More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2158 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2158  2-alkenal reductase  100 
 
 
368 aa  724    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  43.49 
 
 
491 aa  300  2e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1135  protease Do  48.85 
 
 
535 aa  298  1e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  44.21 
 
 
528 aa  286  4e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  45.13 
 
 
487 aa  275  1.0000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  41 
 
 
537 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  45.38 
 
 
501 aa  271  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  41.23 
 
 
588 aa  269  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2539  protease Do  41.19 
 
 
578 aa  268  8e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  43.9 
 
 
501 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  42.49 
 
 
511 aa  268  1e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  42.31 
 
 
502 aa  268  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  41.88 
 
 
511 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  41.88 
 
 
511 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  44.25 
 
 
500 aa  265  8e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  40.74 
 
 
523 aa  264  1e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  42.78 
 
 
500 aa  264  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  41.14 
 
 
527 aa  264  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  44.18 
 
 
471 aa  263  4e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  40.57 
 
 
522 aa  262  6e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  45.71 
 
 
464 aa  262  8e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  41.05 
 
 
513 aa  261  8.999999999999999e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  41.05 
 
 
513 aa  261  8.999999999999999e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1394  serine protease Do, putative  41.62 
 
 
524 aa  261  1e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1350  putative serine protease Do  41.62 
 
 
524 aa  261  1e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  39.43 
 
 
516 aa  261  2e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  39.07 
 
 
526 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  42.46 
 
 
504 aa  260  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  42.66 
 
 
508 aa  260  3e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2235  protease Do  41.87 
 
 
529 aa  259  4e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355037  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  42.46 
 
 
516 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  41.1 
 
 
520 aa  259  7e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  43.62 
 
 
506 aa  259  7e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  43.62 
 
 
493 aa  258  9e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  45.27 
 
 
501 aa  258  9e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  42.64 
 
 
493 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  50.18 
 
 
496 aa  258  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  38.42 
 
 
517 aa  257  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  42.93 
 
 
483 aa  256  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  43.48 
 
 
501 aa  256  3e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  45.24 
 
 
483 aa  257  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  42.93 
 
 
483 aa  256  4e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1797  protease Do  39.88 
 
 
520 aa  255  7e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  38.52 
 
 
528 aa  255  9e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  40 
 
 
528 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  42.38 
 
 
466 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5157  protease Do  42.7 
 
 
503 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0527663 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4692  protease Do  42.7 
 
 
503 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.601387  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0434  protease Do family protein  39.69 
 
 
505 aa  253  3e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  43.27 
 
 
481 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2346  peptidase S1C, Do  40.16 
 
 
496 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.466246  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  38.42 
 
 
520 aa  253  5.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  46.43 
 
 
491 aa  251  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  41.32 
 
 
514 aa  251  1e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2725  peptidase S1C, Do  41.5 
 
 
497 aa  251  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3827  protease Do  48.52 
 
 
496 aa  250  3e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  40.64 
 
 
498 aa  249  4e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  39.6 
 
 
523 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  43.02 
 
 
508 aa  249  4e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  38.82 
 
 
523 aa  249  5e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  41.92 
 
 
457 aa  249  7e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  42.22 
 
 
476 aa  248  1e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  41.89 
 
 
501 aa  247  2e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2022  protease Do  43.07 
 
 
459 aa  248  2e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.303504 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  37.43 
 
 
474 aa  247  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  41.47 
 
 
482 aa  247  3e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4002  protease Do  42.06 
 
 
501 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4136  protease Do  48.15 
 
 
496 aa  246  4e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0924  protease Do  45.45 
 
 
527 aa  246  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.010153  normal  0.0275633 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0188  protease Do  41.18 
 
 
524 aa  246  4e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.463194 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  43.2 
 
 
485 aa  246  6.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6094  putative Serine protease do-like precursor  40.79 
 
 
498 aa  245  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  45.09 
 
 
527 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.952362 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0922  protease Do family protein  40.11 
 
 
496 aa  245  9.999999999999999e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.726985  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  39.64 
 
 
508 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  37.17 
 
 
474 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1019  peptidase S1C, Do  42.12 
 
 
525 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  43.4 
 
 
499 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  41.62 
 
 
475 aa  240  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  43.43 
 
 
509 aa  241  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2014  protease Do  42.33 
 
 
502 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  43.54 
 
 
464 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0942  protease Do  40.41 
 
 
506 aa  239  4e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681927  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  44.19 
 
 
458 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1207  serine protease  40.8 
 
 
474 aa  238  1e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  37.17 
 
 
475 aa  238  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  40.8 
 
 
474 aa  238  1e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2041  peptidase S1C, Do  41.62 
 
 
498 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3349  peptidase S1C, Do  41.74 
 
 
499 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_002978  WD0833  protease DO  39.42 
 
 
497 aa  237  2e-61  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0653734  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1773  protease Do  42.35 
 
 
489 aa  237  3e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000225032  hitchhiker  0.000850393 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3331  peptidase S1C, Do  42.9 
 
 
510 aa  236  4e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.107916  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2013  protease Do  44.28 
 
 
524 aa  236  5.0000000000000005e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316391  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  41.71 
 
 
518 aa  236  6e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  42.73 
 
 
476 aa  235  7e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1982  protease Do  41.44 
 
 
476 aa  235  8e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.358947  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  39.13 
 
 
485 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  38.31 
 
 
473 aa  234  3e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  41.4 
 
 
515 aa  233  4.0000000000000004e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3259  peptidase S1C, Do  41.5 
 
 
497 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.324344  normal  0.259222 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>