70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0723 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0723  type II secretion system protein  100 
 
 
301 aa  598  1e-170  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2452  type II secretion system protein  27.57 
 
 
303 aa  116  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2117  type II secretion system protein  24.81 
 
 
323 aa  67.4  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215511  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  27.75 
 
 
290 aa  65.9  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2640  type II secretion system protein  22.43 
 
 
316 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1205  type II secretion system protein  25.12 
 
 
535 aa  64.7  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.499257  hitchhiker  0.000000000038758 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2115  type II secretion system protein  30.1 
 
 
279 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  21.94 
 
 
310 aa  63.9  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4347  type II secretion system protein  23.63 
 
 
275 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277812  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2649  type II secretion system protein  23.53 
 
 
310 aa  60.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  21.23 
 
 
325 aa  57  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  22.13 
 
 
282 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2308  Type II secretion system F domain protein  22.49 
 
 
284 aa  56.6  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  22.18 
 
 
316 aa  56.6  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0643  type II secretion system protein  26.21 
 
 
283 aa  56.2  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  23.79 
 
 
336 aa  56.2  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3211  type II secretion system protein  22.29 
 
 
332 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.515921 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  21.55 
 
 
320 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  20.33 
 
 
325 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13150  Flp pilus assembly protein TadB  24.19 
 
 
321 aa  53.1  0.000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1275  type II secretion system protein  21.3 
 
 
327 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0603  type II secretion system protein  23.87 
 
 
338 aa  50.8  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  22.16 
 
 
321 aa  50.4  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  25.53 
 
 
334 aa  50.8  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0645  type II secretion system protein  23.93 
 
 
293 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.683761  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0709  putative type II secretion system protein F  25.13 
 
 
283 aa  50.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  23.17 
 
 
660 aa  50.1  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2350  type II secretion system protein  22.1 
 
 
322 aa  50.1  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.363474 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1681  type II secretion system protein  20.71 
 
 
327 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  21.2 
 
 
324 aa  49.7  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1904  putative Flp pilus assembly protein TadB  21.83 
 
 
322 aa  49.7  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239588  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0553  type II secretion system protein  21.83 
 
 
322 aa  49.7  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1042  Type II secretion system F domain protein  19.43 
 
 
313 aa  49.7  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.205171  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0747  type II secretion system protein  22.11 
 
 
283 aa  48.5  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.725692  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  24.35 
 
 
324 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  21.28 
 
 
337 aa  47.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0881  type II secretion system protein  21.5 
 
 
296 aa  47  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2695  type II secretion system protein  25.19 
 
 
289 aa  47  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0973564  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  24.36 
 
 
320 aa  47  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3010  type II secretion system protein  19.78 
 
 
321 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  19.66 
 
 
325 aa  47  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  24.39 
 
 
324 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1125  type II secretion system protein  22.98 
 
 
322 aa  46.2  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517135  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2707  type II secretion system protein  22.55 
 
 
323 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  19.55 
 
 
321 aa  45.8  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2484  type II secretion system protein  22.55 
 
 
323 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2412  type II secretion system protein  21.1 
 
 
323 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  18.73 
 
 
321 aa  45.8  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5620  type II secretion system protein  22.82 
 
 
287 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0301  type II secretion system protein  21.48 
 
 
322 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1160  Type II secretion system F domain protein  22.89 
 
 
323 aa  45.4  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7219  type II secretion system protein  22.33 
 
 
287 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.981655  normal  0.304711 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  20 
 
 
323 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0845  type II secretion system protein  23.08 
 
 
293 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4192  type II secretion system protein  20.34 
 
 
335 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  22.44 
 
 
324 aa  44.3  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3356  type II secretion system protein  23.38 
 
 
336 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  22.02 
 
 
310 aa  44.3  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2223  type II secretion system protein  20.35 
 
 
310 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4394  type II secretion system protein  20.26 
 
 
294 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4854  hypothetical protein  21.6 
 
 
295 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0767  Type II secretion system F domain protein  26.95 
 
 
269 aa  43.9  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4480  type II secretion system protein  21.3 
 
 
335 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002650  flp pilus assembly protein TadB  24.48 
 
 
322 aa  43.5  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7035  putative pilus assembly protein  24.39 
 
 
324 aa  43.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3524  type II secretion system protein  22.92 
 
 
324 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2275  putative integral membrane protein  21.36 
 
 
310 aa  43.1  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.421118  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2159  type II secretion system protein  22.16 
 
 
294 aa  42.7  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0653395  normal  0.01997 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55880  hypothetical protein  20.85 
 
 
294 aa  42.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  23.13 
 
 
337 aa  42.4  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>