44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0365 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0365  type II secretion system protein  100 
 
 		 258 aa  465  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000784709  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0051  integral membrane protein  39.78 
 
 		 270 aa  95.9  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.741215  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0215  type II secretion system protein  46.43 
 
 		 263 aa  91.3  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0481  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  43.92 
 
 		 234 aa  88.6  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0127  putative integral membrane protein  37.62 
 
 		 250 aa  82.4  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.215153  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1981  putative integral membrane protein  34.31 
 
 		 272 aa  74.3  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5327  Type II secretion system F domain protein  39.18 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0528876  normal  0.372482 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4837  type II secretion system protein  38.86 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0881  type II secretion system protein  28.5 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3907  Type II secretion system F domain protein  33.85 
 
 		 269 aa  62  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1385  type II secretion system protein  32.37 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0556186  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4804  type II secretion system protein  32.73 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.422865  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4890  type II secretion system protein  32.73 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.830749  normal  0.078643 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  28.73 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  25.4 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0301  type II secretion system protein  26.09 
 
 		 322 aa  56.6  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4298  type II secretion system protein  36.41 
 
 		 448 aa  55.8  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2350  type II secretion system protein  26.56 
 
 		 322 aa  54.7  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.363474 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0730  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  33.67 
 
 		 270 aa  53.1  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.258746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2570  type II secretion system protein  31.22 
 
 		 314 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5191  type II secretion system protein  33.94 
 
 		 262 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0306742  hitchhiker  0.000243657 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1125  type II secretion system protein  27.7 
 
 		 322 aa  50.4  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5406  type II secretion system protein  31.76 
 
 		 260 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0943658 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3010  type II secretion system protein  24.58 
 
 		 321 aa  49.3  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1904  putative Flp pilus assembly protein TadB  25.64 
 
 		 322 aa  48.5  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239588  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0553  type II secretion system protein  25.64 
 
 		 322 aa  48.5  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3420  type II secretion system protein  35.15 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  25.7 
 
 		 310 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3421  Type II secretion system F domain protein  30.05 
 
 		 310 aa  47.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  25.71 
 
 		 320 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0593  hypothetical protein  43.69 
 
 		 264 aa  46.6  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2649  type II secretion system protein  26.26 
 
 		 310 aa  45.8  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2115  type II secretion system protein  26.55 
 
 		 279 aa  45.8  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2776  hypothetical protein  35.56 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0377209  hitchhiker  0.0000127528 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2223  type II secretion system protein  30.36 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0993  type II secretion system protein  25.28 
 
 		 322 aa  44.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0645  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 293 aa  43.5  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.683761  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2566  Type II secretion system F domain protein  34.09 
 
 		 306 aa  43.5  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2159  type II secretion system protein  30.32 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0653395  normal  0.01997 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0620  hypothetical protein  34.11 
 
 		 141 aa  43.5  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3351  type II secretion system protein  25.23 
 
 		 335 aa  42.7  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1296  Flp pilus assembly protein  31.48 
 
 		 218 aa  42.4  0.008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55880  hypothetical protein  27.46 
 
 		 294 aa  42  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  24.32 
 
 		 320 aa  42  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>