More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3594 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2937  hypothetical protein  81.89 
 
 		 543 aa  888    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1703  hypothetical protein  93.35 
 
 		 558 aa  992    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1693  hypothetical protein  82.07 
 
 		 541 aa  899    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3594  hypothetical protein  100 
 
 		 541 aa  1088    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.234761  normal  0.928094 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4284  hypothetical protein  90.39 
 
 		 541 aa  977    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5385  hypothetical protein  53.06 
 
 		 542 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366398  normal  0.452356 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3590  hypothetical protein  51.84 
 
 		 541 aa  539  9.999999999999999e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.291615  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1689  hypothetical protein  50.09 
 
 		 547 aa  497  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4300  hypothetical protein  39.71 
 
 		 569 aa  339  9.999999999999999e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.422617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.86 
 
 		 552 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0450  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  37.27 
 
 		 534 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0538  hypothetical protein  34.95 
 
 		 530 aa  270  5e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  33.09 
 
 		 563 aa  258  1e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1674  acetolactate synthase catalytic subunit  32.84 
 
 		 587 aa  258  2e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0954  acetolactate synthase catalytic subunit  32.97 
 
 		 587 aa  257  3e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4471  hypothetical protein  33.09 
 
 		 545 aa  257  4e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.658207  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1543  acetolactate synthase catalytic subunit  33.52 
 
 		 587 aa  257  5e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  32.57 
 
 		 599 aa  256  7e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.12 
 
 		 553 aa  255  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1141  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.18 
 
 		 565 aa  254  3e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  33.69 
 
 		 588 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  32.32 
 
 		 566 aa  253  8.000000000000001e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  32.84 
 
 		 587 aa  252  1e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0231  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.16 
 
 		 582 aa  252  1e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329619  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.78 
 
 		 557 aa  252  1e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1296  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.12 
 
 		 563 aa  251  3e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2516  acetolactate synthase, large subunit  33.27 
 
 		 542 aa  249  8e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000744784  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.16 
 
 		 562 aa  249  9e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.21 
 
 		 565 aa  249  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3347  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.07 
 
 		 561 aa  248  1e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.18132  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1170  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.26 
 
 		 583 aa  249  1e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4046  thiamine pyrophosphate protein central region  32.7 
 
 		 587 aa  248  3e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.26689  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1092  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.59 
 
 		 600 aa  247  3e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.14 
 
 		 554 aa  247  4e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2258  acetolactate synthase, large subunit  34.42 
 
 		 569 aa  245  9.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10830  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.61 
 
 		 555 aa  245  9.999999999999999e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  31.94 
 
 		 567 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1549  hypothetical protein  30.52 
 
 		 580 aa  244  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.607866 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3531  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.75 
 
 		 575 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3401  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.75 
 
 		 575 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2932  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.75 
 
 		 593 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2183  hypothetical protein  33.6 
 
 		 535 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2482  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.15 
 
 		 561 aa  244  3e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246138  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0666  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.57 
 
 		 552 aa  244  3.9999999999999997e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3430  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.3 
 
 		 574 aa  244  3.9999999999999997e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.646845  normal  0.0217288 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.77 
 
 		 566 aa  243  5e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4383  thiamine pyrophosphate protein central region  32.81 
 
 		 578 aa  242  1e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00140196  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1929  acetolactate synthase catalytic subunit  32.31 
 
 		 572 aa  242  1e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.39 
 
 		 558 aa  242  1e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  31.72 
 
 		 552 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2840  hypothetical protein  34.07 
 
 		 545 aa  241  2e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5914  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.1 
 
 		 588 aa  241  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2040  hypothetical protein  32.4 
 
 		 535 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.463751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1443  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.01 
 
 		 559 aa  241  2.9999999999999997e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0306105  hitchhiker  0.00417959 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2706  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.43 
 
 		 573 aa  241  2.9999999999999997e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1932  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  28.49 
 
 		 554 aa  240  4e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.56 
 
 		 566 aa  240  5e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2059  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.61 
 
 		 573 aa  240  5.999999999999999e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1643  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.49 
 
 		 572 aa  238  1e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169007  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2168  acetolactate synthase, large subunit  31.82 
 
 		 562 aa  239  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1877  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.21 
 
 		 636 aa  239  1e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157707 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1921  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.12 
 
 		 576 aa  239  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.299558 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0748  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.1 
 
 		 572 aa  238  3e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.651563  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.69 
 
 		 566 aa  237  5.0000000000000005e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500204  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.42 
 
 		 563 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1851  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.13 
 
 		 573 aa  236  7e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842705  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0179  hypothetical protein  33.82 
 
 		 537 aa  236  7e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1175  Acetolactate synthase  31.03 
 
 		 591 aa  236  9e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.112778  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1934  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.09 
 
 		 571 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1260  acetolactate synthase, large subunit  31.78 
 
 		 566 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00775476  hitchhiker  0.00000116322 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3491  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.13 
 
 		 571 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.84 
 
 		 569 aa  236  1.0000000000000001e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1714  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.09 
 
 		 570 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1691  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.09 
 
 		 570 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1888  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.09 
 
 		 570 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1850  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.09 
 
 		 570 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0722574  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.05 
 
 		 581 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.42 
 
 		 581 aa  234  3e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3681  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.11 
 
 		 586 aa  234  3e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358413  normal  0.114348 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00825  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.57 
 
 		 574 aa  233  5e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0352  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.78 
 
 		 556 aa  233  5e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01970  acetolactate synthase, large subunit  31.34 
 
 		 622 aa  233  9e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00241919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1795  hypothetical protein  32.24 
 
 		 544 aa  232  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2757  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.28 
 
 		 632 aa  232  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.928665  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0596  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.43 
 
 		 573 aa  232  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.793346  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1252  thiamine pyrophosphate protein  33.08 
 
 		 551 aa  232  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62160  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.82 
 
 		 574 aa  232  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.09482 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2558  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.95 
 
 		 566 aa  232  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0505809  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3894  acetolactate synthase catalytic subunit  29.82 
 
 		 566 aa  231  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001649  acetolactate synthase large subunit  28.85 
 
 		 574 aa  231  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.546971  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2843  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.76 
 
 		 587 aa  231  2e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46120  hypothetical protein  32.18 
 
 		 533 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624787  normal  0.341873 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.6 
 
 		 557 aa  231  2e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08850  acetolactate synthase, large subunit  32.5 
 
 		 623 aa  230  4e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.369585  normal  0.232213 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2401  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.12 
 
 		 558 aa  230  5e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6128  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.53 
 
 		 579 aa  230  5e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0749  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.89 
 
 		 546 aa  230  6e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7024  hypothetical protein  33.03 
 
 		 565 aa  229  7e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0863974  normal  0.0979808 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07681  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.58 
 
 		 593 aa  229  7e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0331014 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1966  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.78 
 
 		 571 aa  229  8e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.107455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>