 aa  43.5  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340215 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3524  type II secretion system protein  25.76 
 
 		 324 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0881  type II secretion system protein  22.83 
 
 		 296 aa  43.5  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  28 
 
 		 324 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2115  type II secretion system protein  26.53 
 
 		 279 aa  43.1  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3211  type II secretion system protein  25.16 
 
 		 332 aa  43.1  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.515921 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3717  type II secretion system protein  28.67 
 
 		 324 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.20351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  26.95 
 
 		 323 aa  43.1  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1889  type II secretion system protein  23.84 
 
 		 331 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1530  type II secretion system protein  28.25 
 
 		 301 aa  42.7  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0829  type II secretion system protein  23.84 
 
 		 331 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226795  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2045  hypothetical protein  23.84 
 
 		 331 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0674023  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5620  type II secretion system protein  24.79 
 
 		 287 aa  42.7  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1676  Flp pilus assembly protein TadB  23.84 
 
 		 331 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1831  type II secretion system protein  29.22 
 
 		 304 aa  42.7  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0332  hypothetical protein  23.84 
 
 		 331 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.100771  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3356  type II secretion system protein  26 
 
 		 336 aa  42.7  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1877  type II secretion system protein  23.84 
 
 		 331 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.395121  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0642  type II secretion system protein  27.75 
 
 		 287 aa  42.4  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  28.23 
 
 		 320 aa  42.4  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0249  type II secretion system protein  27.22 
 
 		 313 aa  42.4  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2695  type II secretion system protein  29.27 
 
 		 289 aa  42.4  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0973564  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1524  type II secretion system protein  26.15 
 
 		 322 aa  42.4  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  26.38 
 
 		 282 aa  42.4  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>