117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2070 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2070  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  100 
 
 		 213 aa  441  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0454462 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1237  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  96.23 
 
 		 223 aa  423  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0422665  normal  0.190035 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5427  thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  82.18 
 
 		 202 aa  357  5e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2499  hypothetical protein  38.75 
 
 		 202 aa  99  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1069  hypothetical protein  29.9 
 
 		 199 aa  95.1  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.319185  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3127  hypothetical protein  36.41 
 
 		 213 aa  93.2  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0803  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  34.16 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1052  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  32.47 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1459  sulfopyruvate decarboxylase subunit beta  31.94 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.417982  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1624  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  40.4 
 
 		 187 aa  77.8  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1162  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  30.91 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4015  phosphonopyruvate decarboxylase  32.2 
 
 		 398 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.764027 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1809  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  33.11 
 
 		 399 aa  72.4  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0361229  normal  0.074249 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3399  phosphonopyruvate decarboxylase  31.63 
 
 		 398 aa  72  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2976  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  33.54 
 
 		 373 aa  72  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4472  phosphonopyruvate decarboxylase  31.61 
 
 		 395 aa  72  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110205  normal  0.598116 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1915  thiamine pyrophosphate enzyme, putative 3-phosphonopyruvate decarboxylase  32.12 
 
 		 393 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3534  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.61 
 
 		 393 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3414  phosphonopyruvate decarboxylase protein  29.45 
 
 		 380 aa  71.2  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4246  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  31.63 
 
 		 398 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4120  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.63 
 
 		 398 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.183201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1219  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  26.71 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1414  phosphonopyruvate decarboxylase, putative  28.17 
 
 		 378 aa  69.7  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1717  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  26.25 
 
 		 185 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0982  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  25.62 
 
 		 185 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0238706  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3821  phosphonopyruvate decarboxylase  31.75 
 
 		 394 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.416111 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0964  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.69 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0991  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  25.34 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2117  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  30.72 
 
 		 372 aa  65.1  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1769  3-phosphonopyruvate decarboxylase  37.5 
 
 		 372 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0759  3-phosphonopyruvate decarboxylase  37.5 
 
 		 372 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.762667  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1052  3-phosphonopyruvate decarboxylase  37.5 
 
 		 372 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5998  phosphonopyruvate decarboxylase  31.03 
 
 		 387 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.412851 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2064  3-phosphonopyruvate decarboxylase  34.78 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265717  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6413  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.62 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.53225 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0779  3-phosphonopyruvate decarboxylase  34.78 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0690  3-phosphonopyruvate decarboxylase  34.78 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1909  3-phosphonopyruvate decarboxylase  37.14 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6125  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.62 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3542  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha / sulfopyruvate decarboxylase subunit beta  31.69 
 
 		 382 aa  62.4  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0505956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5664  phosphonopyruvate decarboxylase  33.87 
 
 		 373 aa  62.4  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.399096 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2977  phosphonopyruvate decarboxylase  32.5 
 
 		 392 aa  62  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2733  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.58 
 
 		 370 aa  60.1  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5917  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.29 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0854932  normal  0.161715 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2234  putative thiamine pyrophosphate enzyme  38.04 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1402  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  27.34 
 
 		 184 aa  57  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00264057 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0112  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.51 
 
 		 373 aa  56.6  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0477  phosphonopyruvate decarboxylase  36.56 
 
 		 384 aa  53.5  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0573  phosphonopyruvate decarboxylase  37.08 
 
 		 384 aa  53.1  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2177  sulfopyruvate decarboxylase  27.14 
 
 		 198 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.315174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2122  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  26.67 
 
 		 584 aa  51.2  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6790  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  27.46 
 
 		 198 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1316  thiamine pyrophosphate enzyme  29.25 
 
 		 384 aa  48.5  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0538  hypothetical protein  37.66 
 
 		 530 aa  47.8  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1448  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.83 
 
