More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3691 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00457  glyoxylate carboligase  72.25 
 
 		 593 aa  904    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.50477  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3105  glyoxylate carboligase  72.25 
 
 		 593 aa  904    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0566  glyoxylate carboligase  72.08 
 
 		 593 aa  906    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1782  glyoxylate carboligase  74.11 
 
 		 591 aa  917    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.538882  normal  0.818313 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0608  glyoxylate carboligase  72.25 
 
 		 593 aa  904    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4297  glyoxylate carboligase  73.42 
 
 		 591 aa  911    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3281  glyoxylate carboligase  70.38 
 
 		 591 aa  855    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.819791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2367  glyoxylate carboligase  71.38 
 
 		 591 aa  877    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4866  glyoxylate carboligase  67.82 
 
 		 579 aa  837    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.553307 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1901  glyoxylate carboligase  73.94 
 
 		 591 aa  913    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000229041 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3438  glyoxylate carboligase  91.78 
 
 		 596 aa  1132    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4308  glyoxylate carboligase  72.64 
 
 		 594 aa  898    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0403052 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0550  glyoxylate carboligase  71.74 
 
 		 593 aa  899    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3291  glyoxylate carboligase  70.92 
 
 		 594 aa  882    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1135  glyoxylate carboligase  72.01 
 
 		 596 aa  870    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2424  glyoxylate carboligase  73.42 
 
 		 591 aa  912    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1598  glyoxylate carboligase  74.28 
 
 		 591 aa  930    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.035378  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3862  glyoxylate carboligase  73.59 
 
 		 591 aa  912    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.985049  normal  0.531415 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3478  glyoxylate carboligase  70.42 
 
 		 591 aa  868    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5178  glyoxylate carboligase  74.11 
 
 		 591 aa  915    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.191483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1620  glyoxylate carboligase  74.28 
 
 		 591 aa  919    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.44538  normal  0.510397 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3087  glyoxylate carboligase  71.89 
 
 		 591 aa  895    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0581  glyoxylate carboligase  72.25 
 
 		 593 aa  903    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2312  glyoxylate carboligase  74.24 
 
 		 591 aa  926    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.276153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0625  glyoxylate carboligase  72.25 
 
 		 593 aa  908    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.610949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08150  glyoxylate carboligase  78.14 
 
 		 603 aa  963    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0571  glyoxylate carboligase  72.25 
 
 		 593 aa  908    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2173  glyoxylate carboligase  73.42 
 
 		 591 aa  912    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.52322  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3954  glyoxylate carboligase  70.66 
 
 		 597 aa  882    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416682  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43400  glyoxylate carboligase  73.35 
 
 		 567 aa  815    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00462  hypothetical protein  72.25 
 
 		 593 aa  904    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.711449  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1572  glyoxylate carboligase  73.25 
 
 		 591 aa  909    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0611133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4561  glyoxylate carboligase  73.33 
 
 		 598 aa  883    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.437986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2460  glyoxylate carboligase  74.28 
 
 		 591 aa  920    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.583136  normal  0.435829 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3448  glyoxylate carboligase  71.19 
 
 		 596 aa  882    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2612  glyoxylate carboligase  72.79 
 
 		 592 aa  898    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0441  glyoxylate carboligase  72.08 
 
 		 593 aa  903    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0206883  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6201  glyoxylate carboligase  74.11 
 
 		 591 aa  915    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0309842  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1157  glyoxylate carboligase  70.17 
 
 		 594 aa  877    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0544  glyoxylate carboligase  72.08 
 
 		 593 aa  903    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1815  glyoxylate carboligase  74.45 
 
 		 591 aa  919    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45000  glyoxylate carboligase  73.08 
 
 		 591 aa  913    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.568226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1299  glyoxylate carboligase  73.59 
 
 		 591 aa  912    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3691  glyoxylate carboligase  100 
 
 		 592 aa  1217    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1878  glyoxylate carboligase  74.11 
 
 		 591 aa  915    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232165  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0564  glyoxylate carboligase  72.25 
 
