More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5385 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5385  hypothetical protein  100 
 
 
542 aa  1112    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366398  normal  0.452356 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3590  hypothetical protein  67.72 
 
 
541 aa  737    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.291615  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4284  hypothetical protein  51.57 
 
 
541 aa  548  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3594  hypothetical protein  53.06 
 
 
541 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.234761  normal  0.928094 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1703  hypothetical protein  52.41 
 
 
558 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603628  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1693  hypothetical protein  52.88 
 
 
541 aa  538  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2937  hypothetical protein  52.12 
 
 
543 aa  525  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1689  hypothetical protein  51.94 
 
 
547 aa  523  1e-147  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4300  hypothetical protein  36.5 
 
 
569 aa  311  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.422617  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0231  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.68 
 
 
582 aa  252  1e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329619  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1092  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.2 
 
 
600 aa  249  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0450  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  35.82 
 
 
534 aa  247  3e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0498  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.8 
 
 
566 aa  246  6e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.52 
 
 
557 aa  243  6e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.65 
 
 
553 aa  240  5e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.3 
 
 
552 aa  240  5.999999999999999e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1557  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.1 
 
 
581 aa  238  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4046  thiamine pyrophosphate protein central region  32.68 
 
 
587 aa  238  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.26689  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1296  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.91 
 
 
563 aa  238  2e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.23 
 
 
562 aa  238  2e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1968  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.08 
 
 
581 aa  237  3e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.697399  normal  0.245648 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0502  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.6 
 
 
535 aa  237  5.0000000000000005e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0235829  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0538  hypothetical protein  32.58 
 
 
530 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1921  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.47 
 
 
576 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.299558 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30090  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme, possible carboligase or decarboxylase  33.13 
 
 
553 aa  234  3e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.492934  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.64 
 
 
588 aa  234  3e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.99 
 
 
563 aa  234  3e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3347  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.34 
 
 
561 aa  234  3e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.18132  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4383  thiamine pyrophosphate protein central region  31.97 
 
 
578 aa  234  4.0000000000000004e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00140196  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2833  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.44 
 
 
593 aa  231  2e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1643  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.99 
 
 
572 aa  230  4e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169007  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1543  acetolactate synthase catalytic subunit  30.87 
 
 
587 aa  231  4e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1877  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.12 
 
 
636 aa  229  1e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000157707 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00825  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.47 
 
 
574 aa  228  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001649  acetolactate synthase large subunit  29.36 
 
 
574 aa  228  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.546971  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.51 
 
 
565 aa  227  3e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2757  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.97 
 
 
632 aa  227  4e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.928665  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0139  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.91 
 
 
612 aa  227  5.0000000000000005e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0171  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.17 
 
 
586 aa  227  5.0000000000000005e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.458212  normal  0.847135 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2843  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.68 
 
 
587 aa  226  7e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0954  acetolactate synthase catalytic subunit  30.62 
 
 
587 aa  226  9e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1203  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.59 
 
 
584 aa  226  9e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1123  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  33.75 
 
 
629 aa  226  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.93 
 
 
573 aa  225  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274178  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3401  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.96 
 
 
575 aa  225  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1674  acetolactate synthase catalytic subunit  30.98 
 
 
587 aa  225  2e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0467  acetolactate synthase, large subunit  29.48 
 
 
586 aa  225  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3531  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.96 
 
 
575 aa  225  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1850  acetolactate synthase catalytic subunit  31.38 
 
 
566 aa  225  2e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2932  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.96 
 
 
593 aa  225  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.67 
 
 
569 aa  225  2e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2516  acetolactate synthase, large subunit  31.09 
 
 
542 aa  224  3e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000744784  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0325  thiamine pyrophosphate protein central region  31.61 
 
 
576 aa  224  4e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.555432  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4988  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.67 
 
 
619 aa  224  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0748  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.45 
 
 
572 aa  223  4.9999999999999996e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.651563  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2464  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.55 
 
 
585 aa  223  4.9999999999999996e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0927747  normal  0.484681 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  30.23 
 
 
599 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1141  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.41 
 
 
565 aa  223  9.999999999999999e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2706  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.47 
 
 
573 aa  223  9.999999999999999e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1955  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.55 
 
 
618 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0672621 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2279  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  32.09 
 
 
635 aa  222  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000048825 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1240  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.77 
 
 
580 aa  222  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2539  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  31.39 
 
 
633 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0377208  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2521  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  31.23 
 
 
547 aa  221  3e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.948829  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1556  acetolactate synthase catalytic subunit  30.04 
 
 
566 aa  221  3e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1488  acetolactate synthase catalytic subunit  30.04 
 
 
569 aa  221  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.87 
 
 
554 aa  221  3e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1450  acetolactate synthase catalytic subunit  29.78 
 
 
566 aa  221  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.805223  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  30.62 
 
 
587 aa  221  3e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2059  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.11 
 
 
573 aa  221  3e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  30.74 
 
 
567 aa  221  3e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1858  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.18 
 
 
582 aa  220  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.667431  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4471  hypothetical protein  32.61 
 
 
545 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.658207  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2008  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30 
 
 
592 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901977  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05831  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.18 
 
 
587 aa  220  5e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0666  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.39 
 
 
552 aa  220  7e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1281  acetolactate synthase catalytic subunit  29.86 
 
 
569 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3681  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.89 
 
 
586 aa  219  7.999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358413  normal  0.114348 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5914  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.74 
 
 
588 aa  219  8.999999999999998e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1417  acetolactate synthase catalytic subunit  29.86 
 
 
566 aa  219  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.04 
 
 
563 aa  219  1e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1932  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  28.91 
 
 
554 aa  219  1e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4165  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.37 
 
 
557 aa  219  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1517  acetolactate synthase catalytic subunit  29.93 
 
 
566 aa  218  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1308  acetolactate synthase catalytic subunit  29.86 
 
 
578 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1282  acetolactate synthase catalytic subunit  29.86 
 
 
566 aa  218  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1319  acetolactate synthase catalytic subunit  28.93 
 
 
566 aa  218  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272087  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1120  acetolactate synthase catalytic subunit  29.37 
 
 
566 aa  218  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000146949  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4073  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.89 
 
 
623 aa  218  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24876  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1488  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.57 
 
 
600 aa  218  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.181787  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0442  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.68 
 
 
562 aa  218  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.596547 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2791  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.7 
 
 
596 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111041  normal  0.823193 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2666  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.55 
 
 
573 aa  218  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000302703  decreased coverage  0.000148215 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2532  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.34 
 
 
596 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.630898  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.09 
 
 
554 aa  218  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2343  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.53 
 
 
592 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08870  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  31.03 
 
 
620 aa  218  2.9999999999999998e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1389  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.16 
 
 
584 aa  217  4e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0317493  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0544  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.71 
 
 
602 aa  217  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0345  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  31.12 
 
 
569 aa  217  4e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0918871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>