More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0133 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0133  diguanylate cyclase  100 
 
 		 294 aa  607  9.999999999999999e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.469919 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3023  diguanylate cyclase  32.23 
 
 		 362 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1889  diguanylate cyclase  38.51 
 
 		 714 aa  122  8e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.838759  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4684  GGDEF domain-containing protein  33.46 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1937  diguanylate cyclase  37.1 
 
 		 775 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1377  diguanylate cyclase  29.21 
 
 		 368 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0758  diguanylate cyclase  27.91 
 
 		 404 aa  116  5e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.017578  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1928  diguanylate cyclase  36.57 
 
 		 365 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.851461 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1702  diguanylate cyclase  30.39 
 
 		 370 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0273  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.16 
 
 		 1078 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1085  diguanylate cyclase  28.85 
 
 		 357 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0691  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.78 
 
 		 686 aa  113  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.343759  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02658  GGDEF domain protein  30.48 
 
 		 366 aa  113  5e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2092  response regulator receiver protein  39.06 
 
 		 459 aa  112  8.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000936351  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1497  putative GAF sensor protein  38.92 
 
 		 689 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0836  diguanylate cyclase  38.01 
 
 		 487 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.975884  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0266  diguanylate cyclase  38.82 
 
 		 942 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.955306  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3391  diguanylate cyclase  30.14 
 
 		 360 aa  110  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.372073  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2518  diguanylate cyclase  31.58 
 
 		 372 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.165269  normal  0.0137006 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3961  diguanylate cyclase  31.01 
 
 		 340 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.042208 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0891  diguanylate cyclase  29.74 
 
 		 332 aa  108  9.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.492307 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0636  diguanylate cyclase  34.64 
 
 		 559 aa  107  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.445559  normal  0.916917 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2469  diguanylate cyclase  38.41 
 
 		 351 aa  107  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0697  diguanylate cyclase  36.47 
 
 		 482 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000140018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4493  diguanylate cyclase  32.26 
 
 		 332 aa  106  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0058  diguanylate cyclase  35.48 
 
 		 565 aa  106  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.714624  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3762  diguanylate cyclase  31.76 
 
 		 368 aa  106  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.742847  normal  0.824996 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2422  diguanylate cyclase  37.42 
 
 		 532 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1366  diguanylate cyclase  37.22 
 
 		 369 aa  105  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.112308 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0569  diguanylate cyclase  29 
 
 		 403 aa  106  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2179  diguanylate cyclase  39.52 
 
 		 477 aa  106  6e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000210421  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3325  diguanylate cyclase  36.47 
 
 		 482 aa  105  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.662914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1399  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.19 
 
 		 476 aa  105  7e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1537  diguanylate cyclase  31.02 
 
 		 381 aa  105  7e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3638  diguanylate cyclase  33.52 
 
 		 378 aa  105  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.882001  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3427  putative diguanylate cyclase (GGDEF)  32.33 
 
 		 368 aa  105  8e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000401587 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0843  diguanylate cyclase  33.52 
 
 		 384 aa  105  8e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3509  diguanylate cyclase  33.52 
 
 		 384 aa  105  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.604082  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2750  diguanylate cyclase  29.48 
 
 		 380 aa  105  9e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1063  diguanylate cyclase  36.99 
 
 		 458 aa  105  9e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.868006  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1934  hypothetical protein  37.35 
 
 		 634 aa  105  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3437  diguanylate cyclase  35.12 
 
 		 483 aa  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0184931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0220  diguanylate cyclase  37.42 
 
 		 539 aa  105  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.454807  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2835  response regulator receiver domain-containing protein  30 
 
 		 346 aa  104  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.157532  normal  0.231861 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0443  diguanylate cyclase  34.57 
 
 		 378 aa  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2527  diguanylate cyclase  36.71 
 
 		 381 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.060153 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1346  sensory box/GGDEF domain protein  37.2 
 
 		 425 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1733  diguanylate cyclase  36.69 
 
 		 464 aa  103  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000546701  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0379  diguanylate cyclase  38.83 
 
 		 540 aa  104  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1695  diguanylate cyclase  36.59 
 
 		 753 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.560166  normal  0.428473 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2959  GGDEF domain-containing protein  40.94 
 
 		 292 aa  104  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000656128  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0333  GGDEF domain-containing protein  31.41 
 
