More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0875 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3351  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  67.81 
 
 		 601 aa  837    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5448  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  69.62 
 
 		 592 aa  849    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404549  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6087  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  69.35 
 
 		 589 aa  816    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2270  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  58.63 
 
 		 576 aa  677    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0745  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  54.5 
 
 		 581 aa  654    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.425404  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1389  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  69.8 
 
 		 584 aa  848    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0317493  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3009  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  69.23 
 
 		 585 aa  847    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.161058 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0892  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  54.5 
 
 		 581 aa  654    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.806334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2280  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  60.11 
 
 		 573 aa  682    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.659832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1346  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  69.63 
 
 		 584 aa  846    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0313448  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2158  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  56.28 
 
 		 564 aa  664    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1779  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  61.58 
 
 		 608 aa  720    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1488  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  68.14 
 
 		 601 aa  838    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2343  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  67.29 
 
 		 592 aa  820    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2520  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  55.03 
 
 		 582 aa  649    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2242  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  69.03 
 
 		 592 aa  803    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316433  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2637  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  82.88 
 
 		 588 aa  1019    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1902  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  54.67 
 
 		 566 aa  640    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000354639  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0609  acetolactate synthase, large subunit  65.31 
 
 		 584 aa  783    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0318526  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2532  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  70.09 
 
 		 596 aa  835    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.630898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2420  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  69.8 
 
 		 586 aa  849    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.438184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2464  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  69.07 
 
 		 585 aa  847    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0927747  normal  0.484681 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0467  acetolactate synthase, large subunit  66.04 
 
 		 586 aa  806    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1173  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  83.05 
 
 		 584 aa  1018    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320111  normal  0.560102 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3345  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  69.03 
 
 		 592 aa  803    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615353  normal  0.0219835 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2261  acetolactate synthase, large subunit  61.99 
 
 		 582 aa  729    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1897  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  84.42 
 
 		 588 aa  1030    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.195023  normal  0.574809 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2833  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  64.73 
 
 		 593 aa  756    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3255  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  68.37 
 
 		 593 aa  785    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5404  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  67.75 
 
 		 591 aa  831    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2791  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  70.09 
 
 		 596 aa  832    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111041  normal  0.823193 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2098  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  68.32 
 
 		 592 aa  795    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.477274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1779  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  82.05 
 
 		 585 aa  1020    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0502039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2722  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  68.54 
 
 		 592 aa  795    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.817808  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1961  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  59.49 
 
 		 568 aa  664    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0875  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  100 
 
 		 583 aa  1208    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.840064  normal  0.16884 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1470  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  63.64 
 
 		 581 aa  752    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.560122 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1804  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  69.03 
 
 		 607 aa  842    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.516088  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1488  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  70.97 
 
 		 600 aa  850    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.181787  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0239  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  70.14 
 
 		 592 aa  828    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0133436 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5323  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  68.26 
 
 		 591 aa  840    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.196754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5349  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  67.58 
 
 		 591 aa  835    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1294  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  82.71 
 
 		 588 aa  1018    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1782  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  55.85 
 
 		 572 aa  650    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.331882  normal  0.0862821 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0898  acetolactate synthase, large subunit  54.87 
 
 		 564 aa  647    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2802  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  69.15 
 
 		 585 aa  832    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34708  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2008  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  69.56 
 
 		 592 aa  839    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2169  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  80.7 
 
 		 575 aa  979    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.649258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4864  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  67.58 
 
 		 591 aa  837    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0474  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  54.13 
 
 		 585 aa  631  1e-180  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0911  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  55.87 
 
 		 587 aa  633  1e-180  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0947  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  55.44 
 
 		 587 aa  629  1e-179  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2773  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  54.12 
 
 		 570 aa  628  1e-179  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.239005  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0634  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  53.87 
 
 		 567 aa  627  1e-178  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.876407  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2077  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.91 
 
 		 585 aa  623  1e-177  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1905  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.91 
 
 		 585 aa  621  1e-177  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.239635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2228  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.91 
 
 		 585 aa  622  1e-177  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.635342 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2048  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  52.47 
 
 		 596 aa  618  1e-176  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2893  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.51 
 
 		 592 aa  620  1e-176  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0020584 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1848  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.09 
 
 		 587 aa  616  1e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0396  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.09 
 
 		 587 aa  616  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0753  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.09 
 
 		 587 aa  616  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1113  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.09 
 
 		 587 aa  616  1e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1281  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.09 
 
 		 587 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1419  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.09 
 
 		 587 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1045  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.44 
 
 		 587 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.160852  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2119  acetolactate synthase, large subunit  52.03 
 
 		 568 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.712969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1274  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.09 
 
 		 587 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2317  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.23 
 
 		 594 aa  611  1e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.251422  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1063  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  53.59 
 
 		 595 aa  608  1e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.722606  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1328  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.62 
 
 		 587 aa  609  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0958781 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1745  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  52.53 
 
 		 593 aa  610  1e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.569862 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1769  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  51.83 
 
 		 598 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.712951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1953  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  51.83 
 
 		 598 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1260  acetolactate synthase, large subunit  51.41 
 
 		 566 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00775476  hitchhiker  0.00000116322 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3112  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  51.66 
 
 		 601 aa  601  1.0000000000000001e-171  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0197191  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3322  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.32 
 
 		 607 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.437675  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0810  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  53.25 
 
 		 595 aa  602  1.0000000000000001e-171  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.845021  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  51.23 
 
 		 566 aa  601  1e-170  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500204  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  51.05 
 
 		 566 aa  598  1e-170  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1495  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  50.7 
 
 		 566 aa  599  1e-170  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.433241 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2746  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  50.53 
 
 		 566 aa  597  1e-169  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4867  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  51.66 
 
 		 593 aa  595  1e-169  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1013  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.62 
 
 		 587 aa  597  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.458682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2105  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.16 
 
 		 591 aa  596  1e-169  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0907357 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  52.12 
 
 		 562 aa  595  1e-169  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2288  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.26 
 
 		 587 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.925568 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1903  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  52.3 
 
 		 563 aa  592  1e-168  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3075  acetolactate synthase, large subunit  53 
 
 		 566 aa  593  1e-168  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.843153  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1991  acetolactate synthase, large subunit  54.83 
 
 		 613 aa  592  1e-168  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2022  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.62 
 
 		 585 aa  594  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.721399 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5592  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.26 
 
 		 587 aa  592  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2037  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  52.29 
 
 		 564 aa  593  1e-168  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182642  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3231  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.79 
 
 		 587 aa  594  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1654  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.26 
 
 		 587 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.527675  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2265  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.26 
 
 		 587 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587428  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0882  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  50.88 
 
 		 572 aa  592  1e-168  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.240618  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1717  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.05 
 
 		 592 aa  590  1e-167  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0366089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2303  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  52.73 
 
 		 587 aa  589  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2558  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  50.88 
 
 		 566 aa  591  1e-167  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0505809  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>