More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3455 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2548  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain-containing protein  62.33 
 
 
570 aa  717    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271153  normal  0.122041 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2853  glyoxylate carboligase  71.1 
 
 
583 aa  825    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0172907  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4728  glyoxylate carboligase  62.37 
 
 
572 aa  712    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0723  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  60.63 
 
 
571 aa  730    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3455  glyoxylate carboligase  100 
 
 
577 aa  1186    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.13774  normal  0.152002 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3478  glyoxylate carboligase  52.05 
 
 
591 aa  623  1e-177  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3448  glyoxylate carboligase  52.5 
 
 
596 aa  623  1e-177  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3281  glyoxylate carboligase  53.57 
 
 
591 aa  615  1e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.819791  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2612  glyoxylate carboligase  53.46 
 
 
592 aa  617  1e-175  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3291  glyoxylate carboligase  52.33 
 
 
594 aa  614  9.999999999999999e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3151  glyoxylate carboligase  51.7 
 
 
595 aa  614  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1157  glyoxylate carboligase  53.36 
 
 
594 aa  608  1e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2299  glyoxylate carboligase  51.73 
 
 
591 aa  598  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.408845  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2424  glyoxylate carboligase  51.73 
 
 
591 aa  598  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2173  glyoxylate carboligase  51.73 
 
 
591 aa  601  1e-170  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.52322  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1396  glyoxylate carboligase  51.04 
 
 
591 aa  601  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136829  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3087  glyoxylate carboligase  51.04 
 
 
591 aa  598  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1815  glyoxylate carboligase  50.69 
 
 
591 aa  601  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1787  glyoxylate carboligase  50.52 
 
 
591 aa  599  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2259  glyoxylate carboligase  51.56 
 
 
591 aa  598  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.712116  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5178  glyoxylate carboligase  50.69 
 
 
591 aa  598  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.191483  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1299  glyoxylate carboligase  51.04 
 
 
591 aa  597  1e-169  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2367  glyoxylate carboligase  50.35 
 
 
591 aa  596  1e-169  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249792  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6201  glyoxylate carboligase  50.52 
 
 
591 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0309842  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1878  glyoxylate carboligase  50.52 
 
 
591 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232165  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3954  glyoxylate carboligase  50.17 
 
 
597 aa  598  1e-169  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416682  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4297  glyoxylate carboligase  50.17 
 
 
591 aa  591  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0571  glyoxylate carboligase  51.13 
 
 
593 aa  594  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1782  glyoxylate carboligase  50.35 
 
 
591 aa  592  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.538882  normal  0.818313 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1901  glyoxylate carboligase  50.52 
 
 
591 aa  594  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000229041 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1620  glyoxylate carboligase  50.52 
 
 
591 aa  593  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.44538  normal  0.510397 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0625  glyoxylate carboligase  51.13 
 
 
593 aa  594  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.610949  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0564  glyoxylate carboligase  51.13 
 
 
593 aa  594  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0566  glyoxylate carboligase  51.13 
 
 
593 aa  594  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08150  glyoxylate carboligase  51.05 
 
 
603 aa  588  1e-167  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45000  glyoxylate carboligase  50.17 
 
 
591 aa  588  1e-167  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.568226  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0581  glyoxylate carboligase  50.35 
 
 
593 aa  588  1e-167  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3829  glyoxylate carboligase  50.17 
 
 
591 aa  588  1e-167  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00457  glyoxylate carboligase  50.35 
 
 
593 aa  587  1e-166  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.50477  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3105  glyoxylate carboligase  50.35 
 
 
593 aa  587  1e-166  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0441  glyoxylate carboligase  50.35 
 
 
593 aa  588  1e-166  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0206883  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1135  glyoxylate carboligase  50.53 
 
 
596 aa  586  1e-166  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3115  glyoxylate carboligase  50.35 
 
 
593 aa  587  1e-166  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00462  hypothetical protein  50.35 
 
 
593 aa  587  1e-166  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.711449  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3862  glyoxylate carboligase  50.35 
 
