More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1911 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1905  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  55.48 
 
 		 585 aa  650    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.239635  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  100 
 
 		 566 aa  1168    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500204  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2158  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  55.58 
 
 		 564 aa  669    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2270  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  55.2 
 
 		 576 aa  654    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2077  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  55.56 
 
 		 585 aa  652    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  56.79 
 
 		 567 aa  650    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  57.14 
 
 		 569 aa  678    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1274  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.42 
 
 		 587 aa  641    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0743  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  54.87 
 
 		 573 aa  646    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.597512 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10830  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  56.51 
 
 		 555 aa  658    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  75.44 
 
 		 566 aa  914    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1903  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  59.93 
 
 		 563 aa  710    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  56.84 
 
 		 558 aa  663    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0736  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  54.5 
 
 		 597 aa  637    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.591869  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0753  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.42 
 
 		 587 aa  642    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1296  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  52.66 
 
 		 563 aa  639    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0892  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  58.87 
 
 		 581 aa  704    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.806334  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1848  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.42 
 
 		 587 aa  642    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1443  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  56.68 
 
 		 559 aa  661    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0306105  hitchhiker  0.00417959 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0947  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  55.73 
 
 		 587 aa  652    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  57.02 
 
 		 588 aa  671    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1991  acetolactate synthase, large subunit  56.34 
 
 		 613 aa  637    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0396  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.42 
 
 		 587 aa  642    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1419  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.42 
 
 		 587 aa  641    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2520  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  54.77 
 
 		 582 aa  645    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2037  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  58.27 
 
 		 564 aa  689    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182642  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  69.5 
 
 		 565 aa  838    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0608  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  54.26 
 
 		 566 aa  659    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1905  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  52.66 
 
 		 573 aa  652    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1692  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  58.98 
 
 		 563 aa  714    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1260  acetolactate synthase, large subunit  87.99 
 
 		 566 aa  1049    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00775476  hitchhiker  0.00000116322 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2168  acetolactate synthase, large subunit  59.61 
 
 		 562 aa  711    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0634  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  54.58 
 
 		 567 aa  652    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.876407  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1782  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  56.66 
 
 		 572 aa  669    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.331882  normal  0.0862821 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  54.79 
 
 		 554 aa  641    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2893  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.75 
 
 		 592 aa  637    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0020584 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0474  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  54.61 
 
 		 585 aa  647    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1165  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  52.46 
 
 		 561 aa  636    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0153  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  60.82 
 
 		 562 aa  729    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1045  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.24 
 
 		 587 aa  639    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.160852  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0745  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  58.87 
 
 		 581 aa  704    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.425404  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1063  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  56.26 
 
 		 595 aa  654    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.722606  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  56.03 
 
 		 563 aa  646    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0231  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  57.88 
 
 		 582 aa  675    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329619  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1328  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.89 
 
 		 587 aa  634    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0958781 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  84.57 
 
 		 566 aa  1017    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2119  acetolactate synthase, large subunit  54.77 
 
 		 568 aa  656    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.712969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0810  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  56.26 
 
 		 595 aa  652    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.845021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  57.12 
 
 		 563 aa  691    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  61.48 
 
 		 562 aa  726    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2773  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  56.59 
 
 		 570 aa  666    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.239005  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1902  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  58.02 
 
 		 566 aa  697    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000354639  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0911  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  55.03 
 
 		 587 aa  646    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1717  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  53.55 
 
 		 566 aa  644    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.589802  normal  0.264845 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1495  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  80.85 
 
 		 566 aa  978    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.433241 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  55.77 
 
 		 552 aa  640    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2168  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  54.26 
 
 		 573 aa  650    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2746  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  81.03 
 
 		 566 aa  984    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2146  acetolactate synthase large subunit  55.71 
 
 		 562 aa  638    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  57.37 
 
 		 557 aa  658    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2982  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  58.19 
 
 		 572 aa  705    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000024883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1662  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  57.35 
 
 		 564 aa  691    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3024  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  58.19 
 
 		 572 aa  705    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000501065  normal  0.146294 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0898  acetolactate synthase, large subunit  61.95 
 
 		 564 aa  739    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1113  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.42 
 
 		 587 aa  642    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0816  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.71 
 
 		 558 aa  653    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2558  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  75.8 
 
 		 566 aa  917    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0505809  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0853  acetolactate synthase, large subunit  53.72 
 
 		 573 aa  649    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.640805  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2228  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  55.48 
 
 		 585 aa  650    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.635342 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1281  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.42 
 
 		 587 aa  641    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0741  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  54.85 
 
 		 573 aa  660    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2401  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  56.44 
 
 		 558 aa  631  1e-179  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1141  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  51.85 
 
 		 565 aa  631  1e-179  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1203  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  53.78 
 
 		 584 aa  628  1e-179  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1013  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.77 
 
 		 587 aa  625  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.458682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3075  acetolactate synthase, large subunit  54.66 
 
 		 566 aa  625  1e-178  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.843153  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  52.91 
 
 		 581 aa  626  1e-178  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5592  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  55.12 
 
 		 587 aa  626  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2181  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.77 
 
 		 587 aa  625  1e-178  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.384106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3617  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  51.6 
 
 		 563 aa  627  1e-178  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000692831  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2303  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.77 
 
 		 587 aa  625  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0833  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  53.82 
 
 		 569 aa  623  1e-177  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.469559  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2343  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  52.02 
 
 		 592 aa  622  1e-177  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0303  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  53.79 
 
 		 559 aa  623  1e-177  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.296158  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2464  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  52.83 
 
 		 585 aa  623  1e-177  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0927747  normal  0.484681 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2288  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.59 
 
 		 587 aa  623  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.925568 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  52.56 
 
 		 581 aa  624  1e-177  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1654  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.59 
 
 		 587 aa  623  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.527675  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_737  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  54 
 
 		 569 aa  624  1e-177  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00716267  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0752  acetolactate synthase, large subunit  53.64 
 
 		 569 aa  624  1e-177  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2265  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.59 
 
 		 587 aa  623  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587428  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  54.26 
 
 		 553 aa  623  1e-177  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3430  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  51.77 
 
 		 574 aa  623  1e-177  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.646845  normal  0.0217288 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1691  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  52.11 
 
 		 570 aa  618  1e-176  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3231  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.42 
 
 		 587 aa  619  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2008  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  51.68 
 
 		 592 aa  618  1e-176  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2666  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  51.68 
 
 		 573 aa  618  1e-176  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000302703  decreased coverage  0.000148215 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1428  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  50.71 
 
 		 564 aa  617  1e-175  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00100174  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1851  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  50.62 
 
 		 573 aa  616  1e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842705  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2022  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.24 
 
 		 585 aa  618  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.721399 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>