More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0450 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0450  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  100 
 
 
534 aa  1045    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1583  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein  64.69 
 
 
536 aa  542  1e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.37341 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2951  thiamine pyrophosphate protein central region  48.94 
 
 
536 aa  414  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00103515  hitchhiker  0.000679979 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4471  hypothetical protein  39.3 
 
 
545 aa  325  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.658207  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1795  hypothetical protein  41.71 
 
 
544 aa  323  5e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522465  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4034  thiamine pyrophosphate protein central region  41.84 
 
 
541 aa  322  8e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.350713  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4418  hypothetical protein  40.63 
 
 
545 aa  319  9e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.954696  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0339  hypothetical protein  40.97 
 
 
576 aa  316  8e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1394  hypothetical protein  40.22 
 
 
545 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2183  hypothetical protein  40.08 
 
 
535 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1035  hypothetical protein  40.04 
 
 
545 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.516106  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46120  hypothetical protein  39.39 
 
 
533 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624787  normal  0.341873 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4329  hypothetical protein  39.7 
 
 
545 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5710  hypothetical protein  42.06 
 
 
536 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1932  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  32.6 
 
 
554 aa  308  1.0000000000000001e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2040  hypothetical protein  39.24 
 
 
535 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.463751  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0538  hypothetical protein  37.55 
 
 
530 aa  306  5.0000000000000004e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1549  hypothetical protein  34.12 
 
 
580 aa  305  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.607866 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3922  hypothetical protein  39.77 
 
 
533 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13227  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6721  hypothetical protein  39.53 
 
 
564 aa  299  9e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527215  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2840  hypothetical protein  38.62 
 
 
545 aa  296  8e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65795  hypothetical protein  42.09 
 
 
559 aa  293  6e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000547463  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0179  hypothetical protein  38.39 
 
 
537 aa  291  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3594  hypothetical protein  37.27 
 
 
541 aa  290  4e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.234761  normal  0.928094 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1703  hypothetical protein  36.28 
 
 
558 aa  286  7e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603628  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1693  hypothetical protein  35.58 
 
 
541 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0749  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  39.1 
 
 
546 aa  280  5e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4284  hypothetical protein  34.58 
 
 
541 aa  280  6e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2937  hypothetical protein  35.53 
 
 
543 aa  279  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3590  hypothetical protein  36.09 
 
 
541 aa  276  1.0000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.291615  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5385  hypothetical protein  35.58 
 
 
542 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366398  normal  0.452356 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1689  hypothetical protein  35.89 
 
 
547 aa  259  9e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3820  hypothetical protein  37.8 
 
 
522 aa  258  2e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.366241  normal  0.547453 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3213  hypothetical protein  36.28 
 
 
523 aa  258  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.628959  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01970  acetolactate synthase, large subunit  34.25 
 
 
622 aa  256  9e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00241919  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.66 
 
 
581 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.23 
 
 
588 aa  254  3e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.66 
 
 
581 aa  254  3e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1203  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.45 
 
 
584 aa  252  1e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1543  acetolactate synthase catalytic subunit  32.43 
 
 
587 aa  249  6e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.82 
 
 
552 aa  249  1e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.8 
 
 
557 aa  248  2e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0852  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.04 
 
 
552 aa  247  4e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.579609  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.08 
 
 
555 aa  246  9e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  32.97 
 
 
587 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2821  acetolactate synthase large subunit  33.1 
 
 
581 aa  244  3e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.29 
 
 
553 aa  244  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0954  acetolactate synthase catalytic subunit  32.61 
 
 
587 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  33.15 
 
 
566 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0855  acetolactate synthase catalytic subunit  33.64 
 
 
578 aa  243  5e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1674  acetolactate synthase catalytic subunit  32.97 
 
 
587 aa  241  2e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0231  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.84 
 
 
582 aa  241  2e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329619  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4383  thiamine pyrophosphate protein central region  33.57 
 
 
578 aa  241  2e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00140196  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  31.24 
 
 
599 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0968  thiamine pyrophosphate protein central region  31.25 
 
 
563 aa  241  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3087  thiamine pyrophosphate protein central region  35.94 
 
 
564 aa  239  9e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4046  thiamine pyrophosphate protein central region  32.75 
 
 
587 aa  239  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.26689  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08850  acetolactate synthase, large subunit  33.64 
 
 
623 aa  239  1e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.369585  normal  0.232213 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4356  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  34.19 
 
 
597 aa  238  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0195043  normal  0.165363 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2258  acetolactate synthase, large subunit  33.58 
 
 
569 aa  238  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0325  thiamine pyrophosphate protein central region  31.95 
 
 
576 aa  238  3e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.555432  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2596  acetolactate synthase catalytic subunit  32.84 
 
 
577 aa  237  4e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0171  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.82 
 
 
586 aa  237  4e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.458212  normal  0.847135 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2482  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.84 
 
 
561 aa  236  6e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246138  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1092  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.81 
 
 
600 aa  236  9e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1929  acetolactate synthase catalytic subunit  32.55 
 
 
572 aa  234  2.0000000000000002e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.21 
 
 
554 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1978  acetolactate synthase, large subunit  33.64 
 
 
568 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3580  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.3 
 
 
558 aa  234  3e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0486011  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2757  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.94 
 
 
632 aa  234  4.0000000000000004e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.928665  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0139  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  33.82 
 
 
612 aa  234  4.0000000000000004e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2059  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.13 
 
 
573 aa  234  4.0000000000000004e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1900  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.82 
 
 
568 aa  233  5e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  33.64 
 
 
557 aa  233  6e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1985  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.64 
 
 
568 aa  233  6e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.09 
 
 
562 aa  232  1e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1858  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.69 
 
 
582 aa  232  2e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.667431  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0352  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.16 
 
 
556 aa  231  2e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1488  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.59 
 
 
600 aa  231  3e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.181787  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10830  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.36 
 
 
555 aa  231  3e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08870  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  33.03 
 
 
620 aa  231  3e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1643  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.68 
 
 
572 aa  230  4e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169007  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00825  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.27 
 
 
574 aa  230  4e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1662  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.09 
 
 
564 aa  230  4e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1248  acetolactate synthase  30.93 
 
 
550 aa  230  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.888375 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05831  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.51 
 
 
587 aa  230  4e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3554  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.19 
 
 
581 aa  230  5e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.743835  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3298  acetolactate synthase  31.12 
 
 
550 aa  230  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0757379  normal  0.853044 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.73 
 
 
563 aa  230  5e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1547  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.06 
 
 
569 aa  230  5e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2706  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.58 
 
 
573 aa  229  7e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2666  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.06 
 
 
573 aa  229  8e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000302703  decreased coverage  0.000148215 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2516  acetolactate synthase, large subunit  29.12 
 
 
542 aa  229  1e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000744784  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1850  acetolactate synthase catalytic subunit  31.67 
 
 
566 aa  229  1e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1090  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  32.97 
 
 
598 aa  228  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00556  acetolactate synthase III large subunit  29.51 
 
 
572 aa  228  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4988  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.74 
 
 
619 aa  228  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1776  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.98 
 
 
573 aa  228  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001649  acetolactate synthase large subunit  29.09 
 
 
574 aa  228  3e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.546971  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4073  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.24 
 
 
623 aa  228  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>