More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1175 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1175  Acetolactate synthase  100 
 
 
591 aa  1205    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.112778  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  38.11 
 
 
554 aa  402  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  38.49 
 
 
588 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  37.18 
 
 
562 aa  392  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  38.05 
 
 
557 aa  394  1e-108  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3455  glyoxylate carboligase  38.85 
 
 
577 aa  389  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.13774  normal  0.152002 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  38.52 
 
 
563 aa  386  1e-106  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  37.65 
 
 
563 aa  385  1e-106  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10830  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  37.04 
 
 
555 aa  387  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  38.09 
 
 
567 aa  387  1e-106  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  37.91 
 
 
566 aa  386  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  36.83 
 
 
587 aa  386  1e-106  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  37 
 
 
569 aa  388  1e-106  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  37.3 
 
 
565 aa  384  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00457  glyoxylate carboligase  35.98 
 
 
593 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.50477  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0441  glyoxylate carboligase  35.98 
 
 
593 aa  379  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0206883  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3105  glyoxylate carboligase  35.98 
 
 
593 aa  379  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2229  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  37.41 
 
 
579 aa  379  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00462  hypothetical protein  35.98 
 
 
593 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.711449  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3115  glyoxylate carboligase  35.98 
 
 
593 aa  379  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2168  acetolactate synthase, large subunit  37.74 
 
 
562 aa  380  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0153  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  36.61 
 
 
562 aa  382  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0608  glyoxylate carboligase  35.98 
 
 
593 aa  379  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1674  acetolactate synthase catalytic subunit  35.97 
 
 
587 aa  380  1e-104  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0352  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  38.67 
 
 
556 aa  381  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0954  acetolactate synthase catalytic subunit  36.49 
 
 
587 aa  382  1e-104  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  37.21 
 
 
553 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0550  glyoxylate carboligase  36.16 
 
 
593 aa  380  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0571  glyoxylate carboligase  36.09 
 
 
593 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  37.45 
 
 
552 aa  377  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0544  glyoxylate carboligase  35.8 
 
 
593 aa  378  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2424  glyoxylate carboligase  36.06 
 
 
591 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1543  acetolactate synthase catalytic subunit  36.16 
 
 
587 aa  379  1e-103  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08150  glyoxylate carboligase  36.76 
 
 
603 aa  378  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2173  glyoxylate carboligase  35.89 
 
 
591 aa  376  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.52322  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1495  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  37.84 
 
 
566 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.433241 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0564  glyoxylate carboligase  36.09 
 
 
593 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0566  glyoxylate carboligase  36.09 
 
 
593 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2259  glyoxylate carboligase  36.24 
 
 
591 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.712116  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2299  glyoxylate carboligase  36.06 
 
 
591 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.408845  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  38.39 
 
 
555 aa  378  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0625  glyoxylate carboligase  36.09 
 
 
593 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.610949  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  36.82 
 
 
566 aa  378  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1782  glyoxylate carboligase  35.75 
 
 
591 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.538882  normal  0.818313 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0723  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  37.83 
 
 
571 aa  373  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1903  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  37.13 
 
 
563 aa  373  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  36.35 
 
 
581 aa  374  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  36.71 
 
 
581 aa  375  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5178  glyoxylate carboligase  36.06 
 
 
591 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.191483  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3448  glyoxylate carboligase  35.89 
 
 
596 aa  375  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0581  glyoxylate carboligase  35.63 
 
 
593 aa  375  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2853  glyoxylate carboligase  38.27 
 
 
583 aa  372  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0172907  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1815  glyoxylate carboligase  36.24 
 
 
591 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2982  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  36.52 
 
 
572 aa  373  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000024883  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3024  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  36.52 
 
 
572 aa  373  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000501065  normal  0.146294 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1692  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  37.26 
 
 
563 aa  375  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2746  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  37.66 
 
 
566 aa  375  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3291  glyoxylate carboligase  36.02 
 
 
594 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1620  glyoxylate carboligase  35.54 
 
 
591 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.44538  normal  0.510397 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  35.81 
 
 
599 aa  371  1e-101  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.9 
 
 
557 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000784156  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3478  glyoxylate carboligase  35.12 
 
 
591 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3087  glyoxylate carboligase  36.11 
 
 
591 aa  369  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2460  glyoxylate carboligase  35.25 
 
 
591 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.583136  normal  0.435829 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2146  acetolactate synthase large subunit  37.14 
 
 
562 aa  369  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45000  glyoxylate carboligase  35.76 
 
 
591 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.568226  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1787  glyoxylate carboligase  36.06 
 
 
591 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3691  glyoxylate carboligase  35.12 
 
 
592 aa  371  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3829  glyoxylate carboligase  35.76 
 
 
591 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0502  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  36.66 
 
 
535 aa  370  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0235829  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.6 
 
 
554 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2769  glyoxylate carboligase  36.28 
 
 
591 aa  369  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.155295  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1662  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  36.89 
 
 
564 aa  369  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1888  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  39.17 
 
 
570 aa  368  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1707  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  38.66 
 
 
571 aa  367  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3151  glyoxylate carboligase  34.71 
 
 
595 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1714  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  39.17 
 
 
570 aa  368  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0303  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  36.52 
 
 
559 aa  368  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.296158  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1691  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  39.17 
 
 
570 aa  369  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1299  glyoxylate carboligase  36.1 
 
 
591 aa  366  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1396  glyoxylate carboligase  35.7 
 
 
591 aa  368  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136829  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1850  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  39.17 
 
 
570 aa  368  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0722574  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1901  glyoxylate carboligase  35.7 
 
 
591 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000229041 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6201  glyoxylate carboligase  35.88 
 
 
591 aa  369  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0309842  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3491  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  38.29 
 
 
571 aa  366  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1878  glyoxylate carboligase  35.88 
 
 
591 aa  369  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232165  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3438  glyoxylate carboligase  35.03 
 
 
596 aa  366  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0105  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.25 
 
 
568 aa  367  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180923  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1157  glyoxylate carboligase  37.32 
 
 
594 aa  367  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3430  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  37.01 
 
 
574 aa  365  1e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.646845  normal  0.0217288 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.8 
 
 
566 aa  364  2e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500204  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1260  acetolactate synthase, large subunit  36.18 
 
 
566 aa  364  2e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00775476  hitchhiker  0.00000116322 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0231  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  36.66 
 
 
582 aa  364  3e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329619  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4561  glyoxylate carboligase  36.3 
 
 
598 aa  364  3e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.437986 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1203  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  37.39 
 
 
584 aa  363  3e-99  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2516  acetolactate synthase, large subunit  36.04 
 
 
542 aa  364  3e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000744784  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  37.82 
 
 
558 aa  364  3e-99  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1851  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  38.11 
 
 
573 aa  363  4e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842705  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3617  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  37.39 
 
 
563 aa  362  8e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000692831  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0139  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  38.17 
 
 
612 aa  362  9e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>