31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0127 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0127  putative integral membrane protein  100 
 
 		 250 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.215153  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5327  Type II secretion system F domain protein  46.73 
 
 		 211 aa  121  9e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0528876  normal  0.372482 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0215  type II secretion system protein  40.66 
 
 		 263 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0051  integral membrane protein  40.56 
 
 		 270 aa  102  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.741215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0481  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  44.25 
 
 		 234 aa  96.7  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1981  putative integral membrane protein  44.14 
 
 		 272 aa  89  6e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5406  type II secretion system protein  35.96 
 
 		 260 aa  87  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0943658 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1385  type II secretion system protein  35.67 
 
 		 261 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0556186  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0365  type II secretion system protein  40.74 
 
 		 258 aa  83.2  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000784709  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4837  type II secretion system protein  41.35 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4298  type II secretion system protein  36.46 
 
 		 448 aa  72  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4890  type II secretion system protein  29.63 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.830749  normal  0.078643 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4804  type II secretion system protein  29.63 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.422865  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35910  Flp pilus assembly protein TadB  34.83 
 
 		 282 aa  70.1  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13688  transmembrane protein  32.32 
 
 		 266 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.76431e-37  normal  0.0719684 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5191  type II secretion system protein  30.82 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0306742  hitchhiker  0.000243657 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0519  Type II secretion system F domain protein  33.15 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0730  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  32.73 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.258746  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3907  Type II secretion system F domain protein  34.57 
 
 		 269 aa  58.5  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  24.04 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3160  hypothetical protein  41.75 
 
 		 271 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0670324 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3371  hypothetical protein  43.27 
 
 		 276 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2776  hypothetical protein  38.71 
 
 		 243 aa  54.3  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0377209  hitchhiker  0.0000127528 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0593  hypothetical protein  39.64 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5869  hypothetical protein  34.74 
 
 		 242 aa  50.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00430744  normal  0.104668 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2649  type II secretion system protein  20.96 
 
 		 310 aa  49.7  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0277  type II secretion system protein  35.51 
 
 		 251 aa  49.3  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  19.25 
 
 		 309 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33350  hypothetical protein  37.14 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.758276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  27.72 
 
 		 660 aa  45.4  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  23.7 
 
 		 336 aa  42  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>