More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1129 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1129  putative serine protease  100 
 
 		 355 aa  696    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.247199  normal  0.0306417 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0666  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  54.52 
 
 		 384 aa  342  5.999999999999999e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3720  PDZ/DHR/GLGF  50.64 
 
 		 354 aa  299  6e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.285771  normal  0.385221 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4358  PDZ/DHR/GLGF domain protein  44.59 
 
 		 324 aa  223  4e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4255  PDZ/DHR/GLGF domain protein  43.58 
 
 		 324 aa  220  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.730819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3887  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  43.58 
 
 		 324 aa  220  3e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.204863  normal  0.15793 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1570  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  42.76 
 
 		 324 aa  216  4e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.43574  normal  0.176189 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2497  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  43.33 
 
 		 323 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0906  PDZ/DHR/GLGF domain protein  41.78 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0997368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2159  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  41.64 
 
 		 325 aa  210  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0222521 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2194  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  43 
 
 		 323 aa  209  6e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0744  trypsin-like serine protease  42.24 
 
 		 323 aa  200  3e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1107  putative serine protease  39.67 
 
 		 323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0917977 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0797  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  38.74 
 
 		 326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1051  PDZ/DHR/GLGF domain protein  43.49 
 
 		 301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00175075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1117  PDZ/DHR/GLGF  38.71 
 
 		 321 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0129707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5059  PDZ/DHR/GLGF domain protein  39 
 
 		 321 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1014  PDZ/DHR/GLGF  39.68 
 
 		 321 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3491  PDZ/DHR/GLGF  41.95 
 
 		 323 aa  191  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4304  PDZ/DHR/GLGF  39.67 
 
 		 323 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.328087  normal  0.0388954 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  26.55 
 
 		 466 aa  93.2  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.19 
 
 		 423 aa  87  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07340  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  32.2 
 
 		 552 aa  86.3  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.191801 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3234  2-alkenal reductase  32.76 
 
 		 575 aa  86.3  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.222667  normal  0.0363808 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0459  2-alkenal reductase  30.18 
 
 		 584 aa  85.9  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  27.3 
 
 		 464 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  28.98 
 
 		 501 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  27.24 
 
 		 485 aa  84.3  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4002  protease Do  26.64 
 
 		 501 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  28.32 
 
 		 516 aa  83.2  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1454  2-alkenal reductase  27.92 
 
 		 409 aa  82  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00925037  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6094  putative Serine protease do-like precursor  25.81 
 
 		 498 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  28.11 
 
 		 500 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2158  2-alkenal reductase  26.69 
 
 		 368 aa  82.4  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  26.55 
 
 		 457 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  28.42 
 
 		 511 aa  81.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.22 
 
 		 396 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  27.08 
 
 		 477 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  27.08 
 
 		 477 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  29.08 
 
 		 493 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2346  peptidase S1C, Do  25.45 
 
 		 496 aa  80.9  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.466246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2700  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.14 
 
 		 387 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  hitchhiker  0.000142466 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6606  HtrA2 peptidase  26.86 
 
 		 393 aa  80.9  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  25.45 
 
 		 464 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5142  serine protease  25.25 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0535  2-alkenal reductase  29.63 
 
 		 469 aa  80.5  0.00000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.474663  normal  0.227386 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  28.22 
 
 		 477 aa  80.5  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  29.31 
 
 		 385 aa  80.1  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5567  serine protease  25.25 
 
 		 391 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7078e-38 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2753  serine protease DO-like precursor  29.45 
 
 		 345 aa  80.1  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2725  peptidase S1C, Do  25.27 
 
 		 497 aa  79.7  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2079  HtrA2 peptidase  26.43 
 
 		 420 aa  79.3  0.00000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5610  serine protease  25.25 
 
 		 381 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4347  serine protease DegS  25.82 
 
 		 356 aa  79  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  26.74 
 
 		 461 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5314  serine protease  24.58 
 
 		 391 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5158  serine protease  25.25 
 
 		 391 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  28.32 
 
 		 525 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5645  serine protease  25.25 
 
 		 391 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0281098  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  29.08 
 
 		 506 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  29.08 
 
 		 493 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5710  serine protease  24.58 
 
 		 391 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  26.67 
 
 		 522 aa  79.3  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0029  serine protease  26.99 
 
 		 460 aa  79  0.0000000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4001  2-alkenal reductase  25.25 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5254  2-alkenal reductase  24.92 
 
 		 395 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0476  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.58 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236131  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0353  trypsin-like serine protease  27.94 
 
 		 583 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.326819  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0816  periplasmic serine protease  27.5 
 
 		 462 aa  78.2  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0094905  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5584  serine protease  24.92 
 
 		 391 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1088  protease Do  25.61 
 
 		 498 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.648763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  27.76 
 
 		 511 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  27.92 
 
 		 458 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  27.3 
 
 		 478 aa  77.4  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2041  peptidase S1C, Do  25.18 
 
 		 498 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2247  ATPase  28.52 
 
 		 464 aa  77.4  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000505452  normal  0.0343548 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0650  peptidase S1C, Do  25.61 
 
 		 498 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1130  protease Do  25.61 
 
 		 498 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.9 
 
 		 401 aa  77.4  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000241562  unclonable  0.000000145022 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5351  serine protease  24.24 
 
 		 391 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000264065  hitchhiker  6.04762e-16 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1344  trypsin  28.68 
 
 		 594 aa  77  0.0000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0379667 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5059  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.65 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3655  periplasmic serine protease DegS  25.89 
 
 		 360 aa  77  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00040355  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0699  periplasmic serine protease DegS  26.21 
 
 		 360 aa  77  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  27.76 
 
 		 511 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  27.39 
 
 		 523 aa  76.6  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  27.76 
 
 		 511 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  25.99 
 
 		 459 aa  77  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  24.54 
 
 		 523 aa  76.6  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3272  DegS serine peptidase  25.89 
 
 		 360 aa  77  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.581371  hitchhiker  0.00106456 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0720  periplasmic serine protease DegS  25.89 
 
 		 360 aa  77  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253499 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0729  periplasmic serine protease DegS  25.89 
 
 		 360 aa  77  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.206097  normal  0.0822634 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  28.06 
 
 		 474 aa  76.6  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  25.26 
 
 		 461 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1119  protease Do  27.44 
 
 		 503 aa  76.6  0.0000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0111  2-alkenal reductase  29.67 
 
 		 348 aa  76.3  0.0000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.153202 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  25 
 
 		 476 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  26.8 
 
 		 442 aa  76.3  0.0000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  25.26 
 
 		 502 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  25.26 
 
 		 485 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>