More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1549 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1549  hypothetical protein  100 
 
 
580 aa  1191    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.607866 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46120  hypothetical protein  54.61 
 
 
533 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624787  normal  0.341873 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1795  hypothetical protein  54.28 
 
 
544 aa  522  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522465  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4471  hypothetical protein  50.09 
 
 
545 aa  514  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.658207  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3922  hypothetical protein  54.97 
 
 
533 aa  513  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13227  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2840  hypothetical protein  49.91 
 
 
545 aa  505  9.999999999999999e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1394  hypothetical protein  50.63 
 
 
545 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0538  hypothetical protein  48.81 
 
 
530 aa  504  1e-141  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4418  hypothetical protein  50.81 
 
 
545 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.954696  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1035  hypothetical protein  49.91 
 
 
545 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.516106  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4329  hypothetical protein  50.63 
 
 
545 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0339  hypothetical protein  49.47 
 
 
576 aa  499  1e-140  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6721  hypothetical protein  51.26 
 
 
564 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527215  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0749  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  49.36 
 
 
546 aa  487  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0179  hypothetical protein  44.3 
 
 
537 aa  429  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3820  hypothetical protein  42.72 
 
 
522 aa  397  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.366241  normal  0.547453 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3213  hypothetical protein  42.31 
 
 
523 aa  397  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.628959  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2040  hypothetical protein  42.99 
 
 
535 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.463751  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2183  hypothetical protein  43.15 
 
 
535 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5710  hypothetical protein  42.57 
 
 
536 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65795  hypothetical protein  42.14 
 
 
559 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000547463  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1932  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  34.95 
 
 
554 aa  316  9e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4034  thiamine pyrophosphate protein central region  35.14 
 
 
541 aa  283  5.000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.350713  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0450  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  33.45 
 
 
534 aa  276  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1583  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein  36.28 
 
 
536 aa  262  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.37341 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2951  thiamine pyrophosphate protein central region  32.72 
 
 
536 aa  251  3e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00103515  hitchhiker  0.000679979 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.32 
 
 
557 aa  240  5e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3594  hypothetical protein  30.52 
 
 
541 aa  233  9e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.234761  normal  0.928094 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1703  hypothetical protein  28.9 
 
 
558 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603628  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.43 
 
 
555 aa  229  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.12 
 
 
554 aa  228  3e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1693  hypothetical protein  28.85 
 
 
541 aa  225  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.87 
 
 
554 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4284  hypothetical protein  28.9 
 
 
541 aa  220  5e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1547  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.86 
 
 
569 aa  218  2e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4046  thiamine pyrophosphate protein central region  30.62 
 
 
587 aa  218  2.9999999999999998e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.26689  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2937  hypothetical protein  28.83 
 
 
543 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.27 
 
 
557 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1543  acetolactate synthase catalytic subunit  30.04 
 
 
587 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  31.81 
 
 
566 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2146  acetolactate synthase large subunit  29.17 
 
 
562 aa  214  2.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.12 
 
 
552 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5104  acetolactate synthase catalytic subunit  30.19 
 
 
562 aa  213  5.999999999999999e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.127246 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0734  acetolactate synthase catalytic subunit  31.52 
 
 
564 aa  212  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0954  acetolactate synthase catalytic subunit  29.82 
 
 
587 aa  212  2e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0028  acetolactate synthase catalytic subunit  30.12 
 
 
562 aa  211  3e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2258  acetolactate synthase, large subunit  29.38 
 
 
569 aa  211  3e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3884  acetolactate synthase catalytic subunit  30.12 
 
 
562 aa  211  3e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4006  acetolactate synthase catalytic subunit  30.31 
 
 
562 aa  211  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.277464  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4127  acetolactate synthase catalytic subunit  30.31 
 
 
562 aa  211  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4022  acetolactate synthase catalytic subunit  30.31 
 
 
562 aa  211  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4383  thiamine pyrophosphate protein central region  30.07 
 
 
578 aa  211  4e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00140196  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4077  acetolactate synthase catalytic subunit  30.31 
 
 
562 aa  211  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4185  acetolactate synthase catalytic subunit  30.31 
 
 
562 aa  211  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4988  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.74 
 
 
619 aa  210  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2982  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.7 
 
 
572 aa  210  6e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000024883  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3024  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.7 
 
 
572 aa  210  6e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000501065  normal  0.146294 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4248  acetolactate synthase catalytic subunit  30 
 
 
562 aa  210  6e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3590  hypothetical protein  28.13 
 
 
541 aa  209  8e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.291615  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4180  acetolactate synthase catalytic subunit  30.18 
 
 
562 aa  209  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3087  thiamine pyrophosphate protein central region  29.93 
 
 
564 aa  209  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0153  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.62 
 
 
562 aa  208  2e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03555  acetolactate synthase large subunit  29.82 
 
 
562 aa  207  3e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0032  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.82 
 
 
562 aa  207  3e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03497  hypothetical protein  29.82 
 
 
562 aa  207  3e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3580  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.2 
 
 
558 aa  207  6e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0486011  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.62 
 
 
588 aa  207  6e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1628  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.81 
 
 
572 aa  206  6e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2981  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.46 
 
 
556 aa  206  7e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0018312  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3023  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.46 
 
 
561 aa  206  9e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000478309  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2706  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.72 
 
 
573 aa  206  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0581  acetolactate synthase catalytic subunit  30.44 
 
 
554 aa  205  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188542  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1674  acetolactate synthase catalytic subunit  29.29 
 
 
587 aa  204  2e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4126  acetolactate synthase large subunit  28.4 
 
 
638 aa  205  2e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2059  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.7 
 
 
573 aa  205  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01970  acetolactate synthase, large subunit  30.35 
 
 
622 aa  204  2e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00241919  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08850  acetolactate synthase, large subunit  28.6 
 
 
623 aa  205  2e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.369585  normal  0.232213 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0025  acetolactate synthase catalytic subunit  30.94 
 
 
562 aa  204  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4038  acetolactate synthase catalytic subunit  29.77 
 
 
562 aa  204  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.725928  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3813  acetolactate synthase catalytic subunit  32.39 
 
 
554 aa  204  5e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.12 
 
 
553 aa  203  6e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1650  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.08 
 
 
617 aa  203  8e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.121087 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3624  acetolactate synthase catalytic subunit  31.1 
 
 
554 aa  202  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2482  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.99 
 
 
561 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246138  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2168  acetolactate synthase, large subunit  29.21 
 
 
562 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0748  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.75 
 
 
572 aa  201  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.651563  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00825  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.88 
 
 
574 aa  202  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  29.11 
 
 
587 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08870  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  29.88 
 
 
620 aa  201  3e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2008  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.89 
 
 
592 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901977  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2280  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.06 
 
 
573 aa  200  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.659832  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0352  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.29 
 
 
556 aa  200  5e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2843  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.71 
 
 
587 aa  200  7e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  30.02 
 
 
599 aa  200  7e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1662  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.77 
 
 
564 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0620  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.85 
 
 
560 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.635865  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.68 
 
 
557 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000784156  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1165  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.73 
 
 
561 aa  199  1.0000000000000001e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0325  thiamine pyrophosphate protein central region  28.57 
 
 
576 aa  198  2.0000000000000003e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.555432  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1817  thiamine pyrophosphate protein central region  27.76 
 
 
595 aa  198  2.0000000000000003e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>