More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3510 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B3510  hypothetical protein  100 
 
 
531 aa  1053    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3896  hypothetical protein  89.69 
 
 
513 aa  893    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1933  hypothetical protein  59.11 
 
 
513 aa  540  9.999999999999999e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2860  hypothetical protein  58.28 
 
 
508 aa  519  1e-146  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2852  hypothetical protein  56.43 
 
 
515 aa  520  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0755  hypothetical protein  55.02 
 
 
514 aa  510  1e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.921366 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0899  hypothetical protein  53.17 
 
 
537 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.146101 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2713  hypothetical protein  55.32 
 
 
515 aa  498  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4594  hypothetical protein  55.81 
 
 
514 aa  491  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.456101  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1895  hypothetical protein  52.42 
 
 
514 aa  484  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1808  hypothetical protein  52.05 
 
 
514 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.62822  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2090  hypothetical protein  51.26 
 
 
518 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1554  hypothetical protein  53.01 
 
 
513 aa  469  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270354  normal  0.872181 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2212  hypothetical protein  50.87 
 
 
518 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.976757  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3016  hypothetical protein  52.71 
 
 
514 aa  462  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3384  hypothetical protein  51.06 
 
 
515 aa  462  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.549431  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0107  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  53.58 
 
 
519 aa  462  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6653  hypothetical protein  51.06 
 
 
516 aa  458  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.895478  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3930  hypothetical protein  52.43 
 
 
514 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12121  normal  0.390263 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3688  hypothetical protein  52.23 
 
 
515 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1143  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  51.84 
 
 
516 aa  456  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4260  hypothetical protein  51.93 
 
 
512 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.44702 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2345  hypothetical protein  48.45 
 
 
552 aa  449  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3491  hypothetical protein  47.56 
 
 
529 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.704588  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30230  hypothetical protein  52.02 
 
 
519 aa  444  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2811  hypothetical protein  49.03 
 
 
551 aa  437  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.193818  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2070  hypothetical protein  50.1 
 
 
518 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2570  hypothetical protein  47.6 
 
 
529 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.708956  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3488  hypothetical protein  48.46 
 
 
555 aa  425  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.104539  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3134  hypothetical protein  46.92 
 
 
527 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.673748  normal  0.335659 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4676  hypothetical protein  48.46 
 
 
553 aa  420  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432093  normal  0.637803 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1545  hypothetical protein  50.57 
 
 
531 aa  420  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3003  hypothetical protein  49.13 
 
 
512 aa  416  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13543  hypothetical protein  51.36 
 
 
515 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.26797e-96  hitchhiker  0.000000374579 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5213  hypothetical protein  50.38 
 
 
519 aa  402  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.72595  normal  0.171828 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4353  hypothetical protein  46.02 
 
 
513 aa  384  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2118  hypothetical protein  46.79 
 
 
517 aa  385  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6728  hypothetical protein  46.3 
 
 
526 aa  346  6e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1601  hypothetical protein  35.65 
 
 
506 aa  190  4e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0743  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.63 
 
 
551 aa  159  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.341364 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0714  benzoylformate decarboxylase  30.8 
 
 
536 aa  146  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.331157 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1023  benzoylformate decarboxylase  28.84 
 
 
529 aa  146  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.624401 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5914  benzoylformate decarboxylase  30.33 
 
 
535 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89681  predicted protein  32.4 
 
 
652 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.574847 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0944  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding protein  29.7 
 
 
527 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000374916  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2607  benzoylformate decarboxylase  30.28 
 
 
535 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.955084  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2631  benzoylformate decarboxylase  29.85 
 
 
535 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2583  benzoylformate decarboxylase  30.09 
 
 
535 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.380504  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2502  benzoylformate decarboxylase  29.49 
 
 
535 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.745207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1644  putative thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  26.07 
 
 
554 aa  139  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1191  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  27.52 
 
 
545 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.492896  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0705  benzoylformate decarboxylase  28.81 
 
 
539 aa  136  8e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214381  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6157  benzoylformate decarboxylase  29.72 
 
 
537 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830904  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0890  benzoylformate decarboxylase  29.55 
 
 
539 aa  134  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1048  benzoylformate decarboxylase  29.55 
 
 
539 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1896  benzoylformate decarboxylase  29.07 
 
 
529 aa  133  6.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0887  benzoylformate decarboxylase  29.55 
 
 
539 aa  133  9e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.152058  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0346  benzoylformate decarboxylase  29.46 
 
 
539 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5047  benzoylformate decarboxylase  28.47 
 
 
533 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.133347  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2480  benzoylformate decarboxylase  29.46 
 
 
539 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.20481  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1999  benzoylformate decarboxylase  30.15 
 
 
529 aa  133  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.563871 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0645  benzoylformate decarboxylase  29.46 
 
 
539 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0521172  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0093  benzoylformate decarboxylase  29.46 
 
 
539 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152709  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0308  benzoylformate decarboxylase  30.2 
 
 
528 aa  126  9e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0935953  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3699  benzoylformate decarboxylase  27.86 
 
 
540 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637419  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2941  benzoylformate decarboxylase  29.38 
 
 
528 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1679  benzoylformate decarboxylase  27.7 
 
 
518 aa  119  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1545  benzoylformate decarboxylase  28.47 
 
 
548 aa  116  8.999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.936505  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0820  thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  36.26 
 
 
589 aa  115  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.155153  unclonable  0.0000131955 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1705  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  28.68 
 
 
540 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  23.73 
 
 
552 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1594  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  25.25 
 
 
499 aa  114  5e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000232472 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3938  benzoylformate decarboxylase  27.29 
 
 
540 aa  114  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23105  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1761  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  26.43 
 
 
559 aa  110  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.15439  hitchhiker  0.00802646 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5039  acetolactate synthase large subunit  27.95 
 
 
611 aa  110  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.818274  normal  0.707988 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1424  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  29.32 
 
 
536 aa  110  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2758  thiamine pyrophosphate protein central region  30.69 
 
 
540 aa  109  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2867  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  36.98 
 
 
542 aa  104  5e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4704  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  30.24 
 
 
568 aa  103  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0101  acetolactate synthase  26.39 
 
 
547 aa  103  8e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal  0.539081 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0451  acetolactate synthase, large subunit  25.91 
 
 
549 aa  100  6e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1203  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.72 
 
 
584 aa  100  8e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2037  thiamine pyrophosphate protein  24.6 
 
 
549 aa  99.4  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1851  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.86 
 
 
566 aa  96.7  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3250  thiamine pyrophosphate protein  25.97 
 
 
552 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0654784  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38200  thiamine pyrophosphate protein  23.9 
 
 
552 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112999 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3397  acetolactate synthase  23.89 
 
 
556 aa  95.1  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1108  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.22 
 
 
489 aa  94.4  5e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0811747  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5104  acetolactate synthase catalytic subunit  25.35 
 
 
562 aa  94  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.127246 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2455  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  38.75 
 
 
562 aa  94  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.521664  normal  0.561041 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1088  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  24.48 
 
 
533 aa  93.6  8e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.703546  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2750  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  36.09 
 
 
562 aa  92  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1536  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  28.36 
 
 
582 aa  92.4  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2477  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  27.27 
 
 
543 aa  92.4  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374586  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2527  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  36.09 
 
 
562 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8307  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  27.12 
 
 
552 aa  92.8  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1617  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  36.9 
 
 
562 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0020174 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1826  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  25.46 
 
 
546 aa  91.3  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.339659  normal  0.631348 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0534  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  27 
 
 
565 aa  90.9  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3840  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  26.57 
 
 
546 aa  90.5  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>