More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2194 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2194  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  100 
 
 		 323 aa  628  1e-179  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2497  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  79.26 
 
 		 323 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4255  PDZ/DHR/GLGF domain protein  70.99 
 
 		 324 aa  456  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.730819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3887  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  70.99 
 
 		 324 aa  456  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.204863  normal  0.15793 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4358  PDZ/DHR/GLGF domain protein  70.68 
 
 		 324 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1570  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  70.68 
 
 		 324 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.43574  normal  0.176189 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1117  PDZ/DHR/GLGF  62.23 
 
 		 321 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0129707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1107  putative serine protease  60.49 
 
 		 323 aa  400  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0917977 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1014  PDZ/DHR/GLGF  61.61 
 
 		 321 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5059  PDZ/DHR/GLGF domain protein  60.37 
 
 		 321 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0744  trypsin-like serine protease  60.49 
 
 		 323 aa  383  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3491  PDZ/DHR/GLGF  61.11 
 
 		 323 aa  375  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0797  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  58.13 
 
 		 326 aa  366  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4304  PDZ/DHR/GLGF  58.02 
 
 		 323 aa  349  3e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.328087  normal  0.0388954 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0906  PDZ/DHR/GLGF domain protein  57.28 
 
 		 301 aa  331  9e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0997368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2159  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  54.09 
 
 		 325 aa  308  8e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0222521 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1051  PDZ/DHR/GLGF domain protein  57.62 
 
 		 301 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00175075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0666  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  41.72 
 
 		 384 aa  210  3e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1129  putative serine protease  43 
 
 		 355 aa  209  5e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.247199  normal  0.0306417 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3720  PDZ/DHR/GLGF  38.31 
 
 		 354 aa  189  8e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.285771  normal  0.385221 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0600  PDZ/DHR/GLGF  30.48 
 
 		 353 aa  99  1e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0585  PDZ/DHR/GLGF  28.62 
 
 		 406 aa  95.5  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000357237  normal  0.0103671 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1285  periplasmic serine protease Do; heat shock protein HtrA  25.41 
 
 		 466 aa  91.7  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  29.56 
 
 		 457 aa  92.4  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0709  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.96 
 
 		 388 aa  91.7  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.675227 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0530  protease Do  31.76 
 
 		 457 aa  91.3  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  28 
 
 		 511 aa  91.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6606  HtrA2 peptidase  27.8 
 
 		 393 aa  90.9  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1284  periplasmic serine protease Do; heat shock protein HtrA  25.41 
 
 		 466 aa  90.9  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16121  trypsin-like serine protease  27.86 
 
 		 370 aa  89.7  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  30.45 
 
 		 485 aa  89.7  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4861  protease Do  27.08 
 
 		 492 aa  89.7  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3784  protease Do  27.08 
 
 		 492 aa  89.7  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.19 
 
 		 386 aa  89.4  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  28.78 
 
 		 464 aa  89  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  28.16 
 
 		 476 aa  89  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  25.37 
 
 		 471 aa  87.8  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.71 
 
 		 381 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2895  2-alkenal reductase  26.35 
 
 		 389 aa  87.8  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.253415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1021  trypsin-like serine protease  28.11 
 
 		 381 aa  87  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.75122  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  28.52 
 
 		 513 aa  87.8  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5515  2-alkenal reductase  28.4 
 
 		 383 aa  87  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  26.3 
 
 		 476 aa  87.4  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  26.25 
 
 		 459 aa  87.4  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18911  trypsin-like serine protease  28.11 
 
 		 381 aa  87  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.58243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.67 
 
 		 412 aa  87  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3690  HtrA2 peptidase  27.09 
 
 		 396 aa  86.7  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.104241  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  26.77 
 
 		 504 aa  86.7  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.34 
 
 		 396 aa  86.7  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0519  serine endoprotease  26.15 
 
 		 383 aa  86.3  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4323  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.01 
 
 		 405 aa  85.9  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1139  serine endoprotease  26.15 
 
 		 362 aa  85.9  8e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.46983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0455  serine endoprotease  26.15 
 
 		 362 aa  85.9  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000102083  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0817  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.94 
 
 		 384 aa  85.9  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0484  2-alkenal reductase  26.01 
 
 		 388 aa  85.9  9e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000148342  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  26.84 
 
 		 482 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  27.01 
 
 		 500 aa  85.5  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  27.72 
 
 		 466 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  25.55 
 
 		 476 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004515  outer membrane stress sensor protease DegS  25.9 
 
 		 354 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.497623  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  27.24 
 
 		 385 aa  84.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  28.98 
 
 		 458 aa  84  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  28.94 
 
 		 485 aa  84.3  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  25.91 
 
 		 476 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  24.92 
 
 		 442 aa  84  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  25.08 
 
 		 415 aa  83.6  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.52 
 
 		 398 aa  83.6  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02108  protease signal peptide protein  26.35 
 
 		 490 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.4 
 
 		 379 aa  83.2  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3801  serine endoprotease  25.99 
 
 		 354 aa  83.2  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000336047  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0747  2-alkenal reductase  27.76 
 
 		 379 aa  83.6  0.000000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3074  protease DegS  28.33 
 
 		 356 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.940129  normal  0.195971 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  27.64 
 
 		 464 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0410  protease Do  29.56 
 
 		 474 aa  82.8  0.000000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.134213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  25.28 
 
 		 387 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04311  trypsin-like serine protease  28.77 
 
 		 362 aa  82.8  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0037  protease Do  28.67 
 
 		 489 aa  82.8  0.000000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3643  serine endoprotease  25.57 
 
 		 354 aa  82.4  0.000000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  25.37 
 
 		 472 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  24.08 
 
 		 411 aa  82.4  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03179  serine protease DegS  25.57 
 
 		 356 aa  82.4  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00219813  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2079  HtrA2 peptidase  24.64 
 
 		 420 aa  82.4  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  25.72 
 
 		 502 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  27.46 
 
 		 477 aa  82  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2404  2-alkenal reductase  24.42 
 
 		 350 aa  81.3  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.993946  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  28.1 
 
 		 483 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  28.1 
 
 		 483 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0175  trypsin-like serine protease  30.15 
 
 		 347 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0707716  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.62 
 
 		 380 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  27.5 
 
 		 481 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5949  HtrA2 peptidase  25.86 
 
 		 512 aa  81.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510006  normal  0.029563 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2956  protease Do  28.84 
 
 		 472 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000460419  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2479  protease Do  28.49 
 
 		 450 aa  80.9  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  26.77 
 
 		 451 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2256  peptidase S1C, Do  28.73 
 
 		 498 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0856  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.78 
 
 		 475 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0131628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0850  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.78 
 
 		 475 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.24 
 
 		 423 aa  80.5  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0867  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.78 
 
 		 475 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  28.83 
 
 		 505 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>