More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2159 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2159  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  100 
 
 		 325 aa  644    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0222521 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5059  PDZ/DHR/GLGF domain protein  55.35 
 
 		 321 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1107  putative serine protease  55.59 
 
 		 323 aa  334  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0917977 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3887  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  54.4 
 
 		 324 aa  330  3e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.204863  normal  0.15793 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4255  PDZ/DHR/GLGF domain protein  54.4 
 
 		 324 aa  330  3e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.730819 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1117  PDZ/DHR/GLGF  53.46 
 
 		 321 aa  328  9e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0129707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2497  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  56.09 
 
 		 323 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2194  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  54.09 
 
 		 323 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1570  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  53.77 
 
 		 324 aa  324  1e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.43574  normal  0.176189 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1014  PDZ/DHR/GLGF  52.52 
 
 		 321 aa  322  8e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4358  PDZ/DHR/GLGF domain protein  52.83 
 
 		 324 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0797  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  53.57 
 
 		 326 aa  318  5e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0744  trypsin-like serine protease  52.45 
 
 		 323 aa  317  2e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3491  PDZ/DHR/GLGF  55.03 
 
 		 323 aa  316  3e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4304  PDZ/DHR/GLGF  52.52 
 
 		 323 aa  308  9e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.328087  normal  0.0388954 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0906  PDZ/DHR/GLGF domain protein  50.66 
 
 		 301 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0997368  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1051  PDZ/DHR/GLGF domain protein  51.97 
 
 		 301 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00175075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1129  putative serine protease  41.64 
 
 		 355 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.247199  normal  0.0306417 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0666  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  42.68 
 
 		 384 aa  204  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3720  PDZ/DHR/GLGF  37.1 
 
 		 354 aa  175  8e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.285771  normal  0.385221 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  31.84 
 
 		 511 aa  100  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0709  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.08 
 
 		 388 aa  99.8  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.675227 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  29.5 
 
 		 502 aa  97.1  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1270  serine protease  26.57 
 
 		 442 aa  95.5  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000000478038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5515  2-alkenal reductase  30.57 
 
 		 383 aa  94.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.2 
 
 		 380 aa  94.4  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  30.68 
 
 		 485 aa  93.6  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1115  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.89 
 
 		 442 aa  93.2  5e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0193596  normal  0.0193298 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1183  HtrA2 peptidase  29.35 
 
 		 386 aa  93.2  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6606  HtrA2 peptidase  29.14 
 
 		 393 aa  92.8  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  28.47 
 
 		 383 aa  91.3  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0817  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.35 
 
 		 384 aa  91.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  27.95 
 
 		 504 aa  90.9  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0554  PDZ/DHR/GLGF  30 
 
 		 328 aa  91.7  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00992555  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12950  Htr-like protease  27.72 
 
 		 383 aa  90.9  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  28.06 
 
 		 502 aa  90.5  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.56 
 
 		 385 aa  90.1  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  29.63 
 
 		 513 aa  90.1  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  28.06 
 
 		 506 aa  90.1  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  28.25 
 
 		 464 aa  90.1  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0166  periplasmic serine protease  27.51 
 
 		 473 aa  89.7  6e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.358427  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0287  peptidase S1C, Do  29.82 
 
 		 465 aa  89.7  6e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  27.24 
 
 		 482 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0175  trypsin-like serine protease  31.87 
 
 		 347 aa  89  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0707716  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  29.59 
 
 		 459 aa  88.6  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  29.21 
 
 		 442 aa  88.6  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1718  protease Do  28.62 
 
 		 471 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  27.24 
 
 		 411 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1966  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  28.48 
 
 		 425 aa  87.8  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000431561  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2158  2-alkenal reductase  28.9 
 
 		 368 aa  87.8  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  27.31 
 
 		 492 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1137  protease  29.15 
 
 		 463 aa  87.4  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0382173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  28.16 
 
 		 396 aa  87.4  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  27.68 
 
 		 477 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0456  protease DegQ  29.15 
 
 		 457 aa  87.4  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000901384  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0520  protease Do  29.15 
 
 		 457 aa  87.4  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0469168  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2895  2-alkenal reductase  27.21 
 
 		 389 aa  87  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.253415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  27.31 
 
 		 477 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  26.41 
 
 		 505 aa  86.7  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1580  2-alkenal reductase  25.98 
 
 		 443 aa  86.3  6e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0204264 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1518  protease Do  28.47 
 
 		 504 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  0.157004 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0415  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.38 
 
 		 483 aa  86.3  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0111  2-alkenal reductase  32.09 
 
 		 348 aa  86.3  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.153202 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4435  trypsin domain protein  27.27 
 
 		 386 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00143811  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  27.47 
 
 		 464 aa  85.9  8e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2386  protease Do  25.82 
 
 		 491 aa  85.9  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.07 
 
 		 408 aa  85.9  9e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1782  protease Do  26.62 
 
 		 498 aa  85.5  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0747  2-alkenal reductase  29.2 
 
 		 379 aa  85.5  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0470  protease Do  28.62 
 
 		 471 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102018  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  29.63 
 
 		 477 aa  85.1  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.91 
 
 		 379 aa  85.5  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1572  peptidase S1C, Do  30.24 
 
 		 468 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0853453  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0029  serine protease  27.96 
 
 		 460 aa  85.5  0.000000000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  27.31 
 
 		 479 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3540  serine endoprotease  26.69 
 
 		 451 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4130  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  26.45 
 
 		 386 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  28.96 
 
 		 385 aa  85.1  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3539  serine endoprotease  26.69 
 
 		 455 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0314705  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0875  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.45 
 
 		 385 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3611  serine endoprotease  26.69 
 
 		 455 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.40714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0393  HtrA2 peptidase  26.53 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  27.87 
 
 		 477 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  27.87 
 
 		 477 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0414  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.78 
 
 		 481 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.75 
 
 		 412 aa  84.7  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4548  2-alkenal reductase  26.45 
 
 		 386 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0384  2-alkenal reductase  26.53 
 
 		 383 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0888  2-alkenal reductase  30.96 
 
 		 380 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3148  protease Do  32.85 
 
 		 458 aa  84.3  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3708  serine endoprotease  26.69 
 
 		 455 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0987273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3296  protease Do  26.69 
 
 		 450 aa  84  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0128319  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0590  2-alkenal reductase  27.27 
 
 		 453 aa  84  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000722472  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3965  protease Do  28 
 
 		 514 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.938465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0807  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.86 
 
 		 398 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  26.81 
 
 		 402 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0553  protease Do  27.8 
 
 		 456 aa  84  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000923563  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0752  2-alkenal reductase  28.08 
 
 		 372 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0327336 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  28.81 
 
 		 458 aa  84  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4771  protease Do  31.43 
 
 		 496 aa  83.6  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.411686  hitchhiker  0.000180606 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>