 		 593 aa  908    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2117  glyoxylate carboligase  72.13 
 
 		 596 aa  891    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226819 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3829  glyoxylate carboligase  73.08 
 
 		 591 aa  913    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3151  glyoxylate carboligase  69.76 
 
 		 595 aa  859    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1787  glyoxylate carboligase  74.28 
 
 		 591 aa  917    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1396  glyoxylate carboligase  74.45 
 
 		 591 aa  919    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0458  glyoxylate carboligase  72.47 
 
 		 594 aa  895    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.258476  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3622  glyoxylate carboligase  73.08 
 
 		 591 aa  907    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2769  glyoxylate carboligase  73.42 
 
 		 591 aa  919    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.155295  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3115  glyoxylate carboligase  72.25 
 
 		 593 aa  904    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0244  glyoxylate carboligase  75.29 
 
 		 601 aa  918    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2259  glyoxylate carboligase  73.25 
 
 		 591 aa  912    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.712116  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2299  glyoxylate carboligase  73.42 
 
 		 591 aa  912    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.408845  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3455  glyoxylate carboligase  49.23 
 
 		 577 aa  585  1.0000000000000001e-165  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.13774  normal  0.152002 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2853  glyoxylate carboligase  51.22 
 
 		 583 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0172907  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2548  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain-containing protein  50.77 
 
 		 570 aa  577  1.0000000000000001e-163  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271153  normal  0.122041 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4728  glyoxylate carboligase  50 
 
 		 572 aa  548  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0723  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  49.31 
 
 		 571 aa  546  1e-154  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1175  Acetolactate synthase  35.12 
 
 		 591 aa  366  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.112778  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  36.49 
 
 		 588 aa  348  1e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.59 
 
 		 569 aa  336  5.999999999999999e-91  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4073  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.88 
 
 		 623 aa  332  9e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24876  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  34.71 
 
 		 599 aa  332  1e-89  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.05 
 
 		 553 aa  330  4e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  35.75 
 
 		 567 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.64 
 
 		 552 aa  327  3e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.15 
 
 		 554 aa  327  3e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.34 
 
 		 557 aa  327  3e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4449  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.59 
 
 		 570 aa  327  4.0000000000000003e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.49289  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0748  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  34.27 
 
 		 572 aa  327  4.0000000000000003e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.651563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.58 
 
 		 555 aa  326  6e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1443  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.29 
 
 		 559 aa  326  7e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0306105  hitchhiker  0.00417959 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1877  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.12 
 
 		 636 aa  326  9e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157707 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0153  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  36.3 
 
 		 562 aa  325  1e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08870  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  35.33 
 
 		 620 aa  325  1e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.62 
 
 		 563 aa  325  2e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  34.48 
 
 		 563 aa  325  2e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1547  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.36 
 
 		 569 aa  325  2e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.1 
 
 		 558 aa  324  2e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8059  acetolactate synthase, large subunit  35.25 
 
 		 578 aa  324  3e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.634605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7782  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  35.07 
 
 		 586 aa  324  3e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0611  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  34.7 
 
 		 589 aa  323  6e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.175913  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  36.96 
 
 		 557 aa  323  6e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2122  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  35.51 
 
 		 625 aa  323  6e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.522117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  33.33 
 
 		 587 aa  323  7e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1090  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  34.89 
 
 		 598 aa  322  9.999999999999999e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08850  acetolactate synthase, large subunit  33.79 
 
 		 623 aa  322  9.999999999999999e-87  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.369585  normal  0.232213 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1240  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  36.65 
 
 		 580 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.14 
 
 		 562 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.65 
 
 		 566 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4356  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  35.7 
 
 		 597 aa  321  1.9999999999999998e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0195043  normal  0.165363 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2821  acetolactate synthase large subunit  34.05 
 
 		 581 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3392  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  34.53 
 
 		 585 aa  322  1.9999999999999998e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1906  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  34.66 
 
 		 619 aa  321  3e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365234  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1886  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  34.66 
 
 		 619 aa  321  3e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0490387  normal  0.105007 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>