120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1738 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1738  type II secretion system protein  100 
 
 		 286 aa  550  1e-155  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2407  type II secretion system protein  52.25 
 
 		 285 aa  280  2e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485741 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2672  type II secretion system protein  51.75 
 
 		 284 aa  277  1e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1236  Type II secretion system F domain protein  54.9 
 
 		 286 aa  269  4e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.952189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1210  Type II secretion system F domain protein  55.3 
 
 		 285 aa  255  5e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5825  type II secretion system protein  58.73 
 
 		 286 aa  254  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.906484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1650  type II secretion system protein  52.33 
 
 		 284 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0624732  hitchhiker  0.00100829 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20410  Flp pilus assembly protein TadB  51.33 
 
 		 290 aa  251  1e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2790  type II secretion system protein  55.56 
 
 		 285 aa  250  2e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.720201  hitchhiker  0.0010112 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1253  type II secretion system protein  53.01 
 
 		 284 aa  246  3e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1032  type II secretion system protein  61.92 
 
 		 285 aa  245  4.9999999999999997e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0780  type II secretion system protein  58.5 
 
 		 296 aa  240  2e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10330  Flp pilus assembly protein TadB  51.89 
 
 		 286 aa  235  7e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00309565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07510  Flp pilus assembly protein TadB  52.11 
 
 		 285 aa  235  7e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0857  type II secretion system protein  57.14 
 
 		 284 aa  204  1e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.574937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3788  type II secretion system protein  58.52 
 
 		 286 aa  163  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.028828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3425  type II secretion system protein  28.72 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263373  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3932  type II secretion system protein  28.72 
 
 		 325 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0420764  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  28.65 
 
 		 324 aa  62.4  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2053  type II secretion system protein  27.47 
 
 		 325 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000824726  normal  0.0936478 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1711  type II secretion system protein  25 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.806697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  22.65 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  28.76 
 
 		 325 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  28.04 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0643  type II secretion system protein  24.16 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  21.43 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3351  type II secretion system protein  22.48 
 
 		 335 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  23.65 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  25.21 
 
 		 330 aa  57  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  31.22 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6893  putative integral membrane protein  28.2 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00257561  normal  0.329972 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0423  type II secretion system protein  25.26 
 
 		 327 aa  55.8  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  20.47 
 
 		 328 aa  55.8  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  24.29 
 
 		 326 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  23.92 
 
 		 321 aa  55.8  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  26.51 
 
 		 325 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2045  hypothetical protein  26.19 
 
 		 331 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0674023  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  27.45 
 
 		 325 aa  55.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  30.95 
 
 		 322 aa  55.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  24.57 
 
 		 316 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1676  Flp pilus assembly protein TadB  26.19 
 
 		 331 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0332  hypothetical protein  26.19 
 
 		 331 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.100771  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1877  type II secretion system protein  26.19 
 
 		 331 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.395121  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1889  type II secretion system protein  26.19 
 
 		 331 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0829  type II secretion system protein  26.19 
 
 		 331 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226795  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  22.77 
 
 		 324 aa  55.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1205  type II secretion system protein  19.52 
 
 		 535 aa  55.5  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.499257  hitchhiker  0.000000000038758 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3211  type II secretion system protein  27.03 
 
 		 332 aa  55.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.515921 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  20.91 
 
 		 321 aa  54.3  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1275  type II secretion system protein  23.47 
 
 		 327 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1681  type II secretion system protein  23.96 
 
 		 327 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2275  putative integral membrane protein  26.9 
 
 		 310 aa  53.5  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.421118  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  28.04 
 
 		 320 aa  53.9  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0747  type II secretion system protein  22.82 
 
 		 283 aa  53.5  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.725692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2640  type II secretion system protein  22.36 
 
 		 316 aa  53.1  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  23.94 
 
 		 324 aa  53.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  23.29 
 
 		 321 aa  53.1  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2117  type II secretion system protein  20.11 
 
 		 323 aa  53.1  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215511  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  25.37 
 
 		 336 aa  53.1  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2364  hypothetical protein  26.15 
 
 		 321 aa  53.1  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.288668  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  25.27 
 
 		 325 aa  52.8  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  23.26 
 
 		 309 aa  52.8  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  21.49 
 
 		 337 aa  52.4  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2737  type II secretion system protein  26.02 
 
 		 321 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  26.67 
 
 		 325 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  22.58 
 
 		 282 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2455  pilus assembly protein, putative  25.49 
 
 		 330 aa  50.4  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112538  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0709  putative type II secretion system protein F  25.95 
 
 		 283 aa  50.8  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7219  type II secretion system protein  24.69 
 
 		 287 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.981655  normal  0.304711 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2276  putative integral membrane protein  28.74 
 
 		 273 aa  50.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.846433  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4347  type II secretion system protein  24.59 
 
 		 275 aa  49.7  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  25.14 
 
 		 325 aa  49.7  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0805  type II secretion system protein  28.48 
 
 		 295 aa  49.7  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5620  type II secretion system protein  25.1 
 
 		 287 aa  49.3  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3421  Type II secretion system F domain protein  27.65 
 
 		 310 aa  48.9  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1042  Type II secretion system F domain protein  25.13 
 
 		 313 aa  48.9  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.205171  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  27.86 
 
 		 325 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  27.11 
 
 		 293 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  26.42 
 
 		 322 aa  47.4  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  22.58 
 
 		 282 aa  47.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  26.19 
 
 		 325 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  26.19 
 
 		 325 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  24.27 
 
 		 311 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0249  type II secretion system protein  28.3 
 
 		 313 aa  47  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0297  type II secretion system protein  24.73 
 
 		 324 aa  46.6  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  28.14 
 
 		 325 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  28.14 
 
 		 325 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  28.14 
 
 		 325 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2380  type II secretion system protein  28.07 
 
 		 322 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.316858  normal  0.875213 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1832  type II secretion system protein  25.15 
 
 		 316 aa  46.6  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  31.14 
 
 		 323 aa  46.2  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  28.71 
 
 		 323 aa  46.2  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2831  type II secretion system protein  26.35 
 
 		 322 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532359  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  28.8 
 
 		 325 aa  45.8  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  24.57 
 
 		 324 aa  45.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  27.27 
 
 		 325 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0710  putative type II secretion system protein F  25.58 
 
 		 287 aa  45.4  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7035  putative pilus assembly protein  25 
 
 		 324 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1903  type II secretion system protein  24.66 
 
 		 349 aa  45.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.697256 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  25.93 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>