More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2401 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  56.44 
 
 
566 aa  659    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500204  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0105  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  55.42 
 
 
568 aa  656    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180923  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0231  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  55.14 
 
 
582 aa  636    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329619  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  54.85 
 
 
566 aa  643    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10830  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  60.43 
 
 
555 aa  704    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2746  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  56.79 
 
 
566 aa  667    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  60.82 
 
 
588 aa  684    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  60.25 
 
 
554 aa  695    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  57.62 
 
 
565 aa  681    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  57.32 
 
 
566 aa  666    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1260  acetolactate synthase, large subunit  56.74 
 
 
566 aa  664    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00775476  hitchhiker  0.00000116322 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2168  acetolactate synthase, large subunit  57.4 
 
 
562 aa  642    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  60.65 
 
 
553 aa  688    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  69.48 
 
 
563 aa  830    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1443  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  74.15 
 
 
559 aa  855    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0306105  hitchhiker  0.00417959 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  59.89 
 
 
569 aa  691    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2401  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  100 
 
 
558 aa  1142    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  60.94 
 
 
563 aa  704    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1495  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  57.14 
 
 
566 aa  675    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.433241 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2037  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  55.16 
 
 
564 aa  640    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182642  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2146  acetolactate synthase large subunit  58.54 
 
 
562 aa  667    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  57.73 
 
 
562 aa  650    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  70.27 
 
 
567 aa  826    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  74.91 
 
 
558 aa  863    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  61.12 
 
 
557 aa  677    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0898  acetolactate synthase, large subunit  56.25 
 
 
564 aa  640    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  55.3 
 
 
557 aa  640    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2558  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  55.5 
 
 
566 aa  644    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0505809  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  61.23 
 
 
552 aa  692    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0153  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  58.26 
 
 
562 aa  661    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1692  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  59.04 
 
 
563 aa  659    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0352  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  61.33 
 
 
556 aa  672    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0139  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  56.51 
 
 
612 aa  633  1e-180  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1903  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  56.25 
 
 
563 aa  632  1e-180  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  56.55 
 
 
555 aa  629  1e-179  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1851  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  55.68 
 
 
573 aa  630  1e-179  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842705  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2843  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  55.73 
 
 
587 aa  629  1e-179  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0752  acetolactate synthase, large subunit  55.81 
 
 
569 aa  630  1e-179  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0833  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  55.1 
 
 
569 aa  625  1e-178  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.469559  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1662  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  55.08 
 
 
564 aa  627  1e-178  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3491  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  55.32 
 
 
571 aa  628  1e-178  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0544  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  56.28 
 
 
602 aa  625  1e-178  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_737  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  55.28 
 
 
569 aa  627  1e-178  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00716267  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1707  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  55.32 
 
 
571 aa  625  1e-178  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1714  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.84 
 
 
570 aa  622  1e-177  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1888  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.84 
 
 
570 aa  622  1e-177  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1691  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  55.02 
 
 
570 aa  623  1e-177  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2757  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  56.34 
 
 
632 aa  623  1e-177  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.928665  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2482  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  57.12 
 
 
561 aa  624  1e-177  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246138  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1850  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.84 
 
 
570 aa  622  1e-177  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0722574  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0855  acetolactate synthase catalytic subunit  54.87 
 
 
578 aa  622  1e-177  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2596  acetolactate synthase catalytic subunit  54.87 
 
 
577 aa  621  1e-177  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4988  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  55.85 
 
 
619 aa  618  1e-176  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2982  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  54.23 
 
 
572 aa  619  1e-176  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000024883  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3024  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  54.23 
 
 
572 aa  619  1e-176  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000501065  normal  0.146294 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1934  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.48 
 
 
571 aa  615  1e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1666  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.48 
 
 
570 aa  616  1e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2256  acetolactate synthase, large subunit  54.07 
 
 
560 aa  617  1e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  54.29 
 
 
557 aa  615  1e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000784156  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2714  acetolactate synthase, large subunit  55.76 
 
 
555 aa  618  1e-175  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2258  acetolactate synthase, large subunit  56.32 
 
 
569 aa  614  9.999999999999999e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1909  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  56.45 
 
 
561 aa  612  9.999999999999999e-175  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000425472  hitchhiker  0.0000717525 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2981  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  55.76 
 
 
556 aa  612  9.999999999999999e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0018312  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3023  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  55.76 
 
 
561 aa  612  9.999999999999999e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000478309  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1966  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.41 
 
 
571 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.107455  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0666  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  54.87 
 
 
552 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1547  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  54.46 
 
 
569 aa  608  1e-173  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4126  acetolactate synthase large subunit  54.93 
 
 
638 aa  608  1e-173  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  52.33 
 
 
554 aa  608  1e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0892  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  53.45 
 
 
581 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.806334  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0745  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  53.45 
 
 
581 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.425404  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0608  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  53.3 
 
 
566 aa  607  9.999999999999999e-173  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1905  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  53.12 
 
 
573 aa  605  9.999999999999999e-173  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3580  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  53.25 
 
 
558 aa  606  9.999999999999999e-173  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0486011  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0741  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  53.3 
 
 
573 aa  605  9.999999999999999e-173  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1203  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  55.36 
 
 
584 aa  605  9.999999999999999e-173  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1877  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  53.98 
 
 
636 aa  605  9.999999999999999e-173  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000157707 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1717  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  52.66 
 
 
566 aa  604  1.0000000000000001e-171  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.589802  normal  0.264845 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2145  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  55.02 
 
 
562 aa  602  1.0000000000000001e-171  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000794715  normal  0.0157817 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2168  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  53.3 
 
 
573 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1063  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  54.42 
 
 
595 aa  603  1.0000000000000001e-171  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.722606  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0853  acetolactate synthase, large subunit  53.01 
 
 
573 aa  604  1.0000000000000001e-171  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.640805  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1335  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  54.51 
 
 
611 aa  598  1e-170  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.558483  normal  0.552773 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0303  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  53.41 
 
 
559 aa  598  1e-170  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.296158  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0902  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.82 
 
 
619 aa  596  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0929  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.8 
 
 
619 aa  597  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4449  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  53.33 
 
 
570 aa  596  1e-169  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.49289  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1902  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  53.12 
 
 
566 aa  598  1e-169  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000354639  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4073  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  52.52 
 
 
623 aa  595  1e-169  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24876  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07681  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  55.16 
 
 
593 aa  597  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0331014 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08850  acetolactate synthase, large subunit  52.14 
 
 
623 aa  593  1e-168  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.369585  normal  0.232213 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2821  acetolactate synthase large subunit  52.36 
 
 
581 aa  588  1e-167  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3617  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  50.97 
 
 
563 aa  591  1e-167  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000692831  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0743  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  53.48 
 
 
573 aa  587  1e-166  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.597512 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0717  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.59 
 
 
574 aa  586  1e-166  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1123  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  52.63 
 
 
629 aa  587  1e-166  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1978  acetolactate synthase, large subunit  52.02 
 
 
568 aa  587  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1900  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  52.02 
 
 
568 aa  587  1e-166  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0706  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  53.08 
 
 
581 aa  588  1e-166  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1985  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  51.85 
 
 
568 aa  585  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>