More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3491 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3491  PDZ/DHR/GLGF  100 
 
 		 323 aa  643    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0744  trypsin-like serine protease  82.35 
 
 		 323 aa  546  1e-154  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1107  putative serine protease  71.83 
 
 		 323 aa  486  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0917977 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5059  PDZ/DHR/GLGF domain protein  73.07 
 
 		 321 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4304  PDZ/DHR/GLGF  76.47 
 
 		 323 aa  481  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.328087  normal  0.0388954 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1117  PDZ/DHR/GLGF  73.37 
 
 		 321 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0129707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1014  PDZ/DHR/GLGF  73.07 
 
 		 321 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2194  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  61.11 
 
 		 323 aa  387  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0797  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  57.5 
 
 		 326 aa  371  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2497  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  58.64 
 
 		 323 aa  374  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4358  PDZ/DHR/GLGF domain protein  58.64 
 
 		 324 aa  371  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1570  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  58.33 
 
 		 324 aa  368  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.43574  normal  0.176189 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3887  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  57.1 
 
 		 324 aa  363  2e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.204863  normal  0.15793 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4255  PDZ/DHR/GLGF domain protein  57.1 
 
 		 324 aa  363  2e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.730819 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2159  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  55.03 
 
 		 325 aa  314  1.9999999999999998e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0222521 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0906  PDZ/DHR/GLGF domain protein  53.29 
 
 		 301 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0997368  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1051  PDZ/DHR/GLGF domain protein  53.29 
 
 		 301 aa  278  9e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00175075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0666  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  42.99 
 
 		 384 aa  198  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1129  putative serine protease  41.95 
 
 		 355 aa  192  5e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.247199  normal  0.0306417 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3720  PDZ/DHR/GLGF  39.55 
 
 		 354 aa  174  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.285771  normal  0.385221 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  31.58 
 
 		 511 aa  98.6  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03178  protease DO  28.52 
 
 		 446 aa  87.8  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0459704  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0410  protease Do  28.77 
 
 		 474 aa  87  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.134213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  29.67 
 
 		 476 aa  86.7  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2895  2-alkenal reductase  28.47 
 
 		 389 aa  85.5  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.253415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0817  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.87 
 
 		 384 aa  85.1  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  27.11 
 
 		 511 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0709  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.18 
 
 		 388 aa  83.6  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.675227 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  28.41 
 
 		 502 aa  83.2  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  27.54 
 
 		 502 aa  82.8  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1216  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.49 
 
 		 401 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  30.97 
 
 		 525 aa  82.4  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  28.41 
 
 		 457 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  29.15 
 
 		 508 aa  82  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  24.93 
 
 		 412 aa  82  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  28.62 
 
 		 464 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  29.26 
 
 		 522 aa  81.3  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  26.33 
 
 		 395 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2857  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.76 
 
 		 394 aa  80.9  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0295  serine endoprotease  24.6 
 
 		 365 aa  80.9  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.11655  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  27.34 
 
 		 476 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1139  serine endoprotease  25.39 
 
 		 362 aa  80.1  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.46983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0455  serine endoprotease  25.39 
 
 		 362 aa  80.1  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000102083  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0519  serine endoprotease  25.39 
 
 		 383 aa  80.5  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3709  serine endoprotease  25.66 
 
 		 356 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.650789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3541  serine endoprotease  25.66 
 
 		 356 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3540  serine endoprotease  25.66 
 
 		 356 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0189154  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3612  serine endoprotease  25.66 
 
 		 356 aa  80.5  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3647  serine endoprotease  25.66 
 
 		 356 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2022  protease Do  29.58 
 
 		 459 aa  80.1  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.303504 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0288  serine endoprotease  24.92 
 
 		 370 aa  79.3  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.275018  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6606  HtrA2 peptidase  27.78 
 
 		 393 aa  79.3  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  29.21 
 
 		 523 aa  79.3  0.00000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0403  protease Do  26.64 
 
 		 483 aa  78.6  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.149111  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0476  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.63 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236131  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0553  protease Do  28.93 
 
 		 456 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000923563  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  28.47 
 
 		 500 aa  78.2  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1196  protease Do  25.95 
 
 		 451 aa  77.8  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  26.58 
 
 		 464 aa  78.2  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3784  protease Do  28.24 
 
 		 492 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4861  protease Do  28.24 
 
 		 492 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0769  endopeptidase  25.95 
 
 		 451 aa  77.4  0.0000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2422  peptidase S1C, Do  29.1 
 
 		 501 aa  77.8  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  27.21 
 
 		 466 aa  77  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2256  peptidase S1C, Do  29.52 
 
 		 498 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0675  serine protease  28.73 
 
 		 495 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1392  protease Do  23.72 
 
 		 493 aa  77  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.29 
 
 		 379 aa  77  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0743  2-alkenal reductase  27.59 
 
 		 361 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.107193  normal  0.305104 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  28.25 
 
 		 506 aa  76.6  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3670  serine endoprotease  26.44 
 
 		 369 aa  76.3  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.932831  normal  0.311262 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  27.54 
 
 		 464 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2439  serine protease  28.73 
 
 		 483 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0605  serine protease  28.73 
 
 		 483 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0310  serine protease  28.73 
 
 		 495 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.636573  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1012  serine protease  28.73 
 
 		 495 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5515  2-alkenal reductase  28.62 
 
 		 383 aa  76.3  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0853  serine protease  28.73 
 
 		 495 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  28.99 
 
 		 385 aa  76.3  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0053  serine protease  28.73 
 
 		 483 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3363  periplasmic serine protease DegS  29.81 
 
 		 359 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120953  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0848  serine protease  28.73 
 
 		 495 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580249  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2700  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.39 
 
 		 387 aa  75.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  hitchhiker  0.000142466 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0837  protease Do  26.62 
 
 		 502 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  26.94 
 
 		 504 aa  75.9  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0471  periplasmic serine protease DegS  25.08 
 
 		 355 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.183239  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  24.38 
 
 		 402 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3424  serine endoprotease  25.08 
 
 		 355 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.109706  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0229  serine endoprotease  26.74 
 
 		 475 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3531  serine endoprotease  25.08 
 
 		 355 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00943485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3718  serine endoprotease  25.08 
 
 		 355 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00613349  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0246  serine endoprotease  26.74 
 
 		 475 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.561258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.24 
 
 		 385 aa  75.5  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  26.26 
 
 		 476 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0248  serine endoprotease  26.74 
 
 		 478 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0230  serine endoprotease  26.74 
 
 		 478 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3541  serine endoprotease  25.08 
 
 		 355 aa  75.5  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.360038  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4552  serine endoprotease  25.08 
 
 		 355 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0248117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0232  serine endoprotease  26.74 
 
 		 475 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0586414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  23.75 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>