More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1107 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1107  putative serine protease  100 
 
 		 323 aa  650    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0917977 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5059  PDZ/DHR/GLGF domain protein  71.52 
 
 		 321 aa  481  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1117  PDZ/DHR/GLGF  69.66 
 
 		 321 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0129707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3491  PDZ/DHR/GLGF  71.83 
 
 		 323 aa  472  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0744  trypsin-like serine protease  67.8 
 
 		 323 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1014  PDZ/DHR/GLGF  68.42 
 
 		 321 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4304  PDZ/DHR/GLGF  70.9 
 
 		 323 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.328087  normal  0.0388954 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2194  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  60.49 
 
 		 323 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1570  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  60.19 
 
 		 324 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.43574  normal  0.176189 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2497  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  58.31 
 
 		 323 aa  389  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4358  PDZ/DHR/GLGF domain protein  57.41 
 
 		 324 aa  381  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3887  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  56.79 
 
 		 324 aa  380  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.204863  normal  0.15793 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4255  PDZ/DHR/GLGF domain protein  56.79 
 
 		 324 aa  380  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.730819 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0797  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  55.62 
 
 		 326 aa  372  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2159  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  55.59 
 
 		 325 aa  318  7e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0222521 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0906  PDZ/DHR/GLGF domain protein  54.3 
 
 		 301 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0997368  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1051  PDZ/DHR/GLGF domain protein  53.31 
 
 		 301 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00175075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0666  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  42.72 
 
 		 384 aa  215  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1129  putative serine protease  39.67 
 
 		 355 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.247199  normal  0.0306417 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3720  PDZ/DHR/GLGF  36.69 
 
 		 354 aa  181  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.285771  normal  0.385221 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  29.04 
 
 		 511 aa  94.4  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03178  protease DO  30.24 
 
 		 446 aa  94.4  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0459704  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0553  protease Do  29.79 
 
 		 456 aa  92.8  8e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000923563  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  29 
 
 		 457 aa  91.3  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0600  PDZ/DHR/GLGF  28.62 
 
 		 353 aa  91.7  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  27.54 
 
 		 424 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0817  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.28 
 
 		 384 aa  89.4  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3540  serine endoprotease  26.41 
 
 		 356 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0189154  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4323  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.43 
 
 		 405 aa  88.6  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3612  serine endoprotease  25.89 
 
 		 356 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  27.72 
 
 		 466 aa  88.6  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3709  serine endoprotease  26.41 
 
 		 356 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.650789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  28.57 
 
 		 522 aa  88.6  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3670  serine endoprotease  28.16 
 
 		 369 aa  88.6  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.932831  normal  0.311262 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3541  serine endoprotease  26.41 
 
 		 356 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3647  serine endoprotease  26.41 
 
 		 356 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  27.15 
 
 		 385 aa  87  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  27.87 
 
 		 458 aa  87  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1216  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.92 
 
 		 401 aa  87  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2479  protease Do  29.07 
 
 		 450 aa  87  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  29.56 
 
 		 478 aa  87  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3363  periplasmic serine protease DegS  29.24 
 
 		 359 aa  86.3  7e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120953  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1946  trypsin-like serine protease  28.17 
 
 		 379 aa  86.3  7e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0709  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.4 
 
 		 388 aa  85.9  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.675227 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  29.32 
 
 		 501 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2895  2-alkenal reductase  27.18 
 
 		 389 aa  85.5  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.253415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.8 
 
 		 385 aa  85.5  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0455  serine endoprotease  26.01 
 
 		 362 aa  84.3  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000102083  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  27.24 
 
 		 464 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  25.46 
 
 		 401 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0519  serine endoprotease  26.01 
 
 		 383 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  29.64 
 
 		 500 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3690  HtrA2 peptidase  29.92 
 
 		 396 aa  85.1  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.104241  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.46 
 
 		 401 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1139  serine endoprotease  26.01 
 
 		 362 aa  84.3  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.46983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2880  periplasmic serine protease DegS  27.01 
 
 		 368 aa  84.3  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0120636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  25.46 
 
 		 401 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3643  serine endoprotease  26.13 
 
 		 354 aa  84  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2256  peptidase S1C, Do  29.08 
 
 		 498 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.46 
 
 		 401 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  30.4 
 
 		 411 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.46 
 
 		 401 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.46 
 
 		 401 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4861  protease Do  27.24 
 
 		 492 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2072  PDZ/DHR/GLGF  29.6 
 
 		 366 aa  83.6  0.000000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3784  protease Do  27.24 
 
 		 492 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  25.08 
 
 		 511 aa  83.6  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0675  DegS serine peptidase  28.52 
 
 		 360 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00601071 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  29.51 
 
 		 455 aa  83.6  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  27.74 
 
 		 525 aa  83.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  27.04 
 
 		 464 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  30.58 
 
 		 516 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_004310  BR1207  serine protease  26.64 
 
 		 474 aa  83.6  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  27.21 
 
 		 464 aa  83.2  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  24.82 
 
 		 381 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  26.64 
 
 		 474 aa  83.6  0.000000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0789  serine endoprotease  27.72 
 
 		 476 aa  82.8  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.290182 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2121  2-alkenal reductase  27.64 
 
 		 525 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0689  DegS serine peptidase  28.52 
 
 		 360 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0549825  hitchhiker  0.000493421 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2662  peptidase S1C, Do  28.82 
 
 		 491 aa  82.8  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1196  protease Do  26.06 
 
 		 451 aa  82.8  0.000000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  26.32 
 
 		 471 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  27.47 
 
 		 476 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1454  2-alkenal reductase  30.18 
 
 		 409 aa  82.4  0.000000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00925037  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1135  protease Do  27.64 
 
 		 535 aa  82.4  0.000000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0471  periplasmic serine protease DegS  26.71 
 
 		 355 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.183239  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4552  serine endoprotease  26.71 
 
 		 355 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0248117  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3943  protease DegS  28.52 
 
 		 360 aa  82  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3708  serine endoprotease  29.05 
 
 		 455 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0987273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  25.46 
 
 		 402 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3539  serine endoprotease  29.05 
 
 		 455 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0314705  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3540  serine endoprotease  29.05 
 
 		 451 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0585  PDZ/DHR/GLGF  27.84 
 
 		 406 aa  82  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000357237  normal  0.0103671 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0769  endopeptidase  26.06 
 
 		 451 aa  82  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3541  serine endoprotease  26.71 
 
 		 355 aa  82  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.360038  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2700  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.8 
 
 		 387 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  hitchhiker  0.000142466 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0471  serine endoprotease  26.71 
 
 		 355 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3272  DegS serine peptidase  27.8 
 
 		 360 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.581371  hitchhiker  0.00106456 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3531  serine endoprotease  26.71 
 
 		 355 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00943485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3718  serine endoprotease  26.71 
 
 		 355 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00613349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>