 		 507 aa  47.8  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000936916  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2723  thiamine pyrophosphate protein central region  30.28 
 
 		 596 aa  47.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.974431 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0284  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  27.23 
 
 		 579 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.600747  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6662  putative sulfopyruvate decarboxylase beta subunit  33.56 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.754247 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3594  hypothetical protein  28.97 
 
 		 541 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.234761  normal  0.928094 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1330  hypothetical protein  34.65 
 
 		 561 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2500  hypothetical protein  34.65 
 
 		 557 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.844466  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0313  hypothetical protein  34.65 
 
 		 561 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0601797  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0589  hypothetical protein  34.65 
 
 		 557 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.934212  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1313  hypothetical protein  34.65 
 
 		 557 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0237102  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1240  hypothetical protein  34.65 
 
 		 557 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0978  hypothetical protein  34.65 
 
 		 557 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10094  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1495  hypothetical protein  34.65 
 
 		 557 aa  45.4  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3808  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  37.39 
 
 		 582 aa  45.4  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3664  hypothetical protein  32.67 
 
 		 555 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4097  hypothetical protein  32.67 
 
 		 555 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357485  normal  0.57528 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4703  hypothetical protein  32.67 
 
 		 555 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00302923  normal  0.177338 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01410  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  29.6 
 
 		 591 aa  44.3  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5597  hypothetical protein  32.67 
 
 		 555 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.410297 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4562  hypothetical protein  32.67 
 
 		 555 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.167245  hitchhiker  0.00212145 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1531  pyruvate dehydrogenase  27.91 
 
 		 576 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.885242  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1703  hypothetical protein  27.78 
 
 		 558 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1143  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  27.95 
 
 		 516 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1023  benzoylformate decarboxylase  28.27 
 
 		 529 aa  43.9  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.624401 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3990  hypothetical protein  32.67 
 
 		 555 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298982  normal  0.0224139 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4284  hypothetical protein  27.78 
 
 		 541 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3510  hypothetical protein  26.7 
 
 		 531 aa  43.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2858  pyruvate dehydrogenase  29.63 
 
 		 573 aa  43.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46120  hypothetical protein  32.41 
 
 		 533 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624787  normal  0.341873 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5047  benzoylformate decarboxylase  30.95 
 
 		 533 aa  43.1  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.133347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5205  pyruvate dehydrogenase  30.66 
 
 		 573 aa  43.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.799967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1564  pyruvate dehydrogenase  30.97 
 
 		 577 aa  43.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.48094  normal  0.707647 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1843  pyruvate dehydrogenase  30.97 
 
 		 577 aa  43.5  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.528367  normal  0.413476 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0181  hypothetical protein  31.68 
 
 		 552 aa  42.4  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2937  hypothetical protein  27.97 
 
 		 543 aa  42.4  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0581  acetolactate synthase catalytic subunit  26.85 
 
 		 554 aa  42.4  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188542  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7065  hypothetical protein  31.68 
 
 		 552 aa  42.4  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0234847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2172  thiamine pyrophosphate enzyme family protein  34.72 
 
 		 721 aa  42  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.531587  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1111  hypothetical protein  31.68 
 
 		 555 aa  42.4  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0531038  normal  0.265542 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0705  benzoylformate decarboxylase  26.09 
 
 		 539 aa  42  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214381  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3896  hypothetical protein  29.14 
 
 		 513 aa  42  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5157  pyruvate dehydrogenase  30.66 
 
 		 573 aa  42  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4140  pyruvate dehydrogenase  29.63 
 
 		 573 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3312  pyruvate dehydrogenase  30.66 
 
 		 573 aa  42  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653262  normal  0.0298964 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5095  pyruvate dehydrogenase  32.12 
 
 		 573 aa  42  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0038503 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3125  pyruvate dehydrogenase  40.23 
 
 		 574 aa  42  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.765369  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>