More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_08870 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4073  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  77.82 
 
 
623 aa  937    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24876  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2864  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  78.56 
 
 
659 aa  955    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.887934  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3554  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  74.14 
 
 
581 aa  906    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.743835  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18810  acetolactate synthase, large subunit  67.93 
 
 
585 aa  831    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.740593  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1233  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  77.13 
 
 
627 aa  947    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.506  normal  0.463621 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0611  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  73.33 
 
 
589 aa  889    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.175913  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1163  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  70.15 
 
 
621 aa  845    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0122115 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1547  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  60.21 
 
 
569 aa  686    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1042  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  56.37 
 
 
649 aa  691    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.531314  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4356  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  73.48 
 
 
597 aa  904    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0195043  normal  0.165363 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2821  acetolactate synthase large subunit  74.78 
 
 
581 aa  911    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3640  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  72.5 
 
 
608 aa  900    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1886  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  71.34 
 
 
619 aa  911    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0490387  normal  0.105007 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13018  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  70.34 
 
 
618 aa  907    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0170383  normal  0.298126 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0171  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  71.01 
 
 
586 aa  884    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.458212  normal  0.847135 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1090  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  74.79 
 
 
598 aa  908    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2386  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  70 
 
 
613 aa  852    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1335  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  71.07 
 
 
611 aa  875    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.558483  normal  0.552773 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4239  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  70 
 
 
620 aa  910    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.302024 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1408  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  70.35 
 
 
623 aa  865    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2279  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  68.78 
 
 
635 aa  838    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000048825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1906  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  71.34 
 
 
619 aa  911    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365234  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1123  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  77.2 
 
 
629 aa  954    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08530  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  65.11 
 
 
633 aa  806    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0564947  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1710  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  67.92 
 
 
615 aa  867    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.53529 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2539  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  70.03 
 
 
633 aa  852    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0377208  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10680  acetolactate synthase, large subunit  69.07 
 
 
626 aa  853    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.141846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8059  acetolactate synthase, large subunit  76.17 
 
 
578 aa  895    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.634605  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0706  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  73.18 
 
 
581 aa  886    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1466  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  79.76 
 
 
617 aa  981    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0931966  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3392  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  72.84 
 
 
585 aa  889    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3230  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  73.62 
 
 
644 aa  946    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1952  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  71.34 
 
 
619 aa  911    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.338885  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2122  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  69.94 
 
 
625 aa  910    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.522117  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6021  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  83.93 
 
 
611 aa  1024    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08870  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  100 
 
 
620 aa  1266    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7782  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  73.7 
 
 
586 aa  900    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1900  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  54.42 
 
 
568 aa  616  1e-175  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1978  acetolactate synthase, large subunit  54.42 
 
 
568 aa  617  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  52.6 
 
 
563 aa  613  9.999999999999999e-175  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0231  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  54.64 
 
 
582 aa  611  1e-173  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329619  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1877  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  54.85 
 
 
570 aa  611  1e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.082916 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1985  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  54.24 
 
 
568 aa  611  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  51.06 
 
 
569 aa  602  1.0000000000000001e-171  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.97 
 
 
557 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3580  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  54.34 
 
 
558 aa  602  1.0000000000000001e-171  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0486011  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  52.46 
 
 
588 aa  600  1e-170  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10830  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  53.05 
 
 
555 aa  598  1e-169  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  52.44 
 
 
565 aa  593  1e-168  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1203  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  51.75 
 
 
584 aa  590  1e-167  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0855  acetolactate synthase catalytic subunit  51.92 
 
 
578 aa  590  1e-167  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0745  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  50.43 
 
 
581 aa  586  1e-166  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.425404  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1877  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  50.08 
 
 
636 aa  585  1e-166  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000157707 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0892  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  50.43 
 
 
581 aa  586  1e-166  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.806334  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2596  acetolactate synthase catalytic subunit  50.77 
 
 
577 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1063  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  48.32 
 
 
595 aa  580  1e-164  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.722606  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4126  acetolactate synthase large subunit  49.11 
 
 
638 aa  580  1e-164  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0736  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  53.28 
 
 
597 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.591869  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1495  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  50.17 
 
 
566 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.433241 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4449  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  51.79 
 
 
570 aa  577  1.0000000000000001e-163  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.49289  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  49.65 
 
 
566 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0544  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  52.17 
 
 
602 aa  578  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2843  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  50.26 
 
 
587 aa  577  1.0000000000000001e-163  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  51.52 
 
 
553 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2757  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  51.74 
 
 
632 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.928665  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0139  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  51.31 
 
 
612 aa  572  1.0000000000000001e-162  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  49.47 
 
 
557 aa  574  1.0000000000000001e-162  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1909  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  51.77 
 
 
561 aa  573  1.0000000000000001e-162  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000425472  hitchhiker  0.0000717525 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2746  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  49.83 
 
 
566 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  49.39 
 
 
566 aa  570  1e-161  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500204  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2146  acetolactate synthase large subunit  51.15 
 
 
562 aa  572  1e-161  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2158  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  48.68 
 
 
564 aa  571  1e-161  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  50 
 
 
555 aa  567  1e-160  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2077  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  49.13 
 
 
585 aa  567  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2893  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  50.09 
 
 
592 aa  568  1e-160  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0020584 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  51.49 
 
 
558 aa  566  1e-160  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  49.48 
 
 
566 aa  567  1e-160  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0810  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.65 
 
 
595 aa  566  1e-160  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.845021  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0898  acetolactate synthase, large subunit  49.82 
 
 
564 aa  566  1e-160  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0833  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  50.44 
 
 
569 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.469559  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1443  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  50.35 
 
 
559 aa  563  1.0000000000000001e-159  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0306105  hitchhiker  0.00417959 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2228  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  48.62 
 
 
585 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.635342 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2145  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  51.24 
 
 
562 aa  564  1.0000000000000001e-159  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000794715  normal  0.0157817 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0752  acetolactate synthase, large subunit  49.91 
 
 
569 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_737  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  50.26 
 
 
569 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00716267  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3617  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  50.97 
 
 
563 aa  565  1.0000000000000001e-159  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000692831  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0911  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  49.91 
 
 
587 aa  565  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  49.02 
 
 
557 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000784156  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1782  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  48.85 
 
 
572 aa  558  1e-158  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.331882  normal  0.0862821 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0947  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  48.32 
 
 
587 aa  561  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1260  acetolactate synthase, large subunit  49.04 
 
 
566 aa  561  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00775476  hitchhiker  0.00000116322 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0741  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  49.21 
 
 
573 aa  561  1e-158  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1905  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  48.44 
 
 
585 aa  560  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.239635  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4988  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  51.14 
 
 
619 aa  558  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0608  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  48.42 
 
 
566 aa  556  1e-157  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2773  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  49.21 
 
 
570 aa  558  1e-157  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.239005  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  50.26 
 
 
552 aa  558  1e-157  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2401  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  51.93 
 
 
558 aa  556  1e-157  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1488  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.59 
 
 
600 aa  556  1e-157  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.181787  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08850  acetolactate synthase, large subunit  48.97 
 
 
623 aa  555  1e-157  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.369585  normal  0.232213 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>