More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_43400 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00457  glyoxylate carboligase  74.81 
 
 		 593 aa  828    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.50477  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3105  glyoxylate carboligase  74.81 
 
 		 593 aa  828    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4297  glyoxylate carboligase  84.91 
 
 		 591 aa  952    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3281  glyoxylate carboligase  75.63 
 
 		 591 aa  807    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.819791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2312  glyoxylate carboligase  88.11 
 
 		 591 aa  983    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.276153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0244  glyoxylate carboligase  72.49 
 
 		 601 aa  780    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3151  glyoxylate carboligase  75.14 
 
 		 595 aa  807    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3438  glyoxylate carboligase  72.8 
 
 		 596 aa  809    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1299  glyoxylate carboligase  81.13 
 
 		 591 aa  903    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3087  glyoxylate carboligase  75.28 
 
 		 591 aa  834    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1396  glyoxylate carboligase  76.79 
 
 		 591 aa  872    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2367  glyoxylate carboligase  72.26 
 
 		 591 aa  783    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3829  glyoxylate carboligase  83.4 
 
 		 591 aa  935    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3291  glyoxylate carboligase  75.33 
 
 		 594 aa  824    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2424  glyoxylate carboligase  77.55 
 
 		 591 aa  874    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3478  glyoxylate carboligase  75.73 
 
 		 591 aa  818    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1598  glyoxylate carboligase  83.02 
 
 		 591 aa  942    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.035378  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5178  glyoxylate carboligase  77.36 
 
 		 591 aa  873    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.191483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3115  glyoxylate carboligase  74.81 
 
 		 593 aa  828    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0458  glyoxylate carboligase  75.71 
 
 		 594 aa  853    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.258476  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1620  glyoxylate carboligase  76.79 
 
 		 591 aa  870    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.44538  normal  0.510397 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2117  glyoxylate carboligase  76.64 
 
 		 596 aa  852    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226819 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1901  glyoxylate carboligase  77.36 
 
 		 591 aa  870    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000229041 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3954  glyoxylate carboligase  76.98 
 
 		 597 aa  844    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416682  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2769  glyoxylate carboligase  87.36 
 
 		 591 aa  974    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.155295  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1782  glyoxylate carboligase  77.17 
 
 		 591 aa  873    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.538882  normal  0.818313 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0625  glyoxylate carboligase  75 
 
 		 593 aa  830    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.610949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2173  glyoxylate carboligase  77.55 
 
 		 591 aa  870    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.52322  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4866  glyoxylate carboligase  72.43 
 
 		 579 aa  785    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.553307 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4561  glyoxylate carboligase  75.34 
 
 		 598 aa  815    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.437986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2460  glyoxylate carboligase  77.17 
 
 		 591 aa  871    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.583136  normal  0.435829 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3862  glyoxylate carboligase  84.53 
 
 		 591 aa  950    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.985049  normal  0.531415 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1572  glyoxylate carboligase  84.91 
 
 		 591 aa  954    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0611133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1157  glyoxylate carboligase  75.42 
 
 		 594 aa  832    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3448  glyoxylate carboligase  74.29 
 
 		 596 aa  819    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2612  glyoxylate carboligase  75.71 
 
 		 592 aa  847    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4308  glyoxylate carboligase  77.02 
 
 		 594 aa  855    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0403052 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6201  glyoxylate carboligase  77.55 
 
 		 591 aa  872    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0309842  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0608  glyoxylate carboligase  74.81 
 
 		 593 aa  828    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08150  glyoxylate carboligase  72.71 
 
 		 603 aa  791    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0544  glyoxylate carboligase  74.62 
 
 		 593 aa  826    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0571  glyoxylate carboligase  75 
 
 		 593 aa  831    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1815  glyoxylate carboligase  77.55 
 
 		 591 aa  873    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45000  glyoxylate carboligase  83.4 
 
 		 591 aa  935    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.568226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0581  glyoxylate carboligase  74.62 
 
 		 593 aa  827    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3691  glyoxylate carboligase  73.35 
 
 		 592 aa  815    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1878  glyoxylate carboligase  77.55 
 
 		 591 aa  872    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232165  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1787  glyoxylate carboligase  77.36 
 
 		 591 aa  872    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2299  glyoxylate carboligase  77.55 
 
 		 591 aa  874    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.408845  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43400  glyoxylate carboligase  100 
 
 		 567 aa  1167    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3622  glyoxylate carboligase  84.53 
 
 		 591 aa  951    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0441  glyoxylate carboligase  74.62 
 
 		 593 aa  827    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0206883  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0564  glyoxylate carboligase  75 
 
 		 593 aa  831    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0550  glyoxylate carboligase  74.43 
 
 		 593 aa  823    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00462  hypothetical protein  74.81 
 
 		 593 aa  828    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.711449  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0566  glyoxylate carboligase  75 
 
 		 593 aa  830    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1135  glyoxylate carboligase  75.24 
 
 		 596 aa  813    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2259  glyoxylate carboligase  77.36 
 
 		 591 aa  873    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.712116  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2548  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain-containing protein  52.4 
 
 		 570 aa  525  1e-148  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271153  normal  0.122041 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2853  glyoxylate carboligase  51.76 
 
 		 583 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0172907  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3455  glyoxylate carboligase  49.02 
 
 		 577 aa  507  9.999999999999999e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.13774  normal  0.152002 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0723  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  51.45 
 
 		 571 aa  501  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4728  glyoxylate carboligase  50.77 
 
 		 572 aa  481  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1175  Acetolactate synthase  34.9 
 
 		 591 aa  311  2e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.112778  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.27 
 
 		 569 aa  296  5e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0105  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.35 
 
 		 568 aa  293  7e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180923  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.73 
 
 		 557 aa  288  2e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  36.81 
 
 		 558 aa  288  2e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  33.85 
 
 		 563 aa  287  4e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  34.35 
 
 		 588 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.72 
 
 		 554 aa  281  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.33 
 
 		 581 aa  281  3e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.73 
 
 		 581 aa  280  4e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1547  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  36.14 
 
 		 569 aa  279  9e-74  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3230  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.86 
 
 		 644 aa  279  1e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10830  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.14 
 
 		 555 aa  277  4e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.54 
 
 		 553 aa  277  4e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1443  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  36.6 
 
 		 559 aa  276  8e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0306105  hitchhiker  0.00417959 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.47 
 
 		 566 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500204  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.33 
 
 		 552 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0498  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.47 
 
 		 566 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2864  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.2 
 
 		 659 aa  274  3e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.887934  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  33 
 
 		 567 aa  274  3e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  31.67 
 
 		 587 aa  274  4.0000000000000004e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  36.24 
 
 		 563 aa  272  1e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4449  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.53 
 
 		 570 aa  271  2e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.49289  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1674  acetolactate synthase catalytic subunit  31.94 
 
 		 587 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0153  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.77 
 
 		 562 aa  270  4e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4073  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.93 
 
 		 623 aa  270  5e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24876  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1557  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.35 
 
 		 581 aa  270  5e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0186  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.84 
 
 		 576 aa  270  5.9999999999999995e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0544  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  33.8 
 
 		 602 aa  269  8e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2596  acetolactate synthase catalytic subunit  34.83 
 
 		 577 aa  269  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.2 
 
 		 554 aa  268  2e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  31.64 
 
 		 599 aa  268  2e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1968  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  38.13 
 
 		 581 aa  268  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.697399  normal  0.245648 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0954  acetolactate synthase catalytic subunit  31.27 
 
 		 587 aa  268  2e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  33.14 
 
 		 557 aa  268  2e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.74 
 
 		 566 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.07 
 
 		 562 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>