32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2223 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2223  type II secretion system protein  100 
 
 		 310 aa  605  9.999999999999999e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3420  type II secretion system protein  50.51 
 
 		 291 aa  250  2e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0841  type II secretion system protein  49.66 
 
 		 289 aa  236  3e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0187037  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0672  Type II secretion system F domain protein  41.53 
 
 		 300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4969  type II secretion system protein  36.32 
 
 		 300 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4456  type II secretion system protein  36.44 
 
 		 300 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.138115 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2761  type II secretion system protein  32.89 
 
 		 302 aa  114  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.09002  hitchhiker  0.00191545 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1224  Type II secretion system F domain protein  33.2 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0116684 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1735  putative integral membrane protein  31.66 
 
 		 302 aa  97.4  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00287883  normal  0.137678 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4141  type II secretion system protein  36.16 
 
 		 331 aa  95.9  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3133  type II secretion system protein  34.89 
 
 		 291 aa  95.5  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0180053 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4032  type II secretion system protein  32.17 
 
 		 296 aa  93.6  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.304186  hitchhiker  0.00325019 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4645  type II secretion system protein  32.72 
 
 		 348 aa  90.9  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1307  hypothetical protein  31.76 
 
 		 295 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6893  putative integral membrane protein  28.24 
 
 		 290 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00257561  normal  0.329972 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2593  integral membrane protein  31.27 
 
 		 302 aa  85.9  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4728  integral membrane protein  31 
 
 		 297 aa  80.5  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8598  type II secretion system protein  31.33 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12577  normal  0.345078 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1542  integral membrane protein  32.35 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8204  type II secretion system protein  29.51 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0538  type II secretion system protein  24.71 
 
 		 322 aa  49.7  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  27.68 
 
 		 660 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1755  type II secretion system protein  25.36 
 
 		 306 aa  47.8  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0468876  normal  0.156837 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  26.82 
 
 		 309 aa  47  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1253  type II secretion system protein  28.74 
 
 		 284 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2452  type II secretion system protein  21.64 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3331  hypothetical protein  26.29 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0723  type II secretion system protein  20.35 
 
 		 301 aa  43.9  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1361  hypothetical protein  27.98 
 
 		 287 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5825  type II secretion system protein  27.78 
 
 		 286 aa  43.9  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.906484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0365  type II secretion system protein  30.43 
 
 		 258 aa  43.1  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000784709  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0033  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  22.97 
 
 		 247 aa  42.7  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>