52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4298 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4298  type II secretion system protein  100 
 
 		 448 aa  827    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0317  type II secretion system protein  47.75 
 
 		 519 aa  227  4e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0140124  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0482  hypothetical protein  43.37 
 
 		 193 aa  85.5  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.971848 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4419  type II secretion system protein  37.56 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.219258  hitchhiker  0.00591921 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0520  Type II secretion system F domain protein  40.99 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.691642  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0216  type II secretion system protein  41.1 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0594  Type II secretion system F domain protein  42.24 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5326  Type II secretion system F domain protein  38.61 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00292685  normal  0.534868 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1980  type II secretion system protein  38.92 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0127  putative integral membrane protein  41.74 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.215153  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35900  Flp pilus assembly protein TadC  37.78 
 
 		 212 aa  65.9  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.630177  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4037  type II secretion system protein  38.1 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4836  type II secretion system protein  43.2 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5868  type II secretion system protein  29.7 
 
 		 220 aa  62.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188424  normal  0.16235 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0366  type II secretion system protein  35.85 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00194473  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1295  Flp pilus assembly protein  32.69 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0731  type II secretion system protein  51.61 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0847953  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0215  type II secretion system protein  42.31 
 
 		 263 aa  58.9  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3906  Type II secretion system F domain protein  48.44 
 
 		 197 aa  58.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0126  putative integral membrane protein  49.3 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0160124  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0365  type II secretion system protein  35.67 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000784709  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0051  integral membrane protein  43.59 
 
 		 270 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.741215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33350  hypothetical protein  39.17 
 
 		 239 aa  55.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.758276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0122  hypothetical protein  30.19 
 
 		 215 aa  55.1  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2223  type II secretion system protein  27.35 
 
 		 416 aa  52  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.92852  normal  0.508366 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1981  putative integral membrane protein  30.4 
 
 		 272 aa  52  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1296  Flp pilus assembly protein  40.91 
 
 		 218 aa  51.6  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0730  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  40.34 
 
 		 270 aa  51.2  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.258746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35910  Flp pilus assembly protein TadB  43.9 
 
 		 282 aa  51.2  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0278  type II secretion system protein  36.81 
 
 		 185 aa  50.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5190  type II secretion system protein  39.1 
 
 		 192 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139596  decreased coverage  0.0000686887 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2776  hypothetical protein  46.67 
 
 		 243 aa  50.4  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0377209  hitchhiker  0.0000127528 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5327  Type II secretion system F domain protein  34.55 
 
 		 211 aa  49.7  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0528876  normal  0.372482 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4803  type II secretion system protein  46.59 
 
 		 192 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.646153  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4889  type II secretion system protein  46.59 
 
 		 192 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.944047  normal  0.0709188 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0050  type II secretion system protein  53.25 
 
 		 234 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0621  type II secretion system protein  33.13 
 
 		 179 aa  49.3  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.873004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4804  type II secretion system protein  31.35 
 
 		 262 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.422865  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0481  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  31.44 
 
 		 234 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5405  type II secretion system protein  37.18 
 
 		 191 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.901064  normal  0.137525 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4890  type II secretion system protein  31.35 
 
 		 262 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.830749  normal  0.078643 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3907  Type II secretion system F domain protein  44.62 
 
 		 269 aa  47.8  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3159  type II secretion system protein  33.13 
 
 		 200 aa  47  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127663 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4837  type II secretion system protein  40.52 
 
 		 247 aa  47  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1386  type II secretion system protein  50 
 
 		 197 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0123649  normal  0.307577 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5869  hypothetical protein  38 
 
 		 242 aa  46.2  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00430744  normal  0.104668 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13687  alanine rich membrane protein  44.83 
 
 		 191 aa  46.2  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.58076e-41  normal  0.106713 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2364  putative putative tight adherence TadC-like transmembrane protein  27.33 
 
 		 321 aa  46.2  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00226483  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0373  type II secretion system protein F  28.35 
 
 		 303 aa  45.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.232118  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3370  type II secretion system protein  48.61 
 
 		 204 aa  44.7  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3160  hypothetical protein  36.79 
 
 		 271 aa  45.1  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0670324 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  23.86 
 
 		 322 aa  43.5  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>