More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4358 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4358  PDZ/DHR/GLGF domain protein  100 
 
 		 324 aa  634    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4255  PDZ/DHR/GLGF domain protein  94.14 
 
 		 324 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.730819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3887  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  94.14 
 
 		 324 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.204863  normal  0.15793 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1570  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  74.38 
 
 		 324 aa  485  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.43574  normal  0.176189 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2194  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  70.68 
 
 		 323 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2497  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  69.44 
 
 		 323 aa  449  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1107  putative serine protease  57.41 
 
 		 323 aa  381  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0917977 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5059  PDZ/DHR/GLGF domain protein  58.33 
 
 		 321 aa  371  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0797  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  58.13 
 
 		 326 aa  370  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1117  PDZ/DHR/GLGF  58.33 
 
 		 321 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0129707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1014  PDZ/DHR/GLGF  56.17 
 
 		 321 aa  362  6e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3491  PDZ/DHR/GLGF  58.64 
 
 		 323 aa  362  6e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0744  trypsin-like serine protease  56.17 
 
 		 323 aa  358  7e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4304  PDZ/DHR/GLGF  56.92 
 
 		 323 aa  341  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.328087  normal  0.0388954 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0906  PDZ/DHR/GLGF domain protein  56.29 
 
 		 301 aa  340  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0997368  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1051  PDZ/DHR/GLGF domain protein  56.95 
 
 		 301 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00175075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2159  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  52.83 
 
 		 325 aa  303  4.0000000000000003e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0222521 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1129  putative serine protease  44.59 
 
 		 355 aa  223  4e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.247199  normal  0.0306417 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0666  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  43.51 
 
 		 384 aa  203  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3720  PDZ/DHR/GLGF  39.68 
 
 		 354 aa  182  6e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.285771  normal  0.385221 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  30.15 
 
 		 457 aa  102  9e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.08 
 
 		 380 aa  98.6  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  29.56 
 
 		 483 aa  97.4  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  29.56 
 
 		 483 aa  97.4  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  29.96 
 
 		 511 aa  96.7  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12950  Htr-like protease  28.57 
 
 		 383 aa  96.7  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  27.17 
 
 		 471 aa  96.3  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0709  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.07 
 
 		 388 aa  96.3  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.675227 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  28.16 
 
 		 502 aa  95.1  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  26.98 
 
 		 476 aa  94.7  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0817  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.72 
 
 		 384 aa  94  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  27.87 
 
 		 404 aa  94  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.24 
 
 		 412 aa  93.2  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0875  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.74 
 
 		 385 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4130  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  26.74 
 
 		 386 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  29.24 
 
 		 502 aa  92  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0600  PDZ/DHR/GLGF  32.07 
 
 		 353 aa  92.4  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  27.53 
 
 		 404 aa  91.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  28.42 
 
 		 513 aa  92  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4424  2-alkenal reductase  26.47 
 
 		 386 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.377382 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3148  protease Do  32.73 
 
 		 458 aa  91.3  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1301  2-alkenal reductase  26.47 
 
 		 402 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5515  2-alkenal reductase  28.63 
 
 		 383 aa  91.3  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4435  trypsin domain protein  27.11 
 
 		 386 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00143811  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  30.72 
 
 		 459 aa  91.3  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5152  protease Do  30.14 
 
 		 506 aa  91.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000102653  normal  0.175523 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4548  2-alkenal reductase  26.1 
 
 		 386 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  27.54 
 
 		 472 aa  90.1  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  30.15 
 
 		 458 aa  90.1  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  28.88 
 
 		 485 aa  89.7  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  27.46 
 
 		 398 aa  89.7  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3918  protease Do  27.33 
 
 		 508 aa  90.1  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0503  peptidase S1C, DegS  27.97 
 
 		 358 aa  90.1  5e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0125396  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  29.06 
 
 		 500 aa  90.1  5e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0908  2-alkenal reductase  26.1 
 
 		 386 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  28.68 
 
 		 464 aa  89.7  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0888  2-alkenal reductase  27.55 
 
 		 380 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  26.98 
 
 		 402 aa  89.7  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  30.15 
 
 		 476 aa  89.7  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.03 
 
 		 396 aa  89.4  7e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.68 
 
 		 385 aa  89.4  8e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  26.62 
 
 		 401 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.62 
 
 		 401 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0729  periplasmic serine protease DegS  26.81 
 
 		 360 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.206097  normal  0.0822634 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  27.18 
 
 		 403 aa  88.2  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3655  periplasmic serine protease DegS  26.81 
 
 		 360 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00040355  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0353  trypsin-like serine protease  27.58 
 
 		 583 aa  87.8  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.326819  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0720  periplasmic serine protease DegS  26.81 
 
 		 360 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253499 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0699  periplasmic serine protease DegS  26.81 
 
 		 360 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  27.7 
 
 		 411 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  27.78 
 
 		 482 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.62 
 
 		 401 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  26.62 
 
 		 401 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.62 
 
 		 401 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  28.52 
 
 		 477 aa  87.8  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30 
 
 		 366 aa  88.2  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0593  htrA protein  28.47 
 
 		 498 aa  87.4  3e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3032  Serine protease do-like precursor  32.69 
 
 		 365 aa  87.4  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.722688 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  26.62 
 
 		 388 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.62 
 
 		 401 aa  87.4  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  26.62 
 
 		 402 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01581  serine protease  27.94 
 
 		 392 aa  86.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2895  2-alkenal reductase  29.22 
 
 		 389 aa  86.7  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.253415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  28.83 
 
 		 478 aa  87  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1456  PDZ/DHR/GLGF  27.94 
 
 		 392 aa  86.7  5e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  28.81 
 
 		 442 aa  86.7  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  26.62 
 
 		 402 aa  86.3  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  26.62 
 
 		 402 aa  86.3  7e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3652  serine protease  26.62 
 
 		 402 aa  86.3  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  26.62 
 
 		 402 aa  86.3  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  24.82 
 
 		 452 aa  86.3  7e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004515  outer membrane stress sensor protease DegS  26.75 
 
 		 354 aa  85.9  8e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.497623  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6606  HtrA2 peptidase  26.79 
 
 		 393 aa  85.9  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2404  2-alkenal reductase  25.51 
 
 		 350 aa  85.9  9e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.993946  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3363  periplasmic serine protease DegS  27.6 
 
 		 359 aa  85.9  9e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120953  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  27.94 
 
 		 464 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3074  protease DegS  27.34 
 
 		 356 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.940129  normal  0.195971 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  28.25 
 
 		 466 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1718  protease Do  31.3 
 
 		 471 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  26.26 
 
 		 387 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>