More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3887 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3887  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  100 
 
 		 324 aa  632  1e-180  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.204863  normal  0.15793 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4255  PDZ/DHR/GLGF domain protein  100 
 
 		 324 aa  632  1e-180  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.730819 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4358  PDZ/DHR/GLGF domain protein  94.14 
 
 		 324 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1570  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  75.62 
 
 		 324 aa  488  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.43574  normal  0.176189 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2194  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  70.99 
 
 		 323 aa  456  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2497  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  69.44 
 
 		 323 aa  450  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1107  putative serine protease  56.79 
 
 		 323 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0917977 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1117  PDZ/DHR/GLGF  57.41 
 
 		 321 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0129707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5059  PDZ/DHR/GLGF domain protein  56.79 
 
 		 321 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0797  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  57.5 
 
 		 326 aa  365  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1014  PDZ/DHR/GLGF  54.63 
 
 		 321 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3491  PDZ/DHR/GLGF  57.1 
 
 		 323 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0744  trypsin-like serine protease  54.32 
 
 		 323 aa  348  8e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0906  PDZ/DHR/GLGF domain protein  55.63 
 
 		 301 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0997368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4304  PDZ/DHR/GLGF  54.4 
 
 		 323 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.328087  normal  0.0388954 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1051  PDZ/DHR/GLGF domain protein  56.95 
 
 		 301 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00175075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2159  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  54.4 
 
 		 325 aa  311  7.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0222521 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1129  putative serine protease  43.58 
 
 		 355 aa  220  3e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.247199  normal  0.0306417 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0666  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  42.67 
 
 		 384 aa  199  7e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3720  PDZ/DHR/GLGF  39.35 
 
 		 354 aa  179  7e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.285771  normal  0.385221 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  29.04 
 
 		 457 aa  95.1  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  29.82 
 
 		 511 aa  94  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6606  HtrA2 peptidase  27.41 
 
 		 393 aa  93.6  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  28.16 
 
 		 502 aa  92  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.01 
 
 		 380 aa  91.7  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  26.83 
 
 		 404 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  29.68 
 
 		 459 aa  90.5  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0600  PDZ/DHR/GLGF  32.19 
 
 		 353 aa  90.1  4e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  26.45 
 
 		 471 aa  90.1  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0709  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.72 
 
 		 388 aa  90.1  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.675227 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12950  Htr-like protease  27.47 
 
 		 383 aa  89.7  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  26.48 
 
 		 404 aa  89  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  27.44 
 
 		 504 aa  88.6  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  28.77 
 
 		 483 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0875  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.1 
 
 		 385 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  28.77 
 
 		 483 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.43 
 
 		 412 aa  87.8  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5152  protease Do  28.57 
 
 		 506 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000102653  normal  0.175523 
 
 
-
 
NC_002950  PG0593  htrA protein  26.92 
 
 		 498 aa  87.4  3e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4130  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  26.01 
 
 		 386 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  29.41 
 
 		 500 aa  87.8  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  28.1 
 
 		 482 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0817  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.02 
 
 		 384 aa  87.4  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4424  2-alkenal reductase  25.37 
 
 		 386 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.377382 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0908  2-alkenal reductase  25.74 
 
 		 386 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544315  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1301  2-alkenal reductase  25.37 
 
 		 402 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  28.88 
 
 		 502 aa  86.7  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4435  trypsin domain protein  26.37 
 
 		 386 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00143811  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5515  2-alkenal reductase  28.68 
 
 		 383 aa  86.3  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.33 
 
 		 385 aa  86.3  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  28.63 
 
 		 458 aa  85.9  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  25.54 
 
 		 476 aa  85.9  9e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  27.66 
 
 		 474 aa  85.1  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  29.35 
 
 		 506 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4548  2-alkenal reductase  25.37 
 
 		 386 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  27.74 
 
 		 474 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  27.74 
 
 		 442 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  29.56 
 
 		 481 aa  85.5  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  26.71 
 
 		 411 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0888  2-alkenal reductase  27.17 
 
 		 380 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3918  protease Do  25.57 
 
 		 508 aa  84  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  26.98 
 
 		 513 aa  84  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  27.37 
 
 		 479 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  27.92 
 
 		 479 aa  83.6  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  29.55 
 
 		 485 aa  84  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  25.78 
 
 		 403 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2895  2-alkenal reductase  28.83 
 
 		 389 aa  83.2  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.253415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  28.09 
 
 		 464 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  26.45 
 
 		 472 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0503  peptidase S1C, DegS  28.36 
 
 		 358 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0125396  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.6 
 
 		 408 aa  82.8  0.000000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2404  2-alkenal reductase  24.83 
 
 		 350 aa  82.8  0.000000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.993946  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  29.27 
 
 		 477 aa  82.4  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  25.75 
 
 		 402 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0530  protease Do  31.21 
 
 		 457 aa  82.4  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  27.74 
 
 		 473 aa  81.6  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1456  PDZ/DHR/GLGF  27.13 
 
 		 392 aa  82  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  25.7 
 
 		 398 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  25.37 
 
 		 401 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.64 
 
 		 396 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01581  serine protease  27.13 
 
 		 392 aa  82  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.37 
 
 		 401 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  26.35 
 
 		 482 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3148  protease Do  32 
 
 		 458 aa  81.6  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  25.37 
 
 		 401 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  26.99 
 
 		 464 aa  81.6  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0720  periplasmic serine protease DegS  26.5 
 
 		 360 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253499 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3655  periplasmic serine protease DegS  26.5 
 
 		 360 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00040355  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0729  periplasmic serine protease DegS  26.5 
 
 		 360 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.206097  normal  0.0822634 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.37 
 
 		 401 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0699  periplasmic serine protease DegS  26.5 
 
 		 360 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.37 
 
 		 401 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  27.37 
 
 		 464 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1718  protease Do  30.89 
 
 		 471 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0353  trypsin-like serine protease  26.36 
 
 		 583 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.326819  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0845  peptidase S1  25.48 
 
 		 471 aa  80.5  0.00000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.37 
 
 		 401 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  28.31 
 
 		 476 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  27.51 
 
 		 466 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1463  protease Do  27.7 
 
 		 467 aa  80.1  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.819915  normal  0.415171 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>