 		 364 aa  103  3e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0854  diguanylate cyclase  34.91 
 
 		 507 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.485181  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3115  diguanylate cyclase  38.32 
 
 		 354 aa  103  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.276087 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2157  diguanylate cyclase  31.45 
 
 		 372 aa  103  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000200238  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2156  diguanylate cyclase  36 
 
 		 470 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.117189 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3522  diguanylate cyclase  39.29 
 
 		 636 aa  103  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.890826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2970  diguanylate cyclase  27.33 
 
 		 557 aa  102  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.853836 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0842  diguanylate cyclase with extracellular sensor  34.91 
 
 		 484 aa  102  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.105968  hitchhiker  0.00226884 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4245  GGDEF domain-containing protein  41.32 
 
 		 477 aa  102  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2353  GGDEF domain-containing protein  38.36 
 
 		 288 aa  102  7e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.803943 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0645  diguanylate cyclase  36.61 
 
 		 659 aa  102  7e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1834  diguanylate cyclase  40.12 
 
 		 525 aa  102  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.245567  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0509  diguanylate cyclase  36.47 
 
 		 498 aa  102  9e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00480754 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0841  GGDEF domain-containing protein  35.12 
 
 		 489 aa  101  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1157  PAS:GGDEF  38.36 
 
 		 418 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal  0.862731 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001647  sensory box/GGDEF family protein  36.47 
 
 		 626 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00111686  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1211  diguanylate cyclase  30.63 
 
 		 381 aa  101  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.59 
 
 		 454 aa  101  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0452  putative GGDEF protein  37.42 
 
 		 528 aa  101  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1896  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.32 
 
 		 564 aa  100  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000133427  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1916  diguanylate cyclase  37.04 
 
 		 736 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1880  diguanylate cyclase  35 
 
 		 477 aa  101  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0268707  normal  0.0491745 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1056  diguanylate cyclase  37.36 
 
 		 580 aa  100  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.77678  normal  0.689214 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0819  diguanylate cyclase  34.32 
 
 		 507 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00531525  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3648  formamidopyrimidine-DNA glycolase  35.29 
 
 		 435 aa  100  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2123  diguanylate cyclase  36.51 
 
 		 635 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00833547 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3102  GGDEF domain-containing protein  35.93 
 
 		 580 aa  100  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01667  sensory box/GGDEF domain protein  31.61 
 
 		 304 aa  100  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.753306  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2119  response regulatory protein  29.29 
 
 		 371 aa  100  3e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0471  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.07 
 
 		 572 aa  100  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.634401  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4369  sensor diguanylate cyclase  32.79 
 
 		 569 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.399197 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2364  diguanylate cyclase  36.31 
 
 		 351 aa  100  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000850784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1510  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  41.67 
 
 		 581 aa  100  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.865852  normal  0.193576 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0138  diguanylate cyclase  37.27 
 
 		 355 aa  100  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.508736 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1123  diguanylate cyclase  36.36 
 
 		 357 aa  99.8  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0998424  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2999  diguanylate cyclase  32.54 
 
 		 548 aa  99.8  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3835  diguanylate cyclase  34.08 
 
 		 316 aa  100  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0797  diguanylate cyclase  33.52 
 
 		 408 aa  99.8  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.71948  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2189  diguanylate cyclase with GAF sensor  36.69 
 
 		 415 aa  99.8  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3376  GGDEF/response regulator receiver domain-containing protein  36.16 
 
 		 308 aa  99.4  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12380  diguanylate cyclase  38.55 
 
 		 499 aa  99.4  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00534046  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0265  diguanylate cyclase  36.36 
 
 		 456 aa  99.4  6e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56280  hypothetical protein  31.32 
 
 		 375 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1546  diguanylate cyclase  35.84 
 
 		 416 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0539589  hitchhiker  0.00796281 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1752  diguanylate cyclase  38.89 
 
 		 718 aa  99.4  7e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.972307  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0196  diguanylate cyclase  32.65 
 
 		 356 aa  99  8e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0840  diguanylate cyclase  36.93 
 
 		 411 aa  99  8e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3227  diguanylate cyclase  28.52 
 
 		 359 aa  99  8e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.709302  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3305  diguanylate cyclase  33 
 
 		 286 aa  99  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.33883 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>