More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0892 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00079  acetolactate synthase III large subunit  58.38 
 
 
574 aa  710    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3522  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  58.38 
 
 
574 aa  708    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2138  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  58.76 
 
 
572 aa  730    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.803808  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  58.87 
 
 
566 aa  704    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500204  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4680  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  59.44 
 
 
574 aa  720    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0107751 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2270  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  67.38 
 
 
576 aa  825    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2077  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  66.43 
 
 
585 aa  813    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1769  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  66.08 
 
 
598 aa  811    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.712951  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1346  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  56.21 
 
 
584 aa  683    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0313448  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3236  acetolactate synthase III, large subunit, biosynthetic type  57.14 
 
 
575 aa  684    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00702842  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1692  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  57.45 
 
 
563 aa  668    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1389  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  56.38 
 
 
584 aa  685    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0317493  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2279  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  58.23 
 
 
572 aa  720    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0981  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  59.44 
 
 
574 aa  731    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2105  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  66.55 
 
 
591 aa  795    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0907357 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2008  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  55.3 
 
 
592 aa  664    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901977  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1717  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  64.9 
 
 
592 aa  772    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0366089  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1319  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  57.6 
 
 
570 aa  700    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1113  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  65.58 
 
 
587 aa  825    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2833  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  55.83 
 
 
593 aa  654    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1848  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  65.58 
 
 
587 aa  825    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0846  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  59.96 
 
 
574 aa  732    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476393 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0527  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  60.46 
 
 
608 aa  734    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.372461 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3075  acetolactate synthase, large subunit  64.3 
 
 
566 aa  770    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.843153  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0396  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  65.58 
 
 
587 aa  825    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0947  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  66.79 
 
 
587 aa  818    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3401  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  59.68 
 
 
575 aa  721    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1991  acetolactate synthase, large subunit  68.49 
 
 
613 aa  793    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2343  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  56.99 
 
 
592 aa  678    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0882  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  58.76 
 
 
572 aa  732    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.240618  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1419  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  65.58 
 
 
587 aa  822    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2520  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  67.73 
 
 
582 aa  827    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4788  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  58.55 
 
 
574 aa  730    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.092848  hitchhiker  0.00966018 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2637  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.66 
 
 
588 aa  655    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  58.19 
 
 
565 aa  677    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5592  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  65.06 
 
 
587 aa  800    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0608  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  53.56 
 
 
566 aa  641    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1905  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  53.74 
 
 
573 aa  643    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1260  acetolactate synthase, large subunit  58.16 
 
 
566 aa  696    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00775476  hitchhiker  0.00000116322 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2168  acetolactate synthase, large subunit  57.98 
 
 
562 aa  668    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0634  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  65.9 
 
 
567 aa  807    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.876407  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3112  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  65.96 
 
 
601 aa  798    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0197191  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2374  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  58.58 
 
 
572 aa  732    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.343911  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1141  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.46 
 
 
565 aa  637    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2386  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  58.23 
 
 
572 aa  728    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0890713  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0474  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  67.49 
 
 
585 aa  831    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0467  acetolactate synthase, large subunit  56.54 
 
 
586 aa  682    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  58.87 
 
 
566 aa  717    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0609  acetolactate synthase, large subunit  55.71 
 
 
584 aa  636    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0318526  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1045  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  65.23 
 
 
587 aa  822    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.160852  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1063  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  64.31 
 
 
595 aa  801    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.722606  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3345  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  56.08 
 
 
592 aa  664    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615353  normal  0.0219835 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0609  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  59.93 
 
 
599 aa  743    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2059  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  56.89 
 
 
573 aa  713    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1897  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.86 
 
 
588 aa  647    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.195023  normal  0.574809 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3322  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  64.26 
 
 
607 aa  791    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.437675  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2544  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  59.06 
 
 
588 aa  725    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000348617  hitchhiker  0.0000942961 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3255  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  55.63 
 
 
593 aa  654    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2119  acetolactate synthase, large subunit  68.74 
 
 
568 aa  844    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.712969  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2317  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  65.43 
 
 
594 aa  791    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.251422  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3231  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  66.96 
 
 
587 aa  796    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2122  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  57.52 
 
 
572 aa  722    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6087  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  58.2 
 
 
589 aa  666    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2098  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  55.56 
 
 
592 aa  659    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.477274  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0501  acetolactate synthase, large subunit  57.29 
 
 
585 aa  670    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.143294  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2722  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  57.02 
 
 
592 aa  656    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.817808  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0522  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  60.28 
 
 
570 aa  731    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.96739  normal  0.011615 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0911  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  66.79 
 
 
587 aa  817    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0875  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.5 
 
 
583 aa  654    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.840064  normal  0.16884 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1488  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  58.94 
 
 
601 aa  710    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203194  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1654  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  64.72 
 
 
587 aa  798    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.527675  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1281  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  65.58 
 
 
587 aa  822    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0624  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  57.52 
 
 
572 aa  701    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1488  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  57.24 
 
 
600 aa  684    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.181787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0753  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  65.58 
 
 
587 aa  825    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1750  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  58.23 
 
 
572 aa  725    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.524546  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1830  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  58.23 
 
 
572 aa  725    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1628  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  57.35 
 
 
572 aa  717    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4544  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  59.08 
 
 
574 aa  717    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.145283  hitchhiker  0.0000405432 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2303  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  66.61 
 
 
587 aa  798    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62160  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  59.26 
 
 
574 aa  734    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.09482 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1294  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.48 
 
 
588 aa  655    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2265  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  64.72 
 
 
587 aa  798    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587428  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5410  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  59.61 
 
 
574 aa  736    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.350466  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1173  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  55.2 
 
 
584 aa  660    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320111  normal  0.560102 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2982  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  55.07 
 
 
572 aa  672    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000024883  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0624  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  58.2 
 
 
574 aa  699    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.146468 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3024  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  55.07 
 
 
572 aa  672    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000501065  normal  0.146294 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0898  acetolactate synthase, large subunit  65.43 
 
 
564 aa  787    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2269  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  58.23 
 
 
572 aa  725    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1776  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  57.6 
 
 
573 aa  711    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1804  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  56.46 
 
 
607 aa  684    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.516088  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2558  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  58.33 
 
 
566 aa  691    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0505809  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2464  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  57.95 
 
 
585 aa  696    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0927747  normal  0.484681 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2169  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.49 
 
 
575 aa  640    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.649258  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1745  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  66.49 
 
 
593 aa  804    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.569862 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2018  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  57.6 
 
 
573 aa  719    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.801766  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1006  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  59.61 
 
 
574 aa  729    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.850126  hitchhiker  0.0000000000038167 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3430  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  57.52 
 
 
574 aa  736    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.646845  normal  0.0217288 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1274  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  65.58 
 
 
587 aa  822    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>