More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2497 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2497  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  100 
 
 		 323 aa  629  1e-179  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2194  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  79.26 
 
 		 323 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1570  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  71.6 
 
 		 324 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.43574  normal  0.176189 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3887  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  69.44 
 
 		 324 aa  450  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.204863  normal  0.15793 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4255  PDZ/DHR/GLGF domain protein  69.44 
 
 		 324 aa  450  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.730819 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4358  PDZ/DHR/GLGF domain protein  69.44 
 
 		 324 aa  449  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1107  putative serine protease  58.31 
 
 		 323 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0917977 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1117  PDZ/DHR/GLGF  60.06 
 
 		 321 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0129707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5059  PDZ/DHR/GLGF domain protein  60.06 
 
 		 321 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1014  PDZ/DHR/GLGF  60.69 
 
 		 321 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0797  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  58.44 
 
 		 326 aa  372  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0744  trypsin-like serine protease  57.72 
 
 		 323 aa  369  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3491  PDZ/DHR/GLGF  58.64 
 
 		 323 aa  365  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4304  PDZ/DHR/GLGF  58.49 
 
 		 323 aa  354  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.328087  normal  0.0388954 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0906  PDZ/DHR/GLGF domain protein  53.14 
 
 		 301 aa  319  5e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0997368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2159  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  56.09 
 
 		 325 aa  312  3.9999999999999997e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0222521 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1051  PDZ/DHR/GLGF domain protein  53.14 
 
 		 301 aa  288  8e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00175075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0666  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  43 
 
 		 384 aa  214  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1129  putative serine protease  43.33 
 
 		 355 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.247199  normal  0.0306417 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3720  PDZ/DHR/GLGF  39.35 
 
 		 354 aa  182  6e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.285771  normal  0.385221 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0600  PDZ/DHR/GLGF  33.56 
 
 		 353 aa  111  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  30.29 
 
 		 457 aa  98.6  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0709  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.07 
 
 		 388 aa  97.4  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.675227 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  27.57 
 
 		 471 aa  96.7  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  28.31 
 
 		 472 aa  94  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2072  PDZ/DHR/GLGF  31.83 
 
 		 366 aa  93.2  5e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  28.73 
 
 		 511 aa  92  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0484  2-alkenal reductase  27.78 
 
 		 388 aa  90.9  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000148342  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03179  serine protease DegS  26.37 
 
 		 356 aa  91.3  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00219813  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0817  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.03 
 
 		 384 aa  90.1  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  28.16 
 
 		 502 aa  89.7  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  26.79 
 
 		 411 aa  89.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  28.57 
 
 		 502 aa  88.6  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1454  2-alkenal reductase  27.92 
 
 		 409 aa  88.6  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00925037  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  28 
 
 		 476 aa  88.6  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4861  protease Do  27.8 
 
 		 492 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3784  protease Do  27.8 
 
 		 492 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  25.71 
 
 		 408 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  28.74 
 
 		 458 aa  87.8  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16701  trypsin-like serine protease  26.69 
 
 		 376 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  25.71 
 
 		 408 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  29.37 
 
 		 506 aa  87.4  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  27.64 
 
 		 476 aa  87.4  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5515  2-alkenal reductase  29.09 
 
 		 383 aa  87.4  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  28.83 
 
 		 464 aa  87  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  26.99 
 
 		 482 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0393  HtrA2 peptidase  27.53 
 
 		 397 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0384  2-alkenal reductase  27.53 
 
 		 383 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0585  PDZ/DHR/GLGF  27.02 
 
 		 406 aa  86.7  6e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000357237  normal  0.0103671 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  27.21 
 
 		 511 aa  86.3  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.17 
 
 		 380 aa  86.3  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  26.43 
 
 		 505 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0867  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.1 
 
 		 475 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0850  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.1 
 
 		 475 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2895  2-alkenal reductase  27.21 
 
 		 389 aa  85.1  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.253415  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12950  Htr-like protease  25.91 
 
 		 383 aa  85.1  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0856  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.1 
 
 		 475 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0131628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3643  serine endoprotease  25.77 
 
 		 354 aa  85.5  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2079  HtrA2 peptidase  27.11 
 
 		 420 aa  84.7  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1021  trypsin-like serine protease  27.92 
 
 		 381 aa  85.1  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.75122  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2700  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.53 
 
 		 387 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  hitchhiker  0.000142466 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0875  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  24.45 
 
 		 385 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18911  trypsin-like serine protease  27.92 
 
 		 381 aa  85.1  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.58243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04311  trypsin-like serine protease  30.14 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16121  trypsin-like serine protease  27.4 
 
 		 370 aa  84.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6606  HtrA2 peptidase  26.35 
 
 		 393 aa  84.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5949  HtrA2 peptidase  26.55 
 
 		 512 aa  84.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510006  normal  0.029563 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.62 
 
 		 381 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3801  serine endoprotease  25.84 
 
 		 354 aa  84  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000336047  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4424  2-alkenal reductase  23.45 
 
 		 386 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.377382 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1301  2-alkenal reductase  23.45 
 
 		 402 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  29.2 
 
 		 478 aa  83.6  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3540  serine endoprotease  25.24 
 
 		 356 aa  83.2  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0189154  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3612  serine endoprotease  25.24 
 
 		 356 aa  83.2  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3541  serine endoprotease  25.24 
 
 		 356 aa  83.2  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0295  serine endoprotease  24.4 
 
 		 365 aa  83.2  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.11655  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3647  serine endoprotease  25.24 
 
 		 356 aa  83.2  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3709  serine endoprotease  25.24 
 
 		 356 aa  83.2  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.650789  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  26.32 
 
 		 415 aa  82.8  0.000000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4323  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.17 
 
 		 405 aa  82.8  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4610  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.62 
 
 		 428 aa  82.8  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3272  DegS serine peptidase  28.03 
 
 		 360 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.581371  hitchhiker  0.00106456 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3363  periplasmic serine protease DegS  26.91 
 
 		 359 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120953  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  26.07 
 
 		 504 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  25.71 
 
 		 484 aa  82.4  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004515  outer membrane stress sensor protease DegS  25.6 
 
 		 354 aa  82  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.497623  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4548  2-alkenal reductase  23.45 
 
 		 386 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  26.16 
 
 		 476 aa  82  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1782  protease Do  27.8 
 
 		 498 aa  82  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.39 
 
 		 385 aa  82.4  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0530  protease Do  27.55 
 
 		 457 aa  82.4  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16941  trypsin-like serine protease  26.69 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02108  protease signal peptide protein  26.47 
 
 		 490 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0729  periplasmic serine protease DegS  28.41 
 
 		 360 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.206097  normal  0.0822634 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0741  periplasmic serine protease DegS  27.62 
 
 		 360 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.905633  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02461  serine protease  31.6 
 
 		 395 aa  81.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0720  periplasmic serine protease DegS  28.41 
 
 		 360 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253499 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0699  periplasmic serine protease DegS  28.41 
 
 		 360 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3655  periplasmic serine protease DegS  28.41 
 
 		 360 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00040355  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  26.53 
 
 		 385 aa  81.6  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>