More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1689 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1689  hypothetical protein  100 
 
 		 547 aa  1114    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5385  hypothetical protein  51.94 
 
 		 542 aa  528  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366398  normal  0.452356 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4284  hypothetical protein  50.09 
 
 		 541 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3590  hypothetical protein  49.44 
 
 		 541 aa  514  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.291615  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2937  hypothetical protein  51.3 
 
 		 543 aa  506  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1703  hypothetical protein  50.47 
 
 		 558 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3594  hypothetical protein  49.91 
 
 		 541 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.234761  normal  0.928094 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1693  hypothetical protein  48.99 
 
 		 541 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4300  hypothetical protein  40.82 
 
 		 569 aa  369  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.422617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2183  hypothetical protein  34.02 
 
 		 535 aa  267  4e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2040  hypothetical protein  33.65 
 
 		 535 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.463751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4383  thiamine pyrophosphate protein central region  31.35 
 
 		 578 aa  256  7e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00140196  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0325  thiamine pyrophosphate protein central region  31.72 
 
 		 576 aa  248  2e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.555432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0450  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  35.71 
 
 		 534 aa  247  3e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0538  hypothetical protein  34.97 
 
 		 530 aa  248  3e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5710  hypothetical protein  36.23 
 
 		 536 aa  246  8e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0339  hypothetical protein  35.32 
 
 		 576 aa  241  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1753  acetolactate synthase, large subunit  32.56 
 
 		 590 aa  241  2e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00232913 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46120  hypothetical protein  35.86 
 
 		 533 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624787  normal  0.341873 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.44 
 
 		 588 aa  240  5e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  33.89 
 
 		 563 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1175  Acetolactate synthase  32.14 
 
 		 591 aa  239  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.112778  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2048  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.28 
 
 		 596 aa  237  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1092  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.88 
 
 		 600 aa  237  5.0000000000000005e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1543  acetolactate synthase catalytic subunit  30.74 
 
 		 587 aa  236  7e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65795  hypothetical protein  35.78 
 
 		 559 aa  236  8e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000547463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1959  acetolactate synthase, large subunit  31.65 
 
 		 570 aa  236  9e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0560723  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4471  hypothetical protein  33.76 
 
 		 545 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.658207  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  30.81 
 
 		 599 aa  234  3e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.81 
 
 		 569 aa  233  8.000000000000001e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0179  hypothetical protein  32.03 
 
 		 537 aa  233  9e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0954  acetolactate synthase catalytic subunit  31.27 
 
 		 587 aa  231  2e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.09 
 
 		 557 aa  231  3e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1921  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.48 
 
 		 576 aa  230  5e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.299558 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5039  acetolactate synthase large subunit  34.31 
 
 		 611 aa  229  8e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.818274  normal  0.707988 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1795  hypothetical protein  34.01 
 
 		 544 aa  229  8e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1674  acetolactate synthase catalytic subunit  31.27 
 
 		 587 aa  229  1e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3922  hypothetical protein  36.04 
 
 		 533 aa  229  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13227  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3347  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.87 
 
 		 561 aa  229  1e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.18132  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0025  acetolactate synthase catalytic subunit  29.11 
 
 		 562 aa  229  1e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05521  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.26 
 
 		 587 aa  228  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.78481  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  29.87 
 
 		 566 aa  226  6e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0526  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.08 
 
 		 587 aa  226  6e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05821  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.91 
 
 		 587 aa  226  8e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.449821  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0502  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.41 
 
 		 535 aa  226  8e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0235829  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1877  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.78 
 
 		 636 aa  225  1e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157707 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2802  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.66 
 
 		 585 aa  226  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34708  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  31.09 
 
 		 587 aa  226  1e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2840  hypothetical protein  32.82 
 
 		 545 aa  226  1e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3076  acetolactate synthase catalytic subunit  32.19 
 
 		 555 aa  226  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.932178  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2146  acetolactate synthase large subunit  29.93 
 
 		 562 aa  225  1e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1643  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.49 
 
 		 572 aa  224  3e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.99 
 
 		 581 aa  224  4e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1141  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.54 
 
 		 565 aa  224  4e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0581  acetolactate synthase catalytic subunit  30.81 
 
 		 554 aa  224  4.9999999999999996e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188542  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0666  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.02 
 
 		 552 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5104  acetolactate synthase catalytic subunit  28.47 
 
 		 562 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.127246 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1968  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.87 
 
 		 581 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.697399  normal  0.245648 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3813  acetolactate synthase catalytic subunit  30.88 
 
 		 554 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2791  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.8 
 
 		 596 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111041  normal  0.823193 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.82 
 
 		 581 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3213  hypothetical protein  33.46 
 
 		 523 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.628959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1557  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.57 
 
 		 581 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.48 
 
 		 552 aa  222  1.9999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2532  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.8 
 
 		 596 aa  221  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.630898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1296  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.43 
 
 		 563 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.29 
 
 		 566 aa  221  3.9999999999999997e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.14 
 
 		 565 aa  220  5e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2008  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.21 
 
 		 592 aa  220  5e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1929  acetolactate synthase catalytic subunit  30.22 
 
 		 572 aa  220  6e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2833  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.59 
 
 		 593 aa  220  6e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1389  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.48 
 
 		 584 aa  219  7e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0317493  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4006  acetolactate synthase catalytic subunit  28.63 
 
 		 562 aa  219  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.277464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4077  acetolactate synthase catalytic subunit  28.63 
 
 		 562 aa  219  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1488  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.59 
 
 		 600 aa  219  7.999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.181787  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4127  acetolactate synthase catalytic subunit  28.63 
 
 		 562 aa  219  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1850  acetolactate synthase catalytic subunit  30.31 
 
 		 566 aa  219  7.999999999999999e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4185  acetolactate synthase catalytic subunit  28.63 
 
 		 562 aa  219  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2464  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.62 
 
 		 585 aa  219  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0927747  normal  0.484681 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1905  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  30.69 
 
 		 573 aa  219  1e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4022  acetolactate synthase catalytic subunit  28.63 
 
 		 562 aa  219  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30090  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme, possible carboligase or decarboxylase  32.16 
 
 		 553 aa  218  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.492934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08850  acetolactate synthase, large subunit  30.6 
 
 		 623 aa  218  2e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.369585  normal  0.232213 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1666  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.38 
 
 		 567 aa  218  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1346  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.3 
 
 		 584 aa  218  2.9999999999999998e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0313448  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0790  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  33.58 
 
 		 564 aa  218  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000243733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4046  thiamine pyrophosphate protein central region  29.52 
 
 		 587 aa  217  5e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.26689  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0554  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.59 
 
 		 547 aa  217  5e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00325179 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1932  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  26.58 
 
 		 554 aa  216  5.9999999999999996e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.45 
 
 		 554 aa  217  5.9999999999999996e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3624  acetolactate synthase catalytic subunit  30.48 
 
 		 554 aa  216  8e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0498  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.48 
 
 		 566 aa  216  9e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1470  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.6 
 
 		 581 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.560122 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1170  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30 
 
 		 583 aa  216  9.999999999999999e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01970  acetolactate synthase, large subunit  30.93 
 
 		 622 aa  216  9.999999999999999e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00241919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0741  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.91 
 
 		 573 aa  216  9.999999999999999e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1950  acetolactate synthase catalytic subunit  30.04 
 
 		 555 aa  215  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0294  putative pyruvate decarboxylase  29.5 
 
 		 590 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2516  acetolactate synthase, large subunit  28.36 
 
 		 542 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000744784  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1839  acetolactate synthase catalytic subunit  30.04 
 
 		 555 aa  215  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>