44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_5191 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_5191  type II secretion system protein  100 
 
 
262 aa  495  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0306742  hitchhiker  0.000243657 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4804  type II secretion system protein  94.35 
 
 
262 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.422865  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4890  type II secretion system protein  94.35 
 
 
262 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.830749  normal  0.078643 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1385  type II secretion system protein  67.98 
 
 
261 aa  230  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0556186  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5406  type II secretion system protein  66.29 
 
 
260 aa  222  4e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0943658 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13688  transmembrane protein  66.83 
 
 
266 aa  206  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.76431e-37  normal  0.0719684 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3907  Type II secretion system F domain protein  46.52 
 
 
269 aa  115  8.999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0519  Type II secretion system F domain protein  45.74 
 
 
264 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35910  Flp pilus assembly protein TadB  38.51 
 
 
282 aa  94  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0277  type II secretion system protein  40.6 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0730  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  38.95 
 
 
270 aa  67  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.258746  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0127  putative integral membrane protein  29.44 
 
 
250 aa  65.1  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.215153  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1981  putative integral membrane protein  30.74 
 
 
272 aa  63.9  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0593  hypothetical protein  44 
 
 
264 aa  59.7  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0365  type II secretion system protein  33.96 
 
 
258 aa  58.9  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000784709  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0215  type II secretion system protein  35.44 
 
 
263 aa  56.2  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  26.4 
 
 
310 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0051  integral membrane protein  35.35 
 
 
270 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.741215  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  25.74 
 
 
320 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3010  type II secretion system protein  27.38 
 
 
321 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2912  type II secretion system protein  25.84 
 
 
320 aa  52  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  30.43 
 
 
316 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3160  hypothetical protein  37.74 
 
 
271 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0670324 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  26.52 
 
 
309 aa  50.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2824  type II secretion system protein  24.72 
 
 
320 aa  49.3  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0481  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  33.74 
 
 
234 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2350  type II secretion system protein  26.28 
 
 
322 aa  48.1  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.363474 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2570  type II secretion system protein  32.57 
 
 
314 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5869  hypothetical protein  35.45 
 
 
242 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00430744  normal  0.104668 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1125  type II secretion system protein  27.41 
 
 
322 aa  47.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517135  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2640  type II secretion system protein  25.56 
 
 
316 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  23.11 
 
 
282 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4298  type II secretion system protein  30.94 
 
 
448 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273888  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5327  Type II secretion system F domain protein  29.34 
 
 
211 aa  45.8  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0528876  normal  0.372482 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2649  type II secretion system protein  26.26 
 
 
310 aa  45.8  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0301  type II secretion system protein  27.32 
 
 
322 aa  45.8  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  22.83 
 
 
310 aa  45.8  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  25.32 
 
 
324 aa  45.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0993  type II secretion system protein  26.94 
 
 
322 aa  45.4  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146883  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  25.33 
 
 
325 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2776  hypothetical protein  36.9 
 
 
243 aa  43.5  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0377209  hitchhiker  0.0000127528 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0553  type II secretion system protein  28.79 
 
 
322 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1904  putative Flp pilus assembly protein TadB  28.79 
 
 
322 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239588  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0310  type II secretion system protein  21.05 
 
 
329 aa  42.4  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.873631  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>