24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0519 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0519  Type II secretion system F domain protein  100 
 
 		 264 aa  499  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4804  type II secretion system protein  44.75 
 
 		 262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.422865  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4890  type II secretion system protein  44.75 
 
 		 262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.830749  normal  0.078643 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1385  type II secretion system protein  43.89 
 
 		 261 aa  123  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0556186  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5406  type II secretion system protein  43.75 
 
 		 260 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0943658 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5191  type II secretion system protein  46.2 
 
 		 262 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0306742  hitchhiker  0.000243657 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3907  Type II secretion system F domain protein  41.75 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13688  transmembrane protein  50 
 
 		 266 aa  102  9e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.76431e-37  normal  0.0719684 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35910  Flp pilus assembly protein TadB  35.4 
 
 		 282 aa  97.4  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0277  type II secretion system protein  41.35 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0730  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  42.42 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.258746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0127  putative integral membrane protein  33.33 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.215153  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2776  hypothetical protein  44.21 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0377209  hitchhiker  0.0000127528 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0051  integral membrane protein  29.41 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.741215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0593  hypothetical protein  43.81 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3160  hypothetical protein  35.58 
 
 		 271 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0670324 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5327  Type II secretion system F domain protein  29.59 
 
 		 211 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0528876  normal  0.372482 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0365  type II secretion system protein  31.4 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000784709  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0215  type II secretion system protein  32.94 
 
 		 263 aa  47  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5869  hypothetical protein  36.63 
 
 		 242 aa  46.6  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00430744  normal  0.104668 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1296  Flp pilus assembly protein  45.61 
 
 		 218 aa  45.8  0.0008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33350  hypothetical protein  37.5 
 
 		 239 aa  45.4  0.0009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.758276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4298  type II secretion system protein  33.98 
 
 		 448 aa  45.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0620  hypothetical protein  36.36 
 
 		 141 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>