27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3160 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3160  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  502  1e-141  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0670324 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3371  hypothetical protein  58.96 
 
 		 276 aa  211  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0620  hypothetical protein  54.37 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0127  putative integral membrane protein  41.75 
 
 		 250 aa  68.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.215153  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35910  Flp pilus assembly protein TadB  39.82 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1981  putative integral membrane protein  40.78 
 
 		 272 aa  67  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33350  hypothetical protein  40.95 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.758276  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5327  Type II secretion system F domain protein  37.42 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0528876  normal  0.372482 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4890  type II secretion system protein  36.79 
 
 		 262 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.830749  normal  0.078643 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3907  Type II secretion system F domain protein  34.82 
 
 		 269 aa  58.5  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4804  type II secretion system protein  36.79 
 
 		 262 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.422865  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0215  type II secretion system protein  44.44 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1385  type II secretion system protein  37.86 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0556186  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5406  type II secretion system protein  35.33 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0943658 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5869  hypothetical protein  40.54 
 
 		 242 aa  52.8  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00430744  normal  0.104668 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0481  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  41.28 
 
 		 234 aa  52.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13688  transmembrane protein  37.5 
 
 		 266 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.76431e-37  normal  0.0719684 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25290  Flp pilus assembly protein TadB  35.71 
 
 		 264 aa  49.3  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5191  type II secretion system protein  37.74 
 
 		 262 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0306742  hitchhiker  0.000243657 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4298  type II secretion system protein  36.79 
 
 		 448 aa  49.3  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0051  integral membrane protein  33.04 
 
 		 270 aa  48.9  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.741215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0365  type II secretion system protein  34.29 
 
 		 258 aa  48.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000784709  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1296  Flp pilus assembly protein  48.33 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0121  hypothetical protein  35.9 
 
 		 191 aa  46.2  0.0006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0277  type II secretion system protein  37.74 
 
 		 251 aa  45.8  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0593  hypothetical protein  37.27 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0519  Type II secretion system F domain protein  35.58 
 
 		 264 aa  43.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>