104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1236 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1236  Type II secretion system F domain protein  100 
 
 		 286 aa  541  1e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.952189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1032  type II secretion system protein  66.67 
 
 		 285 aa  296  2e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2672  type II secretion system protein  55.94 
 
 		 284 aa  295  6e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2790  type II secretion system protein  59.44 
 
 		 285 aa  293  3e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.720201  hitchhiker  0.0010112 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2407  type II secretion system protein  55.59 
 
 		 285 aa  283  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485741 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1650  type II secretion system protein  56.34 
 
 		 284 aa  276  3e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0624732  hitchhiker  0.00100829 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10330  Flp pilus assembly protein TadB  55.35 
 
 		 286 aa  272  4.0000000000000004e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00309565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1210  Type II secretion system F domain protein  55.77 
 
 		 285 aa  262  4e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5825  type II secretion system protein  56.87 
 
 		 286 aa  261  8.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.906484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20410  Flp pilus assembly protein TadB  52.9 
 
 		 290 aa  259  2e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07510  Flp pilus assembly protein TadB  52.03 
 
 		 285 aa  247  1e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1738  type II secretion system protein  58.33 
 
 		 286 aa  236  2e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1253  type II secretion system protein  57.28 
 
 		 284 aa  237  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0780  type II secretion system protein  57.14 
 
 		 296 aa  235  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0857  type II secretion system protein  62.76 
 
 		 284 aa  229  5e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.574937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3788  type II secretion system protein  52.4 
 
 		 286 aa  176  5e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.028828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4969  type II secretion system protein  30.15 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4456  type II secretion system protein  29.79 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.138115 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3932  type II secretion system protein  27.96 
 
 		 325 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0420764  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  25 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3425  type II secretion system protein  27.49 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263373  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1711  type II secretion system protein  23.04 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.806697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0643  type II secretion system protein  22.03 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1205  type II secretion system protein  22.29 
 
 		 535 aa  58.5  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.499257  hitchhiker  0.000000000038758 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  22.22 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  29.15 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  25.28 
 
 		 310 aa  57  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  25.6 
 
 		 328 aa  57  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  24.08 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0747  type II secretion system protein  23.44 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.725692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  25 
 
 		 320 aa  55.8  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  24.62 
 
 		 323 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0709  putative type II secretion system protein F  25.69 
 
 		 283 aa  54.7  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2484  type II secretion system protein  26.52 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2707  type II secretion system protein  26.52 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  21.76 
 
 		 322 aa  53.9  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  26.67 
 
 		 326 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2045  hypothetical protein  24.87 
 
 		 331 aa  53.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0674023  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1676  Flp pilus assembly protein TadB  24.87 
 
 		 331 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0332  hypothetical protein  24.87 
 
 		 331 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.100771  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1877  type II secretion system protein  24.87 
 
 		 331 aa  53.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.395121  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1889  type II secretion system protein  24.87 
 
 		 331 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0829  type II secretion system protein  24.87 
 
 		 331 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226795  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  26.85 
 
 		 325 aa  52.8  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2053  type II secretion system protein  24.86 
 
 		 325 aa  52.4  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000824726  normal  0.0936478 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2699  type II secretion system protein  26.44 
 
 		 321 aa  52.4  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  24.86 
 
 		 324 aa  52.4  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  24.11 
 
 		 336 aa  52.4  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3351  type II secretion system protein  22.62 
 
 		 335 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  26.25 
 
 		 325 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4189  type II secretion system protein  26.7 
 
 		 325 aa  51.2  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.54214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  25.34 
 
 		 325 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4347  type II secretion system protein  25 
 
 		 275 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1832  type II secretion system protein  27.21 
 
 		 316 aa  50.8  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  26.61 
 
 		 322 aa  50.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  29.11 
 
 		 325 aa  50.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3794  type II secretion system protein  27.59 
 
 		 327 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927579  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  26.7 
 
 		 660 aa  50.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1275  type II secretion system protein  25 
 
 		 327 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  24.46 
 
 		 320 aa  49.7  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  26.79 
 
 		 310 aa  49.7  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  31.58 
 
 		 290 aa  49.7  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1681  type II secretion system protein  25 
 
 		 327 aa  49.7  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2412  type II secretion system protein  25.41 
 
 		 323 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  25.93 
 
 		 324 aa  49.3  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  24.39 
 
 		 309 aa  49.3  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  23.76 
 
 		 325 aa  49.3  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2455  pilus assembly protein, putative  25.88 
 
 		 330 aa  48.5  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112538  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  27.86 
 
 		 324 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  21.74 
 
 		 337 aa  48.9  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  26.34 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  27.07 
 
 		 330 aa  48.9  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  28.03 
 
 		 325 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  29.29 
 
 		 325 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3524  type II secretion system protein  24.58 
 
 		 324 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0881  type II secretion system protein  22.69 
 
 		 296 aa  47.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  28.48 
 
 		 325 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  27.81 
 
 		 311 aa  46.6  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0423  type II secretion system protein  25.9 
 
 		 327 aa  46.2  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3795  type II secretion system protein  23.17 
 
 		 325 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187172  normal  0.96616 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  28.36 
 
 		 325 aa  45.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  26.11 
 
 		 325 aa  45.8  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0297  type II secretion system protein  27.17 
 
 		 324 aa  45.4  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2276  putative integral membrane protein  30.77 
 
 		 273 aa  44.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.846433  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  25.4 
 
 		 325 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2380  type II secretion system protein  25.67 
 
 		 322 aa  44.3  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.316858  normal  0.875213 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2695  type II secretion system protein  28.21 
 
 		 289 aa  45.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0973564  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6893  putative integral membrane protein  25.48 
 
 		 290 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00257561  normal  0.329972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1307  hypothetical protein  28.28 
 
 		 295 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1042  Type II secretion system F domain protein  27.56 
 
 		 313 aa  43.9  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.205171  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2571  type II secretion system protein  31.58 
 
 		 303 aa  43.5  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2308  Type II secretion system F domain protein  22.95 
 
 		 284 aa  43.5  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  27.17 
 
 		 321 aa  43.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3211  type II secretion system protein  25.6 
 
 		 332 aa  43.1  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.515921 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  27.61 
 
 		 325 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0301  type II secretion system protein  23.74 
 
 		 322 aa  43.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3717  type II secretion system protein  25.58 
 
 		 324 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.20351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  27.61 
 
 		 325 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2115  type II secretion system protein  25 
 
 		 279 aa  42.7  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7035  putative pilus assembly protein  26.56 
 
 		 324 aa  42.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.611985 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>