 
591 aa  588  1e-166  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.985049  normal  0.531415 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0544  glyoxylate carboligase  50.17 
 
 
593 aa  586  1e-166  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0458  glyoxylate carboligase  49.83 
 
 
594 aa  586  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.258476  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2460  glyoxylate carboligase  50.17 
 
 
591 aa  587  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.583136  normal  0.435829 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1572  glyoxylate carboligase  50 
 
 
591 aa  587  1e-166  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0611133  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2312  glyoxylate carboligase  49.83 
 
 
591 aa  586  1e-166  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.276153  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3622  glyoxylate carboligase  50 
 
 
591 aa  587  1e-166  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0608  glyoxylate carboligase  50.35 
 
 
593 aa  587  1e-166  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0550  glyoxylate carboligase  50.17 
 
 
593 aa  585  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2769  glyoxylate carboligase  49.83 
 
 
591 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.155295  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3691  glyoxylate carboligase  49.23 
 
 
592 aa  585  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0244  glyoxylate carboligase  50.51 
 
 
601 aa  581  1e-164  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4308  glyoxylate carboligase  49.48 
 
 
594 aa  581  1e-164  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0403052 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1598  glyoxylate carboligase  48.96 
 
 
591 aa  580  1e-164  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.035378  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4561  glyoxylate carboligase  50.18 
 
 
598 aa  581  1e-164  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.437986 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2117  glyoxylate carboligase  49.23 
 
 
596 aa  580  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0226819 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3438  glyoxylate carboligase  48.63 
 
 
596 aa  577  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4866  glyoxylate carboligase  45.6 
 
 
579 aa  526  1e-148  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.553307 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43400  glyoxylate carboligase  49.02 
 
 
567 aa  507  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  41.61 
 
 
588 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  39.03 
 
 
557 aa  395  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  39.58 
 
 
587 aa  392  1e-108  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0954  acetolactate synthase catalytic subunit  38.69 
 
 
587 aa  389  1e-107  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1543  acetolactate synthase catalytic subunit  38.1 
 
 
587 aa  384  1e-105  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1674  acetolactate synthase catalytic subunit  38.7 
 
 
587 aa  385  1e-105  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1903  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  39.5 
 
 
563 aa  383  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1175  Acetolactate synthase  38.85 
 
 
591 aa  384  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.112778  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  40.75 
 
 
557 aa  385  1e-105  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  38.66 
 
 
599 aa  382  1e-104  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  37.83 
 
 
563 aa  381  1e-104  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  37.36 
 
 
553 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  38.19 
 
 
566 aa  378  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  38.31 
 
 
552 aa  378  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1443  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  38.73 
 
 
559 aa  376  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0306105  hitchhiker  0.00417959 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0502  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  38.1 
 
 
535 aa  372  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0235829  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0153  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  40.43 
 
 
562 aa  371  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2270  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  38.2 
 
 
576 aa  369  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  37.48 
 
 
554 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  38.19 
 
 
566 aa  370  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0231  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  38.5 
 
 
582 aa  371  1e-101  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329619  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  38.89 
 
 
567 aa  370  1e-101  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0498  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  36.45 
 
 
566 aa  366  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.97 
 
 
569 aa  366  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  40.11 
 
 
563 aa  369  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.47 
 
 
554 aa  364  2e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2558  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  37.61 
 
 
566 aa  364  2e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0505809  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1495  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  37.25 
 
 
566 aa  362  8e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.433241 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  35.66 
 
 
566 aa  362  1e-98  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2168  acetolactate synthase, large subunit  39.35 
 
 
562 aa  362  1e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2714  acetolactate synthase, large subunit  37.11 
 
 
555 aa  362  1e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  38.59 
 
 
562 aa  362  1e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0105  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.9 
 
 
568 aa  361  2e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180923  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1260  acetolactate synthase, large subunit  37.28 
 
 
566 aa  361  2e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00775476  hitchhiker  0.00000116322 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  39.13 
 
 
558 aa  361  2e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1692  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  38.58 
 
 
563 aa  361  2e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0303  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.43 
 
 
559 aa  360  3e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.296158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>