22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0051 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0051  integral membrane protein  100 
 
 		 270 aa  515  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.741215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0127  putative integral membrane protein  40.56 
 
 		 250 aa  99  7e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.215153  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0215  type II secretion system protein  42.94 
 
 		 263 aa  89.4  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5327  Type II secretion system F domain protein  40.91 
 
 		 211 aa  86.3  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0528876  normal  0.372482 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0365  type II secretion system protein  40.12 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000784709  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0481  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  38.6 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4837  type II secretion system protein  39.66 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0730  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  34.59 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.258746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35910  Flp pilus assembly protein TadB  48.48 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2776  hypothetical protein  38.54 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0377209  hitchhiker  0.0000127528 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1981  putative integral membrane protein  32.73 
 
 		 272 aa  62  0.000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1385  type II secretion system protein  37.37 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0556186  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5406  type II secretion system protein  38.38 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0943658 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3907  Type II secretion system F domain protein  31.25 
 
 		 269 aa  58.5  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13688  transmembrane protein  36.27 
 
 		 266 aa  57  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.76431e-37  normal  0.0719684 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4890  type II secretion system protein  35.35 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.830749  normal  0.078643 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4804  type II secretion system protein  35.35 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.422865  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4298  type II secretion system protein  45.71 
 
 		 448 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5869  hypothetical protein  41.57 
 
 		 242 aa  52.8  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00430744  normal  0.104668 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0593  hypothetical protein  42.11 
 
 		 264 aa  50.4  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0277  type II secretion system protein  38.46 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0620  hypothetical protein  33.33 
 
 		 141 aa  